New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 5101071 | 42 (0.730) | 4 (0.070) | 4/334 | NT | 8.9% | coding (556/1560 nt) | phhR | sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
? | AE015451 | = 5101092 | 41 (0.730) | coding (535/1560 nt) | phhR | sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
TGAGCGCCATCAGCGGCGACTGCCCACGCGGGCTGGCCAGGTGGCAGGCACGCGCCAGCAACTCCTTGCCGGTTCCGGTTTCGCCCTCGATCAGCAACGGTGCATCCAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATCGAAGTCTTCTACGTAGCGCGCCAGCGGCATGCCCGGCACCTCATCAACCCGCACGCCAAGCAACTGCGCGGCTGCACGG > AE015451/5100840‑5101303 | tGAGCGCCATCAGCGGCGACTGCCCACGCGGGCTGGCCAGGTGGCAGGCACGCGCCAGCAACTCCTTGCCGGTTCCGGTTTCGCCCTCGATCAGCAACGGTGCATCCAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACgg < 1:676233/236‑1 (MQ=255) gcggcgACTGCCCACGCGGGCTGGCCAGGTGGCAGGCACGCGCCAGCAACTCCTTGCCGGTTCCGGTTTCGCCCTCGATCAGCAACGGTGCATCCAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGC > 1:494425‑M1/1‑220 (MQ=255) gCCCACGCGGGCTGGCCAGGTGGCAGGCACGCGCCAGCAACTCCTTGCCGGTTCCGGTTTCGCCCTCGATCAGCAACGGTGCATCCAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCgccg < 1:910458‑M2/236‑5 (MQ=255) cgcgGGCTGGCCAGGTGGCAGGCACGCGCCAGCAACTCCTTGCCGGTTCCGGTTTCGCCCTCGATCAGCAACGGTGCATCCAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACgg < 2:754619/210‑1 (MQ=255) cgcgGGCTGGCCAGGTGGCAGGCACGCGCCAGCAACTCCTTGCCGGTTCCGGTTTCGCCCTCGATCAGCAACGGTGCATCCAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTaa < 1:484248/220‑1 (MQ=255) gCTGGCCAGGTGGCAGGCACGCGCCAGCAACTCCTTGCCGGTTCCGGTTTCGCCCTCGATCAGCAACGGTGCATCCAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACgg < 2:811947/205‑1 (MQ=255) ggTGGCAGGCACGCGCCAGCAACTCCTTGCCGGTTCCGGTTTCGCCCTCGATCAGCAACGGTGCATCCAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGt < 1:941230/234‑1 (MQ=255) gcaCGCGCCAGCAACTCCTTGCCGGTTCCGGTTTCGCCCTCGATCAGCAACGGTGCATCCAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAgcg < 2:696786/217‑1 (MQ=255) caCGCGCCAGCAACTCCTTGCCGGTTCCGGTTTCGCCCTCGATCAGCAACGGTGCATCCAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCAc > 2:858768/1‑202 (MQ=255) gcCAGCAACTCCTTGCCGGTTCCGGTTTCGCCCTCGATCAGCAACGGTGCATCCAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCg > 1:994562/1‑216 (MQ=255) gcCAGCAACTCCTTGCCGGTTCCGGTTTCGCCCTCGATCAGCAACGGTGCATCCAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTg < 1:750733/236‑1 (MQ=255) gcCAGCAACTCCGTGCCGGTTCCGGTTTCGCCCTCGATCAGCAACGGTGCATCCAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTg < 1:139871/236‑1 (MQ=255) cTTGCCGGTTCCGGTTTCGCCCTCGATCAGCAACGGTGCATCCAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCgccggccggatcggcgagcgtatctacaatgtgcgc > 1:501617‑M2/1‑189 (MQ=255) ccggttccggttTCGCCCTCGATCAGCAACGGTGCATCCAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCAt > 2:419788/1‑208 (MQ=255) cggttccggttTCGCCCTCGATCAGCAACGGTGCATCCAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCg < 1:683166/225‑1 (MQ=255) ggTGCATCCAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACgg < 2:614101/138‑1 (MQ=255) ccAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCgg < 1:313481/153‑1 (MQ=255) cATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGCTGCGCAAGCCGTTGATgc > 1:270954/1‑236 (MQ=255) cgccgcGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAacac < 2:776800/197‑1 (MQ=255) cgcgCTTCACGCTCCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCgccgaccggatcg > 1:255014‑M2/1‑131 (MQ=255) gcTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGT‑AGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACttgttg < 1:365976/236‑1 (MQ=255) ttCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTgg > 1:432521/1‑236 (MQ=255) cgcGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATgcg < 1:851965/221‑1 (MQ=255) gCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCgccgaccggatcggcgagcgtatctacaatgtgcgcaagcaagagctgcgtggcttcgac > 1:462206‑M2/1‑121 (MQ=255) cacGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGccc < 1:20133/230‑1 (MQ=255) cGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCaa > 1:1058795/1‑235 (MQ=255) ggCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGc > 2:284032/1‑120 (MQ=255) gCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCgcggtgcttaccctgcaccgtgccgaccggatcggcgagcgtatctacaatgtgcgcaggc > 1:1015878‑M1/1‑92 (MQ=255) gCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACt < 1:591331/214‑1 (MQ=255) ccGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATCGa > 1:579738/1‑236 (MQ=255) gTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCgcggtgcttaccctgcaccgtgccgaccggatcggcgagcgtatctacaatgtgcgcaagcaagagctgcgtggcttcgacagcatcttccagagctcgcgggtgatggctgccgtggtgc > 1:462206‑M1/1‑60 (MQ=255) cACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATCGAAGTCTTCTACGTAGCGCGCCAGCGGCAt < 1:602481/235‑1 (MQ=255) cAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCg > 2:90735/1‑194 (MQ=255) gCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACgg > 2:118355/1‑50 (MQ=255) gCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATCGAAGTCTTCTACGTAgcgcg > 2:998981/1‑219 (MQ=255) gcctgcGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCgccgaccggatcggcgagcgtatctacaatgtgcgcaagcaagagctgcgtggcttcgacagcatcttccagagctcgcgggtgatggctgc > 1:1015878‑M2/1‑61 (MQ=255) gcgcACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACgg > 1:877355/1‑40 (MQ=255) gcgcACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACgg < 2:877352/40‑1 (MQ=255) gcgcACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGCCGGCgcggtgcttaccctgcaccgtgccgaccggatcggcgagcgtatctacaatgtgcgcaagcaagagctgcgtggcttcgacagcatcttccagagctcgcgggtgatggctgccgtggtgcgtgaagcgcggcgcatggcgccgctggatgcaccgttgctgatcgagggcgaaaccggaaccggcaag > 1:501617‑M1/1‑36 (MQ=255) gcACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATCGAAGTCTTCTACGTAGCGCGCCAGCGGCATGCCCGGCACCTCATCaa < 2:910455/234‑1 (MQ=255) acaTTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCCGAAACACAGCACctttga > 2:144732/1‑127 (MQ=255) tAGATCCGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGcc < 1:280072/159‑1 (MQ=255) gATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATCGAAGTCTTCTACGTAGCGCGCCAGCGGCATGCCCGGCACCTCATCAAc < 1:800198/225‑1 (MQ=255) gCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATCGAAGTCTTCTACGTAGCGCGCCAGCGGCATGCCCg < 1:90737/207‑1 (MQ=255) tCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATg > 2:17239/1‑135 (MQ=255) tCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGATTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATCGAAGTCTTCTACGTAGCGCGCCAGCGGCATGCCCGGCACCTCATCAACCCGCACGCCAAGCAACtc > 1:617674/1‑235 (MQ=255) tCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGaa > 2:434087/1‑166 (MQ=255) tCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATCGAAGTCTTCTACGTAGCGCGCCAGCGGCATGCCCGGCACCTCATCAACCCGCACGCCAAGCaa > 1:473449/1‑233 (MQ=255) tCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATCGAAGTCTTCTACGTAGCGCGCCAGCGGCATGCCCGGCACCTCATCAACCCGCACGCCAAGCAAc > 1:848308/1‑234 (MQ=255) tCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCCCGCCGGCCCGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCTGTGCGATATCGGCCAGAAACACATTACcttt > 2:971613/1‑110 (MQ=255) gCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATCGAAGTCTTCTACGTaac > 2:295238/1‑183 (MQ=255) cgctCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAGGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATc < 1:812130/163‑1 (MQ=255) cGATCCGGTCGGCgcggtgcttaccctgcaccgtgccgaccggatcggcgagcgtatctacaatgtgcgcaagcaagagctgcgtggcttcgacagcatcttccagagctcgcgggtgatggctgccgtggagcgtgaagcgcg > 1:255014‑M1/1‑13 (MQ=255) cGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATCGAAGTCTTCTACGTAgcgcgc > 1:413562/1‑187 (MQ=255) cGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATCGAAGTCTTCTACGTAGCGCGCCAGCGGCATGCCCGGCACCTCATCAACCCGCACGCCAAGCAACTgcgcc > 1:112468/1‑235 (MQ=255) cGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATCGAAGTCTTCTACGTAGCGCGCCAGCGGCATGCCCGGCACCTCATCAACCCGCACGCCAAGCAACTgc > 1:963038/1‑233 (MQ=255) aTCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATc < 2:219964/164‑1 (MQ=255) ctggTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATCGAAGTCTTCTACGTAGCGCGCCAGCGGCATGCCCGGCACCTCATCAACCCGCACGCCAAGCAACTGCGCGGCTg > 1:1004255/3‑236 (MQ=255) cGGGCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCCCCTTTGCCTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATCGAAGTCTTCTACGTAgcgcgc < 2:169525/182‑1 (MQ=255) cGGCgcggtgcttaccctgcaccgtgccgaccggatcggcgagcgtatctacaatgtgcgcaagcaagagctgcgtggcttcgacagcatcttccagagctcgcgggtgatggctgccgtggtgcgtgaagcgcggcgcatggcgccgctggatgcaccgttgctgatcgagggcgaaaccggaaccggcaaggagttgctggcgcgtgcctgccacctggccagcccgcgtgggc < 1:910458‑M1/236‑233 (MQ=255) | TGAGCGCCATCAGCGGCGACTGCCCACGCGGGCTGGCCAGGTGGCAGGCACGCGCCAGCAACTCCTTGCCGGTTCCGGTTTCGCCCTCGATCAGCAACGGTGCATCCAGCGGCGCCATGCGCCGCGCTTCACGCACCACGGCAGCCATCACCCGCGAGCTCTGGAAGATGCTGTCGAAGCCACGCAGCTCTTGCTTGCGCACATTGTAGATACGCTCGCCGATCCGGTCGGCACGGTGCAGGGTAAGCACCGCGCCGGCCAGCGCCTCGCTGTCATCGTGTTCGGACTGCAGCGGTGCGATATCGGCCAGAAACACATCACCTTTGACTTTGATGCGCAAGCCGTTGATGCGCGACTTGTTGGCCCGCACCAACTCCGGAAGATCGAAGTCTTCTACGTAGCGCGCCAGCGGCATGCCCGGCACCTCATCAACCCGCACGCCAAGCAACTGCGCGGCTGCACGG > AE015451/5100840‑5101303 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |