| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 3556422 = | 22 (0.550) | 3 (0.080) | 3/330 | NT | 12.6% | coding (839/1188 nt) | PP_3140 | Glycosyl transferase, group 2 family protein |
| ? | AE015451 | 3556443 = | 20 (0.510) | coding (860/1188 nt) | PP_3140 | Glycosyl transferase, group 2 family protein | |||||
AGTCTGATCAACCTGGCCAATGGTCATCTGGTCGAGGATGTGAAGCTGGGCCTGGACCTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCGTGGTGTTGGCCTGGGCGCG > AE015451/3556220‑3556635 | aGTCTGATCAACCTGGCCAATGGTCATCTGGTCGAGGATGTGAAGCTGGGCCTGGACCTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTg < 1:709986/214‑1 (MQ=255) aaCCTGGCCAATGGTCATCTGGTCGAGGATGTGAAGCTGGGCCTGGACCTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTggcgg < 1:722593/235‑1 (MQ=255) cTGGCCAATGGTCATCTGGTCGAGGATGTGAAGCTGGGCCTGGACCTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCg < 1:548781/191‑1 (MQ=255) tGGTCATCTGGTCGAGGATGTGAAGCTGGGCCTGGACCTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTg < 2:19439/194‑1 (MQ=255) tGGTCGAGGATGTGAAGCTGGGCCTGGACCTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGcc > 2:37586/1‑188 (MQ=255) aGGATGTGAAGCTGGGCCTGGACCTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTgcc > 1:317446/1‑235 (MQ=255) tGGACCTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAg > 2:453455/1‑173 (MQ=255) ccAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTggcgg < 1:532834/182‑1 (MQ=255) gCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCt > 2:381816/1‑235 (MQ=255) aaCCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCTTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATc < 2:320013/146‑1 (MQ=255) cccGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCg < 2:195943/132‑1 (MQ=255) cTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGc > 2:15873/1‑155 (MQ=255) tttCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGAcc < 1:557127/235‑1 (MQ=255) tGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCCCTTAGCCCGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTg < 2:525785/127‑1 (MQ=255) tGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACctg < 2:637750/233‑1 (MQ=255) ccccGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCCGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTggcgg < 2:703598/155‑1 (MQ=255) ccACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGgcgc > 2:223972/1‑235 (MQ=255) gggCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCCTCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGCTCGCTGCCATCACCCAGCGTACCGCt > 2:47564/1‑103 (MQ=255) cTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGt < 1:170065/223‑1 (MQ=255) cagcaacgccaggggcggcaccagcaagtccagggtcaaggccgccaggctagcgttacgctGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCtggg < 1:701125‑M1/55‑2 (MQ=255) ccGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCCCCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACctggctg < 1:180679/172‑1 (MQ=255) ggAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCCCCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTg < 1:149777/236‑1 (MQ=255) accagcaagtccagggtcaaggccgccaggctagcgttacgctGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTTGTGACCTGGCTGGCGTAcc < 1:34372‑M1/129‑1 (MQ=255) gggCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCggg < 1:584603/130‑1 (MQ=255) gggCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCggg > 2:584602/1‑130 (MQ=255) caaggccgccaggctagcgttacgctGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCGTGGTGTTGGCCTgg < 1:640407‑M1/209‑1 (MQ=255) cTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCGTGGTGTTGGCCTGGgcgcg < 2:397847/233‑1 (MQ=255) GGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCt > 2:676140‑M1/1‑165 (MQ=255) | AGTCTGATCAACCTGGCCAATGGTCATCTGGTCGAGGATGTGAAGCTGGGCCTGGACCTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCGTGGTGTTGGCCTGGGCGCG > AE015451/3556220‑3556635 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |