New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 6130112 | 64 (1.600) | 4 (0.110) | 4/318 | NT | 6.2% | coding (321/783 nt) | PP_5378 | putative metal‑binding protein |
? | AE015451 | = 6130113 | 61 (1.610) | coding (320/783 nt) | PP_5378 | putative metal‑binding protein |
GTTGTGCATCTCACTTTCCCCACCACCGTGCTGGTGGCCGCCACTGGTTGTTACCAGGGCCTTGTACTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGAGGAAAGCATGCACAGCCGGGAAATGAGGGTCATCGGC > AE015451/6129887‑6130339 | gTTGTGCATCTCACTTTCCCCACCACCGTGCTGGTGGCCGCCACTGGTTGTTACCAGGGCCTTGTACTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGcaagattgg < 1:111382‑M2/236‑10 (MQ=255) tggtggCCGCCACTGGTTGTTACCAGGGCCTTGTACTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCCATCTTGGcaagat < 2:62063‑M2/202‑7 (MQ=255) tggtggCCGCCACTGGTTGTTACCAGGGCCTTGTACTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCg > 2:88678/1‑208 (MQ=255) tggtggCCGCCACTGGTTGTTACCAGGGCCTTGTACTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCg < 1:88678/208‑1 (MQ=255) gccgccACTGGTTGTTACCAGGGCCTTGTACTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGcaagat < 2:490481‑M2/197‑7 (MQ=255) cACTGGTTGTTACCAGGGCCTTGTACTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGa > 2:361790/1‑222 (MQ=255) cAGGGCCTTGTACTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCAgg > 2:211403/1‑192 (MQ=255) ccTTGTACTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAgg > 2:665594/1‑233 (MQ=255) ccTTGTACTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTg > 1:140437/1‑235 (MQ=255) ttGTGCTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCa < 1:207404/236‑1 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aaaGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGcaagattggtttaagcgatgaccccgcagctgcgttctggaccattaaac < 1:661508‑M2/177‑51 (MQ=255) cAGATGGACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAGTGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTaccggcacc < 2:129167/215‑1 (MQ=255) tACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAg > 1:653417/1‑236 (MQ=255) gATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTaccggcacc > 1:573487/1‑205 (MQ=255) 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tGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGAGGAAAGCATGCACAGCCg > 1:703455/1‑236 (MQ=255) ggggTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAg < 2:428934/156‑1 (MQ=255) ggTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGt < 2:435375/176‑1 (MQ=255) ggTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGAGGAAAGCATGcac < 2:531089/226‑1 (MQ=255) ggTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGAGGAAAGCATGCACAGCCGGGaaa > 1:600129/1‑236 (MQ=255) ggTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGCTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGt > 1:435376/1‑176 (MQ=255) tCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGCGGaa > 2:326917/1‑212 (MQ=255) gCTTAAACCTATCTTGccaagattggtttaagcgatggccccgcagctgcgttctggaccattaaacacggtatcaaggctaccggtatgcccgcttggggcaagagcatgggtg < 2:406656‑M1/115‑100 (MQ=255) ttAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGt < 2:459415/167‑1 (MQ=255) aCCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGTCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCACGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGAGGAAAGCATGCACAGCCGGGAAATGAGGGTCATCgg < 1:361791/236‑1 (MQ=255) aCCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATccc > 2:563772/1‑188 (MQ=255) aCCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGAGGAAAGCATGCACAGCCGGGAAATGAGGGTCATCgg > 1:555947/1‑236 (MQ=255) ccAATCTTGccaagattggtttaagcgatgaccccgcagctgcgttctggaccattaaacacggtatcaaggctaccggtatgcccgcttggggcaagagcatgggtgatcagtacatctggggtattgtcgctttccttgagcaaatgccgcagatgaacgcagagcagtacaaggccctggtaacaaccagtggcggccaccagcacggtggtggggaaagtgagatgcacaac < 1:111382‑M1/236‑228 (MQ=255) aTCTTGccaagattggtttaagcgatgaccccgcagctgcgttctggaccattaaacacggtatcaaggctaccggtatgcccgcttggggcaagagcatgggtgatcagtacatctggggtattgtcgctttccttgagcaaatgccgcagatgaacgcagagcagtacaaggccctggtaacaaccagtggcggc < 2:490481‑M1/197‑192 (MQ=255) aTCTTGccaagatgggtttaagcgatgaccccgcagctgcgttctggaccattaaacacggtatcaaggctaccggtatgcccgcttggggcaagagcatgggtgatcagtacatctggggtattgtcgctttccttgagcaaatgccgcagatgaacgcagagcagtacaaggccctggtaacaaccagtggcggccacca < 2:62063‑M1/202‑197 (MQ=255) aTCTTGTCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGt < 2:310146/159‑1 (MQ=255) cTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGAGGAAAGCATGcac < 2:566649/207‑1 (MQ=255) cTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCGCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTaccggcacc < 2:253862/108‑1 (MQ=255) | GTTGTGCATCTCACTTTCCCCACCACCGTGCTGGTGGCCGCCACTGGTTGTTACCAGGGCCTTGTACTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGAGGAAAGCATGCACAGCCGGGAAATGAGGGTCATCGGC > AE015451/6129887‑6130339 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |