New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 3556422 = | 22 (0.550) | 3 (0.080) | 3/330 | NT | 12.6% | coding (839/1188 nt) | PP_3140 | Glycosyl transferase, group 2 family protein |
? | AE015451 | 3556443 = | 20 (0.510) | coding (860/1188 nt) | PP_3140 | Glycosyl transferase, group 2 family protein |
AACCTGGCCAATGGTCATCTGGTCGAGGATGTGAAGCTGGGCCTGGACCTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCGTGGTGTTGGCCTGGGCGCGCTTCTGCCGTGAAGTGATACCGTTCT > AE015451/3556229‑3556661 | aaCCTGGCCAATGGTCATCTGGTCGAGGATGTGAAGCTGGGCCTGGACCTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTggcgg < 1:722593/235‑1 (MQ=255) ccaggccaacaccacggcaaaggccagcaaggccaaaccggcaaaggcgagccacgcgggcgccgccaggccgaacagcaggtacgccagccaggtcaccaggttaagcccgagcaaggtcagtaccagcaacgccaggggcggcaccagcaagtccagggtcaaggccgccaggctagcgttacgctgggtgatggcagccatcgcccAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTg < 1:640407‑M2/26‑1 (MQ=255) aGGATGTGAAGCTGGGCCTGGACCTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTgcc > 1:317446/1‑235 (MQ=255) tGGACCTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAg > 2:453455/1‑173 (MQ=255) ccAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTggcgg < 1:532834/182‑1 (MQ=255) gCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCt > 2:381816/1‑235 (MQ=255) cTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGc > 2:15873/1‑155 (MQ=255) tttCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGAcc < 1:557127/235‑1 (MQ=255) tGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACctg < 2:637750/233‑1 (MQ=255) ccccGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCCGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTggcgg < 2:703598/155‑1 (MQ=255) ggtacgccagccaggtcacaaggttaagcccgagcaaggtcagtaccagcaacgccaggggcggcaccagcaagtccagggtcaaggccgccaggctagcgttacgctgggtgatggcagccatcgcccAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGt < 1:34372‑M2/43‑1 (MQ=255) ccACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGgcgc > 2:223972/1‑235 (MQ=255) gggCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCCTCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGCTCGCTGCCATCACCCAGCGTACCGCt > 2:47564/1‑103 (MQ=255) cTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGt < 1:170065/223‑1 (MQ=255) cagcaacgccaggggcggcaccagcaagtccagggtcaaggccgccaggctagcgttacgctGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCtggg < 1:701125‑M1/55‑2 (MQ=255) ccGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCCCCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACctggctg < 1:180679/172‑1 (MQ=255) ggAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCCCCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTg < 1:149777/236‑1 (MQ=255) accagcaagtccagggtcaaggccgccaggctagcgttacgctGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTTGTGACCTGGCTGGCGTAcc < 1:34372‑M1/129‑1 (MQ=255) cccagggtcaaggccgccaggctagcgttacgctgggtgatggcagccatcgcccAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTg < 1:701125‑M2/62‑1 (MQ=255) gggCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCggg < 1:584603/130‑1 (MQ=255) gggCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCggg > 2:584602/1‑130 (MQ=255) caaggccgccaggctagcgttacgctGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCGTGGTGTTGGCCTgg < 1:640407‑M1/209‑1 (MQ=255) cTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCGTGGTGTTGGCCTGGgcgcg < 2:397847/233‑1 (MQ=255) GGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCt > 2:676140‑M1/1‑165 (MQ=255) gATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGCCCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGTCCTTGCTGGCCCTTGCCgtggc > 2:252861/1‑194 (MQ=255) gATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCGTGGTGTTGGCCTGGGCGCGCTTCTGCCGTGAAGTGATACCGTtct < 1:223972/236‑1 (MQ=255) gATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCGTGGTGTTGGCCTGGGCGCGCTTCTGCCGTGAAGTGATACCGTtc > 1:328720/1‑235 (MQ=255) gCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCGTGGTGTTGGCCTGGGCGCGCTTCTGCCGTGAAGTGATACCGTtc > 2:697221/1‑231 (MQ=255) | AACCTGGCCAATGGTCATCTGGTCGAGGATGTGAAGCTGGGCCTGGACCTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCGTGGTGTTGGCCTGGGCGCGCTTCTGCCGTGAAGTGATACCGTTCT > AE015451/3556229‑3556661 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |