New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 5209984 = | 73 (1.270) | 3 (0.050) | 3/326 | NT | 3.9% | coding (151/1134 nt) | rnd | Ribonuclease D |
? | AE015451 | 5210058 = | 79 (1.440) | coding (77/1134 nt) | rnd | Ribonuclease D | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CAGCACTTCCTGCACCAGGCGCGAATAGCCCATCGAGAAGCCCAGGTTCAGGTAACCGGCGGCCAGCTGAGTGTCGAACAGCGGCTGAGGCAGCTTGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCA > AE015451/5209751‑5210218 | cAGCACTTCCTGCACCAGGCGCGAATAGCCCATCGAGAAGCCCAGGTTCAGGTAACCGGCGGCCAGCTGAGTGTCGAACAGCGGCTGAGGCAGCTTGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGt < 1:963814/236‑1 (MQ=255) cAGCACTTCCTGCACCAGGCGCGAATAGCCCATCGAGAAGCCCAGGTTCAGGTAACCGGCGGCCAGCTGAGTGTCGAACAGCGGCTGAGGCAGCTTGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGt < 1:561234/236‑1 (MQ=255) aCTTCCTGCACCAGGCGCGAATAGCCCATCGAGAAGCCCAGGTTCAGGTAACCGGCGGCCAGCTGAGTGTCGAACAGCGGCTGAGGCAGCTTGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGcc > 1:459784/1‑236 (MQ=255) aGGCGCGAATAGCCCATCGAGAAGCCCAGGTTCAGGTAACCGGCGGCCAGCTGAGTGTCGAACAGCGGCTGAGGCAGCTTGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAg > 1:692754/1‑236 (MQ=255) cgcgAATAGCCCATCGAGAAGCCCAGGTTCAGGTAACCGGCGGCCAGCTGAGTGTCGAACAGCGGCTGAGGCAGCTTGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGccc > 1:218239/1‑236 (MQ=255) cgcgAATAGCCCATCGAGAAGCCCAGGTTCAGGTAACCGGCGGCCAGCTGAGTGTCGAACAGCGGCTGAGGCAGCTTGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGcc > 1:489237/1‑235 (MQ=255) gcgAATAGCCCATCGAGAAGCCCAGGTTCAGGTAACCGGCGGCCAGCTGAGTGTCGAACAGCGGCTGAGGCAGCTTGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCg > 1:53518/1‑236 (MQ=255) aaTAGCCCATCGAGAAGCCCAGGTTCAGGTAACCGGCGGCCAGCTGAGTGTCGAACAGCGGCTGAGGCAGCTTGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGc < 1:380560/235‑1 (MQ=255) 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agaAGCCCAGGTTCAGGTAACCGGCGGCCAGCTGAGTGTCGAACAGCGGCTGAGGCAGCTTGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAg > 1:479531/1‑236 (MQ=255) agaAGCCCAGGTTCAGGTAACCGGCGGCCAGCTGAGTGTCGAACAGCGGCTGAGGCAGCTTGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAg > 1:963366/1‑236 (MQ=255) ttgccttcattcgcgggcgcgcccgctcccacagggtggactgcccccgaaaagcgggacagtttcacccgcagtgcccgcgccgtatatactgcgcgccaatgttagtgggagagccttgtggccatcgaaattcactggatccgtgacgaccagagcctggccgaacactgccgcgactggcaccaactgcccttCGTCGcc < 2:517124‑M1/7‑1 (MQ=255) gCCCAGGTTCAGGTAACCGGCGGCCAGCTGAGTGTCGAACAGCGGCTGAGGCAGCTTGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGgtgt < 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tGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCt < 1:708804/182‑1 (MQ=255) ccGGTCAGGCGCGTCAGCACTTCGAGGGCTTCGCTGCAGGCGGGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGGCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGt < 2:310571/139‑1 (MQ=255) ggTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCa > 2:547842/1‑234 (MQ=255) aGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTc < 1:465897/236‑1 (MQ=255) 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ggTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGgcg < 1:1061964/235‑1 (MQ=255) ggTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGgcg < 1:1066593/235‑1 (MQ=255) ggatccgtgacgaccagagcctggccgaacactgccgcgactggcaccaactgcccttCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAcgggg < 2:605109‑M1/80‑2 (MQ=255) cGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCGCGGCTTCCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGcgac > 2:1061010/1‑130 (MQ=255) cGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGa > 2:611522/1‑194 (MQ=255) cGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGc < 2:31780/213‑1 (MQ=255) cGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGc > 1:31781/1‑213 (MQ=255) cGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGGCGCGCa > 1:747975/1‑236 (MQ=255) cGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGGCGCGCa > 1:1077883/1‑236 (MQ=255) cGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGAGCCAGTCGCGGCAGGGTTAGGc > 2:121160/1‑166 (MQ=255) gCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTgg < 2:692751/228‑1 (MQ=255) gCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGGCGCGCAg > 1:725314/1‑235 (MQ=255) gCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGGAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGGGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTGCGGGCAgg > 2:128136/1‑168 (MQ=255) ccAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGGTCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTcg < 2:550018/149‑1 (MQ=255) aaGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATc > 1:810170/1‑183 (MQ=255) aaGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGgcg < 1:1049283/227‑1 (MQ=255) aGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGGCGCGCAGtatat < 1:415226/236‑1 (MQ=255) tccAGTTGCCGAGCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTgg < 1:332765/217‑1 (MQ=255) ccAGTTGCCGCTCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGctct < 1:897135/161‑1 (MQ=255) cAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGACGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGGCGCGCAGTATATACGgc < 1:111431/233‑1 (MQ=255) 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1:960583/178‑1 (MQ=255) aTCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGCCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTgg < 2:963363/192‑1 (MQ=255) ctggcaccaactgcccttCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGGCGCGCCGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAAc < 1:149762‑M1/210‑1 (MQ=255) aGGACGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGGCGCGCAGTATATAc < 1:263543/203‑1 (MQ=255) gAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTc < 2:91200/156‑1 (MQ=255) 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ccGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCa > 1:543070/1‑236 (MQ=255) | CAGCACTTCCTGCACCAGGCGCGAATAGCCCATCGAGAAGCCCAGGTTCAGGTAACCGGCGGCCAGCTGAGTGTCGAACAGCGGCTGAGGCAGCTTGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCA > AE015451/5209751‑5210218 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |