New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AE015451 | 5209984 = | 73 (1.270) | 3 (0.050) | 3/326 | NT | 3.9% | coding (151/1134 nt) | rnd | Ribonuclease D |
? | AE015451 | 5210058 = | 79 (1.440) | coding (77/1134 nt) | rnd | Ribonuclease D | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
AGCGGCTGAGGCAGCTTGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGG > AE015451/5209830‑5210271 | aGCGGCTGAGGCAGCTTGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAg > 1:1013247/1‑236 (MQ=255) cTGAGGCAGCTTGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCAGGAATTCGGTGTCGACGGCGACGaa > 1:865430/1‑225 (MQ=255) gCTTGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAg < 2:974612/233‑1 (MQ=255) ttGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTGGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTg < 1:281596/224‑1 (MQ=255) gtttcacccgcagtgcccgcgccgtatatacggcgcgccaatgttagtgggagagccttgtggccatcgaaattcactggatccgtgacgaccagagcctggccgaacactgccgcgactggcaccaactgcccttcgtcgccgtcgacaccgaattcatgcgggtagacaccttttacccgaaagccgggctgatccagatcggcgacgAAGGGCAGTTGGTGCCAg < 1:149762‑M2/18‑1 (MQ=255) ggTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCa > 2:547842/1‑234 (MQ=255) aGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTc < 1:465897/236‑1 (MQ=255) aCTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCGTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTc < 1:976146/224‑1 (MQ=255) tCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGgtc > 1:83397/1‑236 (MQ=255) ggTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGgtcgtc > 1:794944/1‑235 (MQ=255) ttCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAgt < 2:459781/209‑1 (MQ=255) gcagcaCCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTc < 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2:754946/1‑187 (MQ=255) gATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGGCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCgg < 1:904501/236‑1 (MQ=255) aGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGgcgc < 1:786872/236‑1 (MQ=255) cGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCa > 1:972523/1‑209 (MQ=255) ggCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAAGTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCa < 1:129653/208‑1 (MQ=255) ttCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCcgc > 2:949900/1‑233 (MQ=255) ttCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGa > 1:485102/1‑235 (MQ=255) gcGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTg < 1:267961/144‑1 (MQ=255) cGGGTTAAAGGTGTCTACCCGCCTGTATTCGGTGTCGACGGCGCCGAAGGGCAGGTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGc < 2:546945/128‑1 (MQ=255) 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AGCGGCTGAGGCAGCTTGCCGGTCAGGCGCAGCAGCACTTCGAGGTCTTCGCTGCAGGCGTGCAGCACCTTGACCACAGCGCTGTCTTCCAGCAGGTCGGCCAAGGGTTGCCAGTTGCCGATCAGCAGCGGGTCGATCAGGAAGGCGCGTTGGCCGTCGCCGATCTGGATCAGCCCGGCTTTCGGGTAAAAGGTGTCTACCCGCATGAATTCGGTGTCGACGGCGACGAAGGGCAGTTGGTGCCAGTCGCGGCAGTGTTCGGCCAGGCTCTGGTCGTCACGGATCCAGTGAATTTCGATGGCCACAAGGCTCTCCCACTAACATTGGCGCGCAGTATATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGG > AE015451/5209830‑5210271 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |