New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 3212447 = | 48 (1.200) | 3 (0.080) | 3/320 | NT | 6.1% | coding (396/567 nt) | PP_2816 | putative Transcriptional regulator NfxB |
? | AE015451 | 3212597 = | 47 (1.240) | coding (246/567 nt) | PP_2816 | putative Transcriptional regulator NfxB |
GGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAACACGGCCAGCTCGCCCATGGACGCTCTGGGTCGCAAGGCGGCAGCGGCATACAGGGCATTC > AE015451/3212363‑3212795 | ggcgTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAggg < 1:462633/236‑1 (MQ=255) aGCTATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATCCGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTg < 1:73861/234‑1 (MQ=255) aTACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGGGCCGCt > 1:246716/1‑235 (MQ=255) cagTGACATCCGCTCGAAATACGCCGTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGTGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAggg < 1:26942/181‑1 (MQ=255) ggTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGATCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCtt > 1:343784/1‑236 (MQ=255) ccGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCGGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCg < 2:450094/192‑1 (MQ=255) gAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTg < 1:15752/188‑1 (MQ=255) gAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTg > 2:15752/1‑188 (MQ=255) gctggccgctggcAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAg > 1:570054/1‑235 (MQ=255) gctggccgctggcAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAg < 1:357884/235‑1 (MQ=255) TGGCCGCTGGCAAACAACGCAGCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGtt > 1:125037‑M1/1‑236 (MQ=255) cTTTCCAGATAAACCCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCa < 1:731172/235‑1 (MQ=255) cccGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGtt < 1:612752/226‑1 (MQ=255) ccGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGc < 2:724404/185‑1 (MQ=255) cGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCg > 1:398335/1‑177 (MQ=255) cGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCg < 2:398334/177‑1 (MQ=255) ggTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAg < 2:234190/206‑1 (MQ=255) ggTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAg > 1:234190/1‑206 (MQ=255) aTGTGAACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAACACGGCCa < 1:444817/232‑1 (MQ=255) tcccgttaccctgtgcacatgagcgtgcagcacgacctgcggttttatctggaaaggctcgatgcgttgtttgccagcggccagGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAACACGGCCAGCTCGc > 1:441658‑M2/85‑236 (MQ=255) cacaGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAACACGGCCAGCTCGccc < 1:574953/235‑1 (MQ=255) caggggTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAACACGGCCAGCTCgaaca < 1:493368/232‑5 (MQ=255) gTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCt > 1:133373/1‑201 (MQ=255) aaCGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCTAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGcc > 1:185510/1‑209 (MQ=255) cGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCCGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCtg > 2:62733/1‑99 (MQ=255) ggCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAg < 1:741132/169‑1 (MQ=255) gCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCtgtt > 1:171638/1‑95 (MQ=255) gCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCtgtt < 2:171638/95‑1 (MQ=255) cAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGtt > 2:599865/1‑150 (MQ=255) cAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTCACGGTGCAg > 2:173585/1‑177 (MQ=255) cAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTg > 2:493367/1‑190 (MQ=255) cAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAACACGGCCAGCTCGCCCATGGACGCTCTGGGTCg > 1:701769/1‑234 (MQ=255) cAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAACACGGCCAGCTCGCCCATGGACGCTCTGGGTCGc > 1:50260/1‑235 (MQ=255) ggAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCg < 2:543976/156‑1 (MQ=255) gtgcagcacgccctgcggttttttctggaaagcctcgatgctttgtttgcccgcggccagGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGcc < 1:86615‑M2/24‑1 (MQ=255) aaaGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAg < 1:49069/162‑1 (MQ=255) aaaGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAg > 2:49069/1‑162 (MQ=255) aaGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTAACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTAt < 1:690606/138‑1 (MQ=255) aCCCTGGGCCAGGGGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGc < 2:229191/176‑1 (MQ=255) gttttatctggaaaggctcgctgcgttgtttgccagcggccagGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCg < 2:690605‑M2/34‑1 (MQ=255) ccTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAACACGGCCAGCTCGCCCATGGACGCTCTGGGTCGCAAGGCGGCAGCGGCATACa < 2:570053/234‑1 (MQ=255) gggCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAACACGGCCAGCTCGCCCATGGACGCTCTGGGTCGCAAggcgga > 1:28330/1‑219 (MQ=255) ccAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAACACGGCCAGCTCGCCCATGGACGCTCTGGGTCGCAAGGCGGCAGCGGCATACAGGGCATTc > 1:734910/1‑236 (MQ=255) cAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTg < 2:683150/147‑1 (MQ=255) cAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTg > 1:683151/1‑147 (MQ=255) aGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAacac < 1:628014/176‑1 (MQ=255) aGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAacac > 2:628013/1‑176 (MQ=255) gcgcATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGACCGGCTGATGCCCGCCAACACGGcc > 1:67600/1‑176 (MQ=255) gAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAACACGGCCAGCTCg > 1:716696/1‑176 (MQ=255) aTCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTTCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAACACGGCCAGCTCGCCCATGGACGCTCTGGGTCGCAAGgcggca < 2:571706/204‑1 (MQ=255) cAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAg > 2:63384/1‑135 (MQ=255) ccGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAACACGGcc < 1:541477/159‑1 (MQ=255) aCGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAACACGGCCAGCTCGCCCATGGACGCTCTGGGTCGCAAGgcggcagcggc > 1:490261/1‑201 (MQ=255) ggccagGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAACACGGCCAGCTCGCCCATGGACGCTCTGGGTCGCAAgg < 2:595662‑M2/176‑1 (MQ=255) ggccagGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAACACGGCCAGCTCGCCCATGGACGCTCTGGGTCGCAAgg > 1:595663‑M2/7‑182 (MQ=255) gccagGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCAt > 2:566165‑M2/6‑50 (MQ=255) gccagGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCAt < 1:566166‑M2/45‑1 (MQ=255) | GGCGTCGACCATGCCATGCAACAGCGATACGAACATCTCGGTCAGCAACGCCGCGGTGACATCCGCTCGAAATACGCCTTGTCGCTGGCCGCTGGCAAACAACGCATCGAGCCTTTCCAGATAAAACCGCAGGTCGTGCTGCACGCTCATGTGCACAGGGTAACGGGAGGCCAGGAAAGCGATCAGTTCACCCTGGGCCAGGTGCGCATGAATCAGCTGACGCAACGCGGCCAGGGGCTCGCGGCAGGCCAGCGTGCCGCTGTTGTCGAGGATATGCATGAGCGTGTCTTTGGCGTGCTGTTCGAGCTGGCTATCGAGGTTGTCTCTCGTACCGCAGTAACGGTGCAGGGTTGCCCGGCTGATGCCCGCCAACACGGCCAGCTCGCCCATGGACGCTCTGGGTCGCAAGGCGGCAGCGGCATACAGGGCATTC > AE015451/3212363‑3212795 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |