New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 4290853 | 43 (0.750) | 4 (0.070) | 4/324 | NT | 8.9% | coding (1734/3468 nt) | PP_3761 | Sensor histidine kinase/response regulator |
? | AE015451 | = 4290920 | 41 (0.750) | coding (1667/3468 nt) | PP_3761 | Sensor histidine kinase/response regulator |
GCCTGGAAGCTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCTTGGCCAGGATCAGCGAGCTGTTGAGCGGCGTGCGCAGCTCATGGGACATGTTGGCGAGGAATTCG > AE015451/4290686‑4291123 | gCCTGGAAGCTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCaa > 2:1006867/1‑235 (MQ=255) cTGGAAGCTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAgct > 1:675731‑M2/1‑233 (MQ=255) cTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAgcttgccgg > 1:1006870‑M2/1‑226 (MQ=255) cGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTc > 1:880113/1‑235 (MQ=255) gTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGa > 1:736520/1‑236 (MQ=255) tGCTGGCCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTg < 1:346525/236‑1 (MQ=255) tCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGc < 1:53014/221‑1 (MQ=255) ggCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTTGGGCCGTACTTCAAgcttgcc > 2:441059‑M2/1‑185 (MQ=255) acaacaGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCg > 1:791854/1‑236 (MQ=255) gTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGGTATCGCGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTgccg > 1:940977/1‑235 (MQ=255) ggATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTa > 1:636484/1‑235 (MQ=255) gCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCga < 2:1004345/186‑1 (MQ=255) gCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCga > 1:1004348/1‑186 (MQ=255) ccAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCg > 1:923768/1‑236 (MQ=255) ccAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGGGGTTTCGGGCCGTACTTCAAgcttgcccg < 1:140537‑M2/162‑10 (MQ=255) tGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAAtgttgt < 2:577374/184‑1 (MQ=255) cggtcggtGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACCTGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTCTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCgaga > 2:41938/1‑174 (MQ=255) cggtcggtGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAgctt < 2:1046296‑M2/146‑5 (MQ=255) cggtcggtGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCCGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATg > 1:323231/1‑219 (MQ=255) ggtcggtGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTg < 2:923765/233‑1 (MQ=255) gtcggtGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCt < 1:831593/236‑1 (MQ=255) tGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGAcc > 1:783062/1‑230 (MQ=255) aGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGGTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCgg > 2:131969/1‑159 (MQ=255) tGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGGGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCgag > 1:158090/1‑157 (MQ=255) ccGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAgcttgccggtcacaaggggctggccttcgaggtcaa > 1:749124‑M2/1‑123 (MQ=255) ccGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTg > 1:814032/1‑164 (MQ=255) tACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCACCTTGTGACCGGCAGGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCt < 2:8206/137‑1 (MQ=255) cTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGtt > 2:848816/1‑234 (MQ=255) tCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAgct < 2:855875‑M2/100‑4 (MQ=255) tCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAgct > 1:855878‑M2/1‑97 (MQ=255) aaGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAgcttgccggtcacaaggggctggccttcgaggtcaaggtcgagccgcaggtaccggt > 1:532255‑M2/1‑94 (MQ=255) ggCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTgccggcc > 2:802885/1‑160 (MQ=255) gCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGTATGTCGTTGCTCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGTCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGtt > 1:214269/1‑199 (MQ=255) ccccTCGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCtt < 1:118195/225‑1 (MQ=255) cccTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCTTGGCCAGGATCa < 1:848819/235‑1 (MQ=255) gtgACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCTTGGCCAGGATCAGCgctg > 1:534115/1‑233 (MQ=255) gACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGACTGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGGTTTCTGcc > 2:1050977/1‑209 (MQ=255) gACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCgg > 2:695241/1‑162 (MQ=255) gCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCTTGGCCAGGATCAGCGAGCTGTTGa > 1:881281/1‑235 (MQ=255) cAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCTTGGCCAGGATCAGCGAGCTGTTg > 2:941431/1‑233 (MQ=255) aGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGc > 2:397306/1‑207 (MQ=255) gCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCTTGGCCAGGATCAGCGAGCTGTTGAgcgg > 1:757631/1‑235 (MQ=255) ggCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCTTGGCCAGGATCAGCGAGCTGTTGAGCGGCGt < 1:941434/236‑1 (MQ=255) gCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCga < 2:56405/96‑1 (MQ=255) tGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCtt < 2:534112/196‑1 (MQ=255) gcgcAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCt > 2:895733/1‑159 (MQ=255) aaGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAgcttgccggtcacaaggggctggccttcgaggtcaaggtcgagccgcaggtaccggtcacgctgttcaccgaccgtcagcgcctgga > 2:1086821‑M2/1‑49 (MQ=255) aaGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAgcttgccggtcacaaggggctggccttcgaggtcaaggtcgagccgcaggtaccggtcacgctgttcaccgaccgtcagcgcctgga < 1:1086824‑M2/136‑88 (MQ=255) gACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCTTGGCCAGGATCAGCGAGCTGTTGAGCGGCGTGCGCAGCTCATGGGACATGTTgg < 2:736517/233‑1 (MQ=255) cGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCTTGGCCAGGATCAGCGAGCTGTTGAGCGGCGTGCGCAGCTCATGGGACATGTTGGCGAGGAATTCg < 2:587496/233‑1 (MQ=255) cggtTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGCCCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCTGCGTTTTCTGCCAACCGCTTGGCCAGGATCCGctg > 1:208138/2‑173 (MQ=255) tttCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGCGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCTTGGCCAGGATCAGCGAGCTGTTGAGCGGCGt < 1:840749/187‑1 (MQ=255) gggCCGTAGTTCAAGCTTGCCCGCTTCGAACTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGAGCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGAGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAAGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCaa < 2:1020635/147‑1 (MQ=255) cTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCTTGGCCAGGATCAGCGAGCTGTTGAGCGGCGTGCGCAGCTCATGGGACATGTTGGCGAGGa < 1:678794/204‑1 (MQ=255) | GCCTGGAAGCTGACGTTCATGCTGACCTGGCCACGCTCGGTGAACTTGATGGCGTTGGACAACAGGTTCTTGAGGATCTGCTCCAGGCGCTGACGGTCGGTGAACAGCGTGACCGGTACCTGCGGCTCGACCTTGACCTCGAAGGCCAGCCCCTTGTGACCGGCAAGCGGCTGGAACATGCCGCGCAAGCCTTCGACCAGGCGCTCGACCTGGGTGGTTTCGGGCCGTACTTCAAGCTTGCCGGCCTCGACCTTGGCGATATCGAGAATGTCGTTGATCAGGTTGAGCAGATCGTTGCCGGCCGAGTAGATGGATTCGGCGAACTTGACCTGCTCCTCGCTGAGGTTGCCTTCAGCGTTTTCTGCCAACAGCTTGGCCAGGATCAGCGAGCTGTTGAGCGGCGTGCGCAGCTCATGGGACATGTTGGCGAGGAATTCG > AE015451/4290686‑4291123 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |