New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 3212447 = | 48 (1.200) | 3 (0.080) | 3/320 | NT | 6.1% | coding (396/567 nt) | PP_2816 | putative Transcriptional regulator NfxB |
? | AE015451 | 3212597 = | 47 (1.240) | coding (246/567 nt) | PP_2816 | putative Transcriptional regulator NfxB |
TCCCTTCCTTTGACGCAATAGGTCTTCACGGCTGTTGCCCTGCGCGGGCGCTCAATAGGGCGCCCGCGTGGCAATGCCCTGTAGAAACGCGCTCTCCAGCACCGTTGCACACTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAG > AE015451/3212225‑3212680 | tCCCTTCCTTTGACGCAATAGGTCTTCACGGCTGTTGCCCTGCGCGGGCGCTCAATAGGGCGCCCGCGTGGCAATGCCCTGTAGAAACGCGCTCTCCAGCACCGTTGCACACTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCaa > 1:543801/1‑236 (MQ=255) ccttccttTGACGCAATAGGTCTTCACGGCTGTTGCCCTGCGCGGGCGCTCAATAGGGCGCCCGCGTGGCAATGCCCTGTAGAAACGCGCTCTCCAGCACCGTTGCACACTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCaaa < 1:703133/235‑1 (MQ=255) tGCCCTGCGCGGGCGCTCAATAGGGCGCCCGCGTGGCAATGCCCTGTAGAAACGCGCTCTCCAGCACCGTTGCACACTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAgg < 1:496406/236‑1 (MQ=255) cccTGCGCGGGCGCTCAATAGGGCGCCCGCGTGGCAATGCCCTGTAGAAACGCGCTCTCCAGCACCGTTGCACACTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCAGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGACTTTCCAGATAAAACCGCAGGt > 1:420112/1‑235 (MQ=255) ggcgGTCGCTCAATAGGGCGCCCGCGTGGCAATGCCCTGTAGAAACGCGCTCTCCAGCACCGTTGCACACTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGc < 2:420111/225‑1 (MQ=255) gggCGCTCAATAGGGCGCCCGCGTGGCAATGCCCTGTAGAAACGCGCTCTCCAGCACCGTTGCACACTCGCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGtgctgc < 1:52866/235‑1 (MQ=255) ccttgcgacccagagcgtccatgggcgagctggccgtgttggcgggcatcagccgggcaaccctgcaccgttactgcggtacgagagacaacctcgatagccagctcgaacagcacgccaaagacacgctcatgcatatcctcgacaacagcggcacgctggcctgccgcgagcccCTGGcc < 2:595662‑M1/6‑1 (MQ=255) ccttgcgacccagagcgtccatgggcgagctggccgtgttggcgggcatcagccgggcaaccctgcaccgttactgcggtacgagagacaacctcgatagccagctcgaacagcacgccaaagacacgctcatgcatatcctcgacaacagcggcacgctggcctgccgcgagcccCTGGcc > 1:595663‑M1/177‑182 (MQ=255) aTAGGGCGCCCGCGTGGCAATGCCCTGTAGAAACGCGCTCTCCAGCACCGTTGCACACTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCAtgt < 1:241244/236‑1 (MQ=255) cccGCGTGGCAATGCCCTGTAGAAACGCGCTCTCCAGCACCGTTGCACACTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTc < 1:442107/211‑1 (MQ=255) ccGCGTGGCAATGCCCTGTAGAAACGCGCTCTCCAGCACCGTTGCACACTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAg < 2:368067/233‑1 (MQ=255) gcgTGGCAATGCCCTGTAGAAACGCGCTCTCCAGCACCGTTGCACACTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTaa < 1:341772/236‑1 (MQ=255) cgTGGCAATGCCCTGTAGAAACGCGCTCTCCAGCACCGTTGCACACTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGtgct > 1:348036/1‑212 (MQ=255) cgTGGCAATGCCCTGTAGAAACGCGCTCTCCAGCACCGTTGCACACTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCt > 2:574952/1‑219 (MQ=255) gcgagctggccgtgttggcgggcatcagccgggcaaccctgcaccgttactgcggtacgagagacaacctcgatagccagctcgaacagcacgccaaagacacgctcatgcatatcctcgacaacagcggcacgctggcctgccgcgagcccCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGa > 1:441658‑M1/153‑236 (MQ=255) ccTGTAGAAACGCGCTCTCCAGCACCGTTGCACACTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAg < 1:209195/181‑1 (MQ=255) cgcTCTCCAGCACCGTTGCACACTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGt > 1:723824/1‑236 (MQ=255) tcCAGCACCGTTGCACACTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCGGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCa > 2:541476/1‑163 (MQ=255) ggCACCGTTGCACACTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGc < 1:379739/170‑1 (MQ=255) cacaCTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCAtgtg > 1:666019/1‑184 (MQ=255) cacaCTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCAtgtg < 2:666018/184‑1 (MQ=255) cacaCTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTgc > 1:674973/1‑236 (MQ=255) cacTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTcc > 2:743375/1‑147 (MQ=255) cacTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTcc < 1:743376/147‑1 (MQ=255) acTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAAc > 2:379738/1‑155 (MQ=255) tGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTcgct < 2:735350/107‑1 (MQ=255) tGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTcgct > 1:735351/1‑107 (MQ=255) cgcgcgcCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCt > 1:229191/1‑236 (MQ=255) gacgcCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTg > 1:392875/3‑235 (MQ=255) gcCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGTTAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCAtgt < 1:320394/165‑1 (MQ=255) gcCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGTTAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCAtgt > 2:320393/1‑165 (MQ=255) gcCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCt > 2:529306/1‑160 (MQ=255) gcCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCt < 1:529307/160‑1 (MQ=255) ggcgTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAggg < 1:462633/236‑1 (MQ=255) cgTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTcgctggccgctggc > 2:741131/1‑94 (MQ=255) gACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCa < 1:523976/179‑1 (MQ=255) gACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCa > 2:523975/1‑179 (MQ=255) cAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCgg < 1:551716/209‑1 (MQ=255) cAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCgg > 2:551715/1‑209 (MQ=255) cAGCGAGACGAACATTTCGGTCAGCAACGCCGCGGAGACATCCGCTCGAAATACGGCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAg < 2:518129/158‑1 (MQ=255) aGCTATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATCCGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTg < 1:73861/234‑1 (MQ=255) aTACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGGGCCGCt > 1:246716/1‑235 (MQ=255) aTCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCg > 2:494418/1‑102 (MQ=255) atgcatatcctcgacaacagcggcacgctggcctgccgcgagcccCTGGc > 2:566165‑M1/46‑50 (MQ=255) atgcatatcctcgacaacagcggcacgctggcctgccgcgagcccCTGGc < 1:566166‑M1/5‑1 (MQ=255) cgacaacagcggcacgctggcctgccgcgagcccCTGGCCGCTGGCAAACAACGCAGCGAGCCTTTCCAGATAAAAc < 2:690605‑M1/43‑1 (MQ=255) cgcgGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGa > 1:649277/1‑125 (MQ=255) cagTGACATCCGCTCGAAATACGCCGTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGTGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAggg < 1:26942/181‑1 (MQ=255) ggTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGATCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCtt > 1:343784/1‑236 (MQ=255) aCATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCCCGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGc < 2:264781/122‑1 (MQ=255) ggcacgctggcctgccgcgagcccCTGGCCGCGGGCAAACAAAGCATCGAGGCTTTCCAGAAAAAACCGCAGGGCGTGCTGCAc < 1:86615‑M1/60‑1 (MQ=255) ccGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCGGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCg < 2:450094/192‑1 (MQ=255) cGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGctgattc < 2:488200/166‑7 (MQ=255) gAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTg < 1:15752/188‑1 (MQ=255) gAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTg > 2:15752/1‑188 (MQ=255) aaaTACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATc < 2:638224/145‑1 (MQ=255) aaaTACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATc > 1:638225/1‑145 (MQ=255) gctggccgctggcAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCgg < 2:490836/147‑1 (MQ=255) gctggccgctggcAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCgg > 1:490837/1‑147 (MQ=255) gctggccgctggcAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAg > 1:570054/1‑235 (MQ=255) gctggccgctggcAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAg < 1:357884/235‑1 (MQ=255) | TCCCTTCCTTTGACGCAATAGGTCTTCACGGCTGTTGCCCTGCGCGGGCGCTCAATAGGGCGCCCGCGTGGCAATGCCCTGTAGAAACGCGCTCTCCAGCACCGTTGCACACTCTCTTGGCGCGCGCCCCCGTTGGCGGGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAG > AE015451/3212225‑3212680 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |