New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 2563175 | 18 (0.450) | 3 (0.080) | 3/318 | NT | 16.2% | coding (913/1137 nt) | dauA | catabolic D‑arginine dehydrogenase, FAD‑dependent |
? | AE015451 | = 2563250 | 14 (0.370) | coding (988/1137 nt) | dauA | catabolic D‑arginine dehydrogenase, FAD‑dependent |
CTTCACCTTCCCTGGTCCGGCAGAGCAGGACTTTACTCGCTGGCCTGCGGTGATTGGTGTCGATGAAAGCTTCTACTTCAAGCCTGATGCCGGCCAACTGTTGGGGTCGCCAGCCAATGCCGACCCGGTTGAGCCCCAGGATGCCGCGCCCGAGGAGTTCGACGTGGCCTTGGGTATTTACAACATTGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCCGCGTTTTTCTGGCTGGCGGCCCAGGGGGGCTATGGCATCCAGTCGGCAGCGGGCGCCTCGCGCCTGGCCGCCGACCTGCTACTGGGCCAGCCGTTGTGTGCCAGCCTTGTCAGCCAGGGCGTGGCGCCCGAGCGCCTGTCCCCGGCCCGTTTCCAGCAACCCTGAAAGGAGCATC > AE015451/2562940‑2563409 | cTTCACCTTCCCTGGTCCGGCAGAGCAGGACTTTACTCGCTGGCCTGCGGTGATTGGTGTCGATGAAAGCTTCTACTTCAAGCCTGATGCCGGCCAACTGTTGGGGTCGCCAGCCAATGCCGACCCGGTTGAGCCCCAGGATGCCGCGCCCGAGGAGTTCGACGTGGCCTTGGGTATTTACAACATTGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCG < 1:570257‑M1/236‑1 (MQ=255) agACGTTACTCGCTGGCCTGCGGTGATTGGTGTCGATGAAAGCTTCTACTTCAAGCCTGATGCCGGCCAACTGTTGGGGTCGCCAGCCAATGCCGACCCGGTTGAGCCCCAGGATGCCGCGCCCGAGGAGTTCGACGTGGCCTTGGGTATTTACAACATTGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGcgttcgtt < 1:685730/221‑1 (MQ=255) tCGCTGGCCTGCGGTGATTGGTGTCGATGAAAGCTTCTACTTCAAGCCTGATGCCGGCCAACTGTTGGGGTCGCCAGCCAATGCCGACCCGGTTGAGCCCCAGGATGCCGCGCCCGAGGAGTTCGACGTGGCCTTGGGTATTTACAACATTGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGa > 1:527886/1‑236 (MQ=255) ggTGTCGATGAAAGCTTCTACTTCAAGCCTGATGCCGGCCAACTGTTGGGGTAGCCAGCCAATGCCGACCCGGTTGAGCCCCAGGATGCCGCGCCCGAGGAGTTCGACGTGGCCTTGGGTATTTACAACATTGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGa > 2:698439/1‑227 (MQ=255) aaaGCTTCTACTTCAAGCCTGATGCCGGCCAACTGTTGGGGTCGCCAGCCAATGCCGACCCGGTTGAGCCCCAGGATGCCGCGCCCGAGGAGTTCGACGTGGCCTTGGGTATTTACAACATTGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTg > 1:522133/1‑176 (MQ=255) ttCTACTTCAAGCCTGATGCCGGCCAACTGTTGGGGTCGCCAGCCAATGCCGACCCGGTTGAGCCCCAGGATGCCGCGCCCGAGGAGTTCGACGTGGCCTTGGGTATTTACAACATTGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCCGCGTTTTTctg > 1:57340/1‑236 (MQ=255) cagccaATGCCGACCCGGTTGAGCCCCAGGATGCCGCGCCCGAGGAGTTCGACGTGGCCTTGGGTATTTACAACATTGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGtt < 2:582645/168‑1 (MQ=255) agccaATGCCGACCCGGTTGAGCCCCAGGATGCCGCGCCCGAGGAGTTCGACGTGGCCTTGGGTATTTACAACATTGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCCGCGTTTTTCTGGCTGGcggcccc < 2:643243‑M2/207‑8 (MQ=255) cGGTTGAGCCCCAGGATGCCGCGCCCGAGGAGTTCGACGTGGCCTTGGGTATTTACAACATTGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCCGCGTTTTTCTGGCTGGcggc < 1:501865‑M2/190‑5 (MQ=255) cGGTTGAGCCCCAGGATGCCGCGCCCGAGGAGTTCGACGTGGCCTTGGGTATTTACAACATTGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCCGCGTTTTTCTGGCTGGCGGCCCAGGGGGGCTATGGCATCCAGTCGGCAGCGGgcg < 2:57340/225‑1 (MQ=255) aGGATGCCGCGCCCGAGGAGTTCGACGTGGCCTTGGGTATTTACAACATTGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCcgc > 2:665613/1‑160 (MQ=255) aGGATGCCGCGCCCGAGGAGTTCGACGTGGCCTTGGGTATTTACAACATTGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCCGCGTTTTTCTGGCTGGCGGCCCAgggggg < 2:656916/187‑1 (MQ=255) tgcCCGAGGAGTTCGACGTGGCCTTGGGTATTTACAACATTGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCCGCGTTTTTCTGGCTGGCGGCCCAGGGGGGCTATGGCATCCAGTCGGCAGCGGGCGCCTCGCGCCTGGCCGCCGACCTGCTACTGGGc < 2:522132/235‑1 (MQ=255) cGACGTGGCCTTGGGTATTTACAACATTGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGccagccagaaaaacgcgggggcatgcgcatcgaaaccgatcaccaggtcgccgt > 2:280680‑M1/1‑77 (MQ=255) caTGGAAGCGAGGACCACCCGGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGt < 2:81322/87‑1 (MQ=255) ttGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCCGCGTTTTTCTGGCTGGCGGCCCAGGGGGGCTATGGCATCCAGTCGGCAGCGGGCGCCTCGCGCCTGGCCGCCGACCTGCTACTGGGCCAGCCGTTGTGTGCCAGCCTTGt > 2:474689/1‑220 (MQ=255) ttGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCCGCGTTTTTCTGGCTGGCGGCCCAGGGGGGCTATGGCATCCAGTCGGCAGCGGGCGCCTCGCGCCTGGCCGCCGACCTGCTACTGGGCCAGCCGTTGTGTGCCAGCCTTGTCAGCCAGGGCGTGgcg > 1:214066/1‑236 (MQ=255) tGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGccagccagaaaaacgcgggggcatgcgcatcgaaaccgatcaccaggtcgccgtcggcaacgaacgaacgcaacccggcccaggagtggctcgggcggcggatcgccagggtggtcatggctt > 1:665614‑M1/1‑50 (MQ=255) tGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGCCGCCGACCTGGTGATCggg > 2:103361/1‑90 (MQ=255) gAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCCGCGTTTTTCTGGCTGGcggcccaggtgtggctcgggcg > 2:402462‑M2/1‑124 (MQ=255) aaGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACTCCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCCGCGTTTTTCTGGCTGGcggcccaggtgtggctcgggcggcggatcgccagggtggtcatggcttca > 1:665614‑M2/1‑123 (MQ=255) ccaccCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCCGCGTTTTTCTGGCTGGCGGCCCAGGGGGGCTATGGCATCCAGTCGGCAGCGGGCGCCTCGCGCCTGGCCGCCGACCTGCTACTGGGCCAGCCGTTGTGTGCCAGCCTTGTCAGCCAGGGCGTGgcgc < 2:422889/225‑1 (MQ=255) ccaccCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCCGCGTTTTTCTGGCTGGCGGCCCAGGGGGGCTATGGCATCCAGTCGGCAGCGGGCGCCTCGCGCCTGGCCGCCGACCTGCTACTGGGCCAGCCGTTGTGTGCCAGCCTTGTCAGCCAGGGCGTGgcgc > 1:422890/1‑225 (MQ=255) gATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCCGCGTTTTTCTGGCTGGCGGCCCAGGGGGGCTATGGCATCCAGTCGGCAGCGGGCGCCTCGCGCCTGGCCGCCGACCTGCTACTGGGCCAGCCGTTGTGTGCCAGCCt < 2:513377/195‑1 (MQ=255) cgccCGAGCCACACCTGGGCCGccagccagaaaaacgcgggggcatgcgcatcgaaaccgatcaccaggtcgccgtcggcaacgaacgaacgcaacccggcccaggtgtggctcgggcggcggatcgccagggtggtcatggcttc > 2:402462‑M1/1‑22 (MQ=255) ccGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCCGCGTTTTTCTGGCTGGCGGCCCAGGGGGGCTATGGCATCCAGTCGGCAGCGGGCGCCTCGCGCCTGGCCGCCGACCTGCTACTGGGCCAGCCGTTGTGTGCCAGCCTTGTCAGCCAGGGCGTGGCGCCCGAGCGCCTGTCCCCGGCCCGTTTCCAGCa < 2:527885/236‑1 (MQ=255) cgggCCGCACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCTGACGGCGGCCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCCGCGTTTTTCTGGCTGGCGGCCCAGGGGGGCTATGGCATCCAGTCGGCAGCGGGCGCCTCGCGCCTGGCCACCGACCTGCTACTGGGCCAGCCGTTGTGTGCCAGCCTTGTCAGCCAGGGCGTGGCGCCCGAGCGCCTGTCCCCg < 1:253998/218‑1 (MQ=255) ggggcCGccagccagaaaaacgcgggggcatgcgcatcgaaaccgatcaccaggtcgccgtcggcaacgaacgaacgcaacccggcccaggtgtggctcgggcggcggatcgccagggtggtcatggcttcaatgttgtaaatacccaaggccacgtcgaactcctcgggcgcggcatcctggggctcaaccgggtcggcattggct < 2:643243‑M1/206‑201 (MQ=255) gccgccagccagaaaaacgcgggggcatgcgcatcgaaaccgatcaccaggtcgccgtcggcaacgaacgaacgcaacccggcccaggtgtggctcgggcggcggatcgccagggtggtcatggcttcaatgttgtaaatacccaaggccacgtcgaactcctcgggcgcggcatcctggggctcaaccg < 1:501865‑M1/190‑187 (MQ=255) cGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCCGCGTTTTTCTGGCTGGCGGCCCAGGGGGGCTATGGCATCCAGTCGGCAGCGGGCGCCTCGCGCCTGGCCGCCGACCTGCTACTGGGCCAGCCGTTGTGTGCCAGCCTTGTCAGCCAGGGCGTGGCGCCCGAGCGCCTGTCCCCGGCCCGTTTCCAGCAACCCTGAAAGGAGCATc > 1:363883/1‑236 (MQ=255) | CTTCACCTTCCCTGGTCCGGCAGAGCAGGACTTTACTCGCTGGCCTGCGGTGATTGGTGTCGATGAAAGCTTCTACTTCAAGCCTGATGCCGGCCAACTGTTGGGGTCGCCAGCCAATGCCGACCCGGTTGAGCCCCAGGATGCCGCGCCCGAGGAGTTCGACGTGGCCTTGGGTATTTACAACATTGAAGCCATGACCACCCTGGCGATCCGCCGCCCGAGCCACACCTGGGCCGGGTTGCGTTCGTTCGTTGCCGACGGCGACCTGGTGATCGGTTTCGATGCGCATGCCCCCGCGTTTTTCTGGCTGGCGGCCCAGGGGGGCTATGGCATCCAGTCGGCAGCGGGCGCCTCGCGCCTGGCCGCCGACCTGCTACTGGGCCAGCCGTTGTGTGCCAGCCTTGTCAGCCAGGGCGTGGCGCCCGAGCGCCTGTCCCCGGCCCGTTTCCAGCAACCCTGAAAGGAGCATC > AE015451/2562940‑2563409 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |