New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 3921023 = | 38 (0.950) | 3 (0.080) | 3/318 | NT | 9.1% | coding (743/1689 nt) | acs | Butyrate‑‑CoA ligase |
? | AE015451 | 3921136 = | 24 (0.630) | coding (630/1689 nt) | acs | Butyrate‑‑CoA ligase |
CATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACC > AE015451/3920794‑3921251 | catgctgcagggcctgctcccgggcctggccagcagccaaccgggtgcgctgatctgcgagcggttccccgaactgcgtggcgtggtcagcctggcgctgtcgccaccgccggggtttctggcctggcacgcattgcaggcccgtgccgaggttgtcagcggcgaggccctggccgcgcgccaggcacaactgcgttgcgacgacccgatcaacatccagtacacctcaGGcacc < 1:747343‑M1/6‑1 (MQ=255) agggcctgctcccgggcctggccaccagccaaccgggtgcgctgatctgcgagcggttccccgacctgcgtggcgtggtcagcctggcgctgtcgccaccgccggggtttctggcctggcacgcattgcaggcccgtgccgaggttgtcagcggcgaggccctggccgcgcgccaggcacaactgcgttgcgacgacccgatcaacatccagtacacctcaGGCaccacc > 1:240679‑M1/222‑230 (MQ=255) agggccggctcccgggcctggccagcagccaaccgggtgcgctgatctgcgagcggttccccgaactgcgtggcgtggtcagcctggcgctgtcgccaccgccggggtttctggcctggcacgcattgcaggcccgtgccgaggttgtcagcggcgaggccctggccgcgcgccaggcacaactgcgttgcgacgacccgatcaacatccagtacacctcagg > 1:245219‑M1/222‑223 (MQ=255) gTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATc < 1:649539/236‑1 (MQ=255) aGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTg > 2:673094/1‑233 (MQ=255) gCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCg > 1:635868/1‑235 (MQ=255) gATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTAc < 1:570924/236‑1 (MQ=255) cAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCgttg > 1:393014/1‑235 (MQ=255) ggCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAgg < 1:607182/235‑1 (MQ=255) aTGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATAtt < 1:284767/236‑1 (MQ=255) aTGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATAtt < 1:673095/236‑1 (MQ=255) aTGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATAtt < 1:484248/236‑1 (MQ=255) tCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGcc < 1:633542/168‑1 (MQ=255) tggcgctgtcgccaccgccggggtttctggcctggcacgcattgcaggcccgtgccgaggttgtcagcggcgaggccctggccgcgcgccaggcacaactgcgttgcgacgacccgatcaacatccagtacacctcaGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGata > 2:680452‑M1/138‑206 (MQ=255) ccgTGGCTTTTGCCGGCGCCACTGCGCGCGGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCg < 2:616589/153‑1 (MQ=255) aGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTggg > 2:669159/1‑234 (MQ=255) gTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATc > 2:748507/1‑152 (MQ=255) ggCTTTTTCCTTCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATAtt < 1:681481/204‑1 (MQ=255) tgtCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAg < 2:111355/155‑1 (MQ=255) gtCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAg < 1:107752/155‑1 (MQ=255) tccgcCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAAcc < 1:121463/225‑1 (MQ=255) tGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCgttgt < 1:471813/184‑1 (MQ=255) ccACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGAcc > 2:165854/1‑167 (MQ=255) cTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGc < 1:682261/195‑1 (MQ=255) gCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGGGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGt < 2:54485/159‑1 (MQ=255) gcattgcaggcccgtgccgaggttgtcagcggcgaggccctggccgcgcgccaggcacaactgcgttgcgacgacccgatcaacatccagtacacctcaGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTc > 1:558711‑M1/100‑140 (MQ=255) gcattgcaggcccgtgccgaggttgtcagcggcgaggccctggccgcgcgccaggcacaactgcgttgcgacgacccgatcaacatccagtacacctcaGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTc < 2:558710‑M1/41‑1 (MQ=255) ggTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATAtt < 1:107970/166‑1 (MQ=255) aaGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCt < 2:734020/204‑1 (MQ=255) tGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGcgcgcg < 1:669160/235‑1 (MQ=255) tGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATAtt > 2:291304/1‑133 (MQ=255) tGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATAtt < 1:291305/133‑1 (MQ=255) aGCCAGGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCCCCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGc < 1:172026/159‑1 (MQ=255) aGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGct > 1:54343/1‑192 (MQ=255) aGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGGGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGt > 2:248502/1‑200 (MQ=255) ccAAGGTTGGCCATGACAATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGt < 2:54343/175‑1 (MQ=255) ggTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCt < 2:299716/155‑1 (MQ=255) ggTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCg < 1:134636/236‑1 (MQ=255) aTGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGCTCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCgtt > 2:50131/1‑92 (MQ=255) cATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGgtcgt > 2:309679/1‑170 (MQ=255) cGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGc > 2:14612/1‑199 (MQ=255) cGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAAt > 1:627476/1‑233 (MQ=255) cGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGCGCTCGGCAAGGCCCAGGCTTTAACCGACCATGTACCCGTTGCTGCGGATATTGCTGTggtt > 2:5479/1‑101 (MQ=255) aGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTgccag > 1:319999/1‑236 (MQ=255) gcaccggcaccACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCg > 2:306359/1‑141 (MQ=255) ccggcaccACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAAcc < 2:635867/231‑1 (MQ=255) | CATGATCCCGGTGCGCAGGCTCGACAGGTCGAATTCACCACGCTGTGGATGGTCCAGTTCGGCAATGAACATGGTCGGCACGCCATACAGCGCAGTGGCTTTTTCCTGCGCCACTGCGCGCAGCGTGGCCAGCGGGTCGAAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACC > AE015451/3920794‑3921251 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |