New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 5892003 | 61 (1.060) | 4 (0.070) | 4/318 | NT | 6.6% | coding (621/831 nt) | PP_5166 | Sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
? | AE015451 | = 5892260 | 57 (1.060) | coding (364/831 nt) | PP_5166 | Sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
GCAGCGGCGGCAGTTCCAGCGCGCCCTCGCGCAAATACTGGTACAGGCGCTCGTTGAAGCGCCCTGCACGCACCACACGGGCCAGGTCGATGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCTCCACGGTCGCTGGTACGGTGGATCTGCCGGGCCAGCAGCTCCTTGCCGGTGCCGGTTTCGCCACGGATCAGCACCGGCAAAGGTTGT > AE015451/5892026‑5892480 | gCAGCGGCGGCAGTTCCAGCGCGCCCTCGCGCAAATACTGGTACAGGCGCTCGTTGAAGCGCCCTGCACGCACCACACGGGCCAGGTCGATGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCg < 1:929330‑M2/236‑2 (MQ=255) gcAGTTCCAGCGCGCCCTCGCGCAAATACTGGTACAGGCGCTCGTTGAAGCGCCCTGCACGCACCACACGGGCCAGGTCGATGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTTGTCCAGGTACAAGGTGCCgccgctggcc > 1:373539‑M2/1‑226 (MQ=255) gcAGTTCCAGCGCGCCCTCGCGCAAATACTGGTACAGGCGCTCGTTGAAGCGCCCTGCACGCACCACACGGGCCAGGTCGATGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCgccgctggcc > 1:748077‑M2/1‑226 (MQ=255) ccTCGCGCAAATACTGGTACAGGCGCTCGTTGAAGCGCCCTGCACGCACCACACGGGCCAGGTCGATGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCg < 1:1042620/236‑1 (MQ=255) cAGGCGCTCGTTGAAGCGCCCTGCACGCACCACACGGGCCAGGTCGATGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGgctgc > 1:785414/1‑227 (MQ=255) ggCGCTCGTTGAAGCGCCCTGCACGCACCACACGGGCCAGGTCGATGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTAcc < 1:963241/235‑1 (MQ=255) cTCGTTGAAGCGCCCTGCACGCACCACACGGGCCAGGTCGATGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCa > 1:987696/1‑235 (MQ=255) gTTGAAGCGCCCTGCACGCACCACACGGGCCAGGTCGATGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATgg > 1:640670/1‑235 (MQ=255) acgcacCACACGGGCCAGGTCGATGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAg > 1:369380/1‑235 (MQ=255) ccacACGGGCCAGGTCGATGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGgctgc > 1:973331/1‑198 (MQ=255) ccacACGGGCCAGGTCGATGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGgctgc < 2:973328/198‑1 (MQ=255) gggCCAGGTCGATGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACa < 1:191204/231‑1 (MQ=255) 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aGGTCGCTGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATc < 1:161359/236‑1 (MQ=255) ggTCGATGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCgg > 1:3552/1‑177 (MQ=255) gATGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCg > 2:191202/1‑172 (MQ=255) gATGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCgg > 1:600714/1‑233 (MQ=255) gATGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGcct > 1:443756/1‑234 (MQ=255) aTGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGt < 1:877206/235‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCgg < 2:1052929/223‑1 (MQ=255) tggtggCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTg > 1:761521/1‑236 (MQ=255) gcggcTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCt > 1:301203/1‑236 (MQ=255) ccAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCg < 2:940606/209‑1 (MQ=255) cacaTCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAg > 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ctgcGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCt < 1:742141/235‑1 (MQ=255) tgcGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCTcc < 1:55908/236‑1 (MQ=255) cgcgcCCCCCCGAGTGCCCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCGGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGc < 2:137004/138‑1 (MQ=255) cgcgcCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCTcc < 1:879967/234‑1 (MQ=255) gcgcCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCTCCACg > 1:389564/1‑236 (MQ=255) cccccGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCgg < 2:480668/171‑1 (MQ=255) cGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCTCCACGGTCGCTGGt < 1:634474/236‑1 (MQ=255) cGAGTGACCCCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCTCCACGGTCGCTGGt < 1:1022196/236‑1 (MQ=255) gAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTggg > 2:604103/1‑184 (MQ=255) aCCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCTCCACgg < 1:554336/222‑1 (MQ=255) cTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGCCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCgg < 2:137349/161‑1 (MQ=255) gcgcgGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGt < 1:270477/192‑1 (MQ=255) 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ttCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCTCCACGGTCGCTGGTACGGTGGATCTGc < 2:929327/232‑1 (MQ=255) cAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGgc > 2:856092/1‑129 (MQ=255) aGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCTCCACGGTCGCTGGt < 1:173329/215‑1 (MQ=255) ggCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCTCCACGGTCGCTGGTACGGTGGATCTGCCGGGcc < 2:987693/232‑1 (MQ=255) agcagcTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCgccgctggccgagtactttgcgggcatctacagcgtgcgcctgcaacggcctgtgcccttggtgagcgaggcggcgcagcgggttctggaggggcatttctggcccggcaata > 2:303062‑M2/1‑59 (MQ=255) gcagcTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCTCCACGGTCGCTGGTACGGTGGATCTGCCGGGCCAGCAGCTCCTtg > 1:1007779/1‑236 (MQ=255) tGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGcc < 2:390506/158‑1 (MQ=255) tGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCCCTATCGCCAACCAGCCCGGCAt > 2:58256/1‑130 (MQ=255) gagggCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTc < 2:48231/120‑1 (MQ=255) aTGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCTCCACGGTCGCTGGTACGGTGGATCTGCCGGGCCAGCAGCTCCTTGCCGGTGCCGGTTTc < 1:418021/236‑1 (MQ=255) aCGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCgccgctggccgagtactttgcgggcatctacagcgtgcgcctgcaacggcctgtgcccttggtgagcgaggcggcgcagcgggttctggaggggcatttctggcccggcaatacccgcgaactggagaacgtcatccactttgcattgctggtcaatgacggcgaagagatcctgcccgaagacctcgacctgc < 2:515482‑M2/231‑195 (MQ=255) aCGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCgg < 2:787998/96‑1 (MQ=255) aCGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCgg > 1:788001/1‑96 (MQ=255) ggCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCgccgctggccgagtactttgcgggcatctacagcgtgcgcctgcaacggcctgtgcccttggtgagcgaggcggcgcagcgggttctggaggggcatttctggcccggcaatacccgcgaactggagaacgtcatccactttgcatttctggtcaatgacggcgacga < 1:86892‑M2/195‑169 (MQ=255) ggCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCTCCACGGTCGCTGGTACGGTGGATCTGCCGGGCCAGCAGCTCCTTGCCGGTGCCGGTTTCGCCACGGATCAGCAc > 2:689074/1‑234 (MQ=255) tcGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGacac < 2:301200/143‑1 (MQ=255) cAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCTCCACGGTCGCTGGTACGGTGGATCTGCCGGGCCAGCAGCTCCTTGCCGGTGCCGGTTTCGCCACGGATCAGCACCg < 1:183178/224‑1 (MQ=255) aGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCTCCACGGTCGCTGGTACGGTGGATCTGCCGGGCCAGCAGCTCCTTGCCGGTGCCGGTTTCGCCACGGATCAGCACCGGCAAAGGTtgt > 2:650852/1‑234 (MQ=255) gccgccGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCTCCACGGTCGCTGGTACGGTGGATCTGCCGGGCCAGCAGCTCCTTGCCGGTGCCGGTTTCGCCACGGATCa > 2:641920/1‑206 (MQ=255) gccgccGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCTCCACGGTCGCTGGTACGGTGGATCTGCCGGGCCAGCAGCTCCTTGCCGGTGCCGGTTTCGCCACGGATCa < 1:641923/206‑1 (MQ=255) | GCAGCGGCGGCAGTTCCAGCGCGCCCTCGCGCAAATACTGGTACAGGCGCTCGTTGAAGCGCCCTGCACGCACCACACGGGCCAGGTCGATGCTGGTGGCGGCTACCAGACGCACATCCACCGGCTGTGGCTGCTGCGCGCCCACCCGAGTGACCTCGCGGTTTTCCAGGGCCGCCAGCAGCTTGCCCTGGATGGCCAACGGCAAGTCGGCAATCTCGTCCAGGTACAAGGTGCCGCCGCTGGCCGAACCGAACCAGCCGGCGCGGCTGCTGGCCGTACCGCCATGGCTGCCGGCGCTATAGCCAAACAGCTCGGCATCGGCGTAGGTGGGGCTGATGGCCGCGCAGTTGACCGACACGAACAACCCTCCACGGTCGCTGGTACGGTGGATCTGCCGGGCCAGCAGCTCCTTGCCGGTGCCGGTTTCGCCACGGATCAGCACCGGCAAAGGTTGT > AE015451/5892026‑5892480 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |