New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 3921023 = | 38 (0.950) | 3 (0.080) | 3/318 | NT | 9.1% | coding (743/1689 nt) | acs | Butyrate‑‑CoA ligase |
? | AE015451 | 3921136 = | 24 (0.630) | coding (630/1689 nt) | acs | Butyrate‑‑CoA ligase |
AAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACCCCGGCGGTGGCGACAGCGCCAGGCTGACCACGCCACGCAGTTCGGGGAACCGCTCGCAGATCAGCGCACCCGGTTGGCTGCTGGCCAGGCCCGGGAGCAGGCCCTGCAGCATG > AE015451/3920933‑3921364 | aaGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCt < 2:734020/204‑1 (MQ=255) tGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGcgcgcg < 1:669160/235‑1 (MQ=255) aGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGct > 1:54343/1‑192 (MQ=255) aGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGGGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGt > 2:248502/1‑200 (MQ=255) ccAAGGTTGGCCATGACAATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGt < 2:54343/175‑1 (MQ=255) ggTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCt < 2:299716/155‑1 (MQ=255) ggTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCg < 1:134636/236‑1 (MQ=255) cATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGgtcgt > 2:309679/1‑170 (MQ=255) cGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGc > 2:14612/1‑199 (MQ=255) cGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAAt > 1:627476/1‑233 (MQ=255) aGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTgccag > 1:319999/1‑236 (MQ=255) gcaccggcaccACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCg > 2:306359/1‑141 (MQ=255) ccggcaccACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAAcc < 2:635867/231‑1 (MQ=255) CCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACCCCGGCGGTgg > 1:741870‑M1/1‑235 (MQ=255) ccCCAGCCGAGCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTCCCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTgg > 2:163465‑M1/3‑157 (MQ=255) gTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTGCCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGc < 1:220530/173‑1 (MQ=255) tAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACCCCGGCGGTGGCGACAGCGCCAGGCTGAccacg < 1:640014/236‑1 (MQ=255) cTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCt > 2:626348/1‑78 (MQ=255) cTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCt < 1:626349/78‑1 (MQ=255) tatcctcaacaacgggtacatggtcggtgaaagcctgggccttaccgagcacgatcggctggtggtgccTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACCCCGGCGGTGGCGACAGCGCCa > 2:680452‑M2/70‑206 (MQ=255) aTGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACCCCGGCGGTGGCGACAg > 1:567047/1‑197 (MQ=255) aTGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACCCCGGCGGTGGCGACAGCGCCAGGCt > 2:434816/1‑206 (MQ=255) ttgAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGCCAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGt > 2:132527/1‑154 (MQ=255) tGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACCCCGGCGGTGGCGACAGCGCCAGGCTGAccac > 2:747342/1‑190 (MQ=255) gaaagcctgggccttaccgagcacgatcggctggtggtgccTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGc > 1:558711‑M2/42‑140 (MQ=255) gaaagcctgggccttaccgagcacgatcggctggtggtgccTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGc < 2:558710‑M2/99‑1 (MQ=255) tgtgGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACCCCGGCGGTGGCGACAGCGCCAGGCTGACCACGCCACGCAGTTCGGGGAACCGc > 2:320078/1‑209 (MQ=255) tgtgGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACCCCGGCGGTGGCGACAGCGCCAGGCTGACCACGCCACGCAGTTCGGGGAACCGc < 1:320079/209‑1 (MQ=255) cTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACCCCGGCGGTGGCGACAGCGCCAGGCTGACCACGCCACGCAGTTCGGGGAACCGCTCGCAGATCAGCGCACCCGGTTGGCTGCTGGc > 1:5058/1‑236 (MQ=255) cccTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACCCCGGCGGt > 2:247087/1‑147 (MQ=255) cccTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACCCCGGCGGTGGCGa > 1:115227/1‑152 (MQ=255) cccTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACCCCGGCGGTGGCGACAGCGCCAGGCTGACCACGCCACGCAGTTCGGGGAACCGCt > 2:547214/1‑193 (MQ=255) gggAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACCCCGGCGGTGGCGACAGCGCCAGGCTGAccacgcca > 1:251498/1‑168 (MQ=255) ggtggtgccTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACCCCGGCGGTGGCGACAGCGCCAGGCTGACCACGCCACGCAGGTCGGGGAACCGCTCGCAGATCAGCGCACCCGGTTGGCTGGTGGCCAGGCCCGGGAGCAGGCCCt > 1:240679‑M2/10‑230 (MQ=255) ggtgccTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACCCCGGCGGTGGCGACAGCGCCAGGCTGACCACGCCACGCAGTTCGGGGAACCGCTCGCAGATCAGCGCACCCGGTTGGCTGCTGGCCAGGCCCGGGAGCAGGCCCTGCAGCATg < 1:747343‑M2/229‑1 (MQ=255) ccTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACCCCGGCGGTGGCGACAGCGCCAGGCTGACCACGCCACGCAGTTCGGGGAACCGCTCGCAGATCAGCGCACCCGGTTGGCTGCTGGCCAGGCCCGGGAGCCGGCCCt > 1:245219‑M2/3‑223 (MQ=255) | AAGGCATCGCTGGGGTAAATCAGTGCGCTGCCGTGTGTCATGCAGCCAAGGTTGGCCATGACCATGCCGAAGCAGTGGTACAGCGGCACCGGCACCACCAGCCGATCGTGCTCGGTAAGGCCCAGGCTTTCACCGACCATGTACCCGTTGTTGAGGATATTGCTGTGGCTAAGGGTGGCCCCCTTGGGGAAACCGGTGGTGCCTGAGGTGTACTGGATGTTGATCGGGTCGTCGCAACGCAGTTGTGCCTGGCGCGCGGCCAGGGCCTCGCCGCTGACAACCTCGGCACGGGCCTGCAATGCGTGCCAGGCCAGAAACCCCGGCGGTGGCGACAGCGCCAGGCTGACCACGCCACGCAGTTCGGGGAACCGCTCGCAGATCAGCGCACCCGGTTGGCTGCTGGCCAGGCCCGGGAGCAGGCCCTGCAGCATG > AE015451/3920933‑3921364 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |