New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 818587 = | 64 (1.110) | 5 (0.090) | 5/330 | NT | 7.5% | coding (89/516 nt) | PP_0704 | RNA polymerase sigma‑70 factor, ECF subfamily |
? | AE015451 | 818605 = | 61 (1.100) | coding (71/516 nt) | PP_0704 | RNA polymerase sigma‑70 factor, ECF subfamily |
TCGCTGGGCACTTCTGCTTCGGGCAGGTGAGCCAGGCCCTCCTGGTAGGCCCGCTCCAGCGCGCGGCGGCGGAACTGGTCGATCATCAAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCATGCCAAAGATTAGCTGCGCAAGAACCGGCGTTTGCCCGATGAACGGCTGCGCTAAGCTGGACCTGCAATCGACTTGAT > AE015451/818377‑818837 | tCGCTGGGCACTTCTGCTTCGGGCAGGTGAGCCAGGCCCTCCTGGTAGGCCCGCTCCAGCGCGCGGCGGCGGAACTGGTCGATCATCAAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAAcc < 1:550598/235‑1 (MQ=255) agcgcagccgttcatcgggcaaacgccggttcttgcgcagctaatctttggcatgccattgctccgcgctatcttccccgcatagaattgagaactattcacaatcgcacacatcactggactgggccttctctacgatgcagatcaacgacacgctcaagcccaccgaggtcgctctgctctaccagtctcaccatacctggttgcgcggctggttacgcagccgGGCAACCa < 1:754648‑M2/8‑1 (MQ=255) cTGGGCACTTCTGCTTCGGGCAGGTGAGCCAGGCCCTCCTGGTAGGCCCGCTCCAGCGCGCGGCGGCGGAACTGGTCGATCATCAAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAgg > 1:902567/1‑235 (MQ=255) tGGGCACTTCTGCTTCGGGCAGGTGAGCCAGGCCCTCCTGGTAGGCCCGCTCCAGCGCGCGGCGGCGGAACTGGTCGATCATCAAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGtt > 2:756692/1‑235 (MQ=255) tGGGCACTTCTGCTTCGGGCAGGTGAGCCAGGCCCTCCTGGTAGGCCCGCTCCAGCGCGCGGCGGCGGAACTGGTCGATCATCAAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTa > 1:492057/1‑236 (MQ=255) gtCGGGCAGGTGAGCCAGGCCCTCCTGGTAGGCCCGCTCCAGCGCGCGGCGGCGGAACTGGTCGATCATCAAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCgcgc < 1:301935/213‑1 (MQ=255) aGGTGAGCCAGGCCCTCCTGGTAGGCCCGCTCCAGCGCGCGGCGGCGGAACTGGTCGATCATCAAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTagagca > 1:583531/1‑235 (MQ=255) cAGGCCCTCCTGGTAGGCCCGCTCCAGCGCGCGGCGGCGGAACTGGTCGATCATCAAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCt < 1:673832/236‑1 (MQ=255) ggTAGGCCCGCTCCAGCGCGCGGCGGCGGAACTGGTCGATCATCAAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGt > 1:63127/1‑201 (MQ=255) tAGGCCCGCTCCAGCGCGCGGCGGCGGAACTGGTCGATCATCAAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTg < 2:670607/234‑1 (MQ=255) ccAGCGCGCGGCGGCGGAACTGGTCGATCATCAAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGtt < 1:389475/235‑1 (MQ=255) aGCGCGCGGCGGCGGAACTGGTCGATCATCAAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGa > 1:469950/1‑235 (MQ=255) gcgcgcGGCGGCGGAACTGGTCGATCATCAAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCgcgc < 2:63125/173‑1 (MQ=255) 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aCTGGTCGATCATCAAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAg < 1:773732/236‑1 (MQ=255) tGGTCGATCATCAAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGc > 1:124959/1‑236 (MQ=255) gTCGATCATCAAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGc < 1:397949/234‑1 (MQ=255) atcatcAAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAg < 1:334801/228‑1 (MQ=255) tcatcaAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCgcgc < 2:513083/149‑1 (MQ=255) atcaAGCCATGGGCGATGCTGCTGTGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACAACTGGCGGGCGCGCAATAACCGCACGAAGGTGTCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAATCGACCCGGCTGCGACACCAGCCGCGCTACCAGGTATGGTga < 2:567130/162‑1 (MQ=255) tcaAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTgg > 2:753852/1‑189 (MQ=255) gaattgagaactattcacaatcgcacacatcactggactgggccttctctacgatgcagatcaacgacacgctcaagcccaccgaggtcgctctgctctaccagtctcaccatacctggttgcgCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTc < 1:1063404‑M1/59‑1 (MQ=255) caAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGAcc < 2:896310/181‑1 (MQ=255) caAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCccagtccagt < 1:959183/235‑1 (MQ=255) ccACGGGCGATGCTGCTGAGGTCGGCGCGCGGTTCTTTGGGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGAtgt < 1:60538/236‑1 (MQ=255) 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cgcgGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGTGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTc < 1:577561/235‑1 (MQ=255) ttGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCGCGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGAcc < 2:79379/141‑1 (MQ=255) cttctctacgatgcagatcaacgacacgctcaagcccaccgaggtcgctctgctctaccagtctcaccatacctggttgcgCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGa < 2:1079357‑M1/55‑1 (MQ=255) cggcgACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATa < 1:496291/236‑1 (MQ=255) 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gcgcgcAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGTCATGTTCCCTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCa < 1:1001371/236‑1 (MQ=255) cgcgcAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGAtgtgt < 1:364336/180‑1 (MQ=255) gcgcAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCa > 2:559191/1‑234 (MQ=255) gaaCGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGa < 2:731801/176‑1 (MQ=255) 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cAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAg > 1:140890/1‑196 (MQ=255) cAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCATGCCAAAGATTAGCTGCGCAAGAACCGGCGtt > 1:744619/1‑236 (MQ=255) ggTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATCGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCATGCCAAAGATTAGCTGCGCAAGAACCGGCg > 2:823597/1‑232 (MQ=255) gTCTGCGGCATGTTCAGTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCa < 1:296509/201‑1 (MQ=255) gTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCTGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCTGGTATGGTGCGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGGGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCccagtccagt < 2:10275/139‑1 (MQ=255) gTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACAAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCATGCCAAAGATTAGCTGCGCAAGAACCGGCGttt < 1:77666/234‑1 (MQ=255) cTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCATGCCAAAGATTAGCTGCGCAAGAAgcggcg > 1:442890/1‑229 (MQ=255) gCATGTTCGCTGCAGCCGACCCGGCGGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCa < 2:519954/194‑1 (MQ=255) tCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCATGCCAAAGATTAGCTGCGCAAGAACCGGCGTTTGCCCGATGAACgg > 2:522805/1‑234 (MQ=255) tCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCATGCCAAAGATTAGCTGCGCAAGAACCGGCGTTTGCCCGATGAACGGc > 1:426307/1‑235 (MQ=255) cAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCATGCCAAAGATTAGCTGCGCAAGAACCGGCGTTTGCCCGATGAACGGCTGCGCt < 1:522808/235‑1 (MQ=255) tggttgccCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCATGCCAAAGATTAGCTGCGCAAGAACCGGCGTTTGCCCGATGAACGGCTGCGCt < 1:754648‑M1/226‑1 (MQ=255) aaCCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGAtgtgt < 1:637718/126‑1 (MQ=255) cGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGAt > 2:291913/1‑119 (MQ=255) ccGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACGGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAg < 2:119409/166‑1 (MQ=255) GGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCATGCCAAAGATTAGCTGCGCAAGAACCGGCGTTTGCCCGATGaa > 1:221884‑M1/1‑215 (MQ=255) GCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCATGCCAAAGATTAGCTGCGCAAGAACCGGCGTTTGCCCGATGAACGGCTGCGCTAAGCTGGACCTGc > 1:821273‑M1/1‑234 (MQ=255) aCCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCATGCCAAAGATTAGCTGCGCAAGAACCGGCGTTTGCCCGATGAACGGCTGCGCTAAGCTGGACCTGCAATCGa > 1:108579/1‑235 (MQ=255) ccgCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCATGCCAAAGATTAGCTGCGCAAGAACCGGCGTTTGCCCGATGAACGGCTGCGCTAAGCTGGACCTGCAATCGACTTGAt > 1:455415‑M2/4‑236 (MQ=255) ccgCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATCGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCATGCCAAAGATTAGCTGCGCAAGAACCGGCGTTTGCCCGATGAACGGCTGCGCTAAGCTGGACCTGCAATCGACTTGAt < 1:823600‑M2/233‑1 (MQ=255) | TCGCTGGGCACTTCTGCTTCGGGCAGGTGAGCCAGGCCCTCCTGGTAGGCCCGCTCCAGCGCGCGGCGGCGGAACTGGTCGATCATCAAGCCACGGGCGATGCTGCTGAGGTAGGCGCGCGGTTCTTTGAGCGGCGACATCTGGCGGGCGCGCAACAACCGCACGAAGGTATCCTGGGCCAGGTCTGCGGCATGTTCACTGCAACCGACCCGGCTGCGTAACCAGCCGCGCAACCAGGTATGGTGAGACTGGTAGAGCAGAGCGACCTCGGTGGGCTTGAGCGTGTCGTTGATCTGCATCGTAGAGAAGGCCCAGTCCAGTGATGTGTGCGATTGTGAATAGTTCTCAATTCTATGCGGGGAAGATAGCGCGGAGCAATGGCATGCCAAAGATTAGCTGCGCAAGAACCGGCGTTTGCCCGATGAACGGCTGCGCTAAGCTGGACCTGCAATCGACTTGAT > AE015451/818377‑818837 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |