New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 1950624 | 23 (0.580) | 3 (0.080) | 3/320 | NT | 11.6% | coding (822/1788 nt) | asnB | asparagine synthetase |
? | AE015451 | = 1950673 | 24 (0.630) | coding (773/1788 nt) | asnB | asparagine synthetase |
ACTGGTGGTGACGGGTGCCGTAGTGTTTGGCGATCAGGTCCGAATACTGGAACTCGTCGCCGCGCTCGCCGCCGGCATCTTCAAAGCCGATGGAGAAGGTCGACAGGTCGTCAACGCCCACTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGTTCACGCTCGTCGGGGTGGGGGCCGTAGTGCAGTTGCCACCAGACCTGGCGTTCCACTTCGCCATGGCGGTCGATGCGCATCCAGGTGCCGGGCTCCAGCTTCTGCACGTTGGCCAGCAGGGTGCGCGGTGCCGGTACCACGGCGTGGAAATTCAGGTAGTGGTTGAGGGCCACCGGGTC > AE015451/1950464‑1950905 | aCTGGTGGTGACGGGTGCCGTAGTGTTTGGCGATCAGGTCCGAATACTGGAACTCGTCGCCGCGCTCGCCGCCGGCATCTTCAAAGCCGATGGAGAAGGTCGACAGGTCGTCAACGCCCACTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCg < 1:378091/227‑1 (MQ=255) gtgACGGGTGCCGTAGTGTTTGGCGATCAGGTCCGAATACTGGAACTCGTCGCCGCGCTCGCCGCCGGCATCTTCAAAGCCGATGGAGAAGGTCGACAGGTCGTCAACGCCCACTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGggtg > 1:551000/1‑235 (MQ=255) tgACGGGTGCCGTAGTGTTTGGCGATCAGGTCCGAATACTGGAACTCGTCGCCGCGCTCGCCGCCGGCATCTTCAAAGCCGATGGAGAAGGTCGACAGGTCGTCAACGCCCACTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGggtggt < 1:285044/236‑1 (MQ=255) cGTAGTGTTTGGCGATCAGGTCCGAATACTGGAACTCGTCGCCGCGCTCGCCGCCGGCATCTTCAAAGCCGATGGAGAAGGTCGACAGGTCGTCAACGCCCACTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTg > 1:724082/1‑206 (MQ=255) ggCGATCAGGTCCGAATACTGGAACTCGTCGCCGCGCTCGCCGCCGGCATCTTCAAAGCCGATGGAGAAGGTCGACAGGTCGTCAACGCCCACTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCg > 2:688670/1‑199 (MQ=255) cGATCAGGTCCGAATACTGGAACTCGTCGCCGCGCTCGCCGCCGGCATCTTCAAAGCCGATGGAGAAGGTCGACAGGTCGTCAACGCCCACTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGtt > 1:43886/1‑234 (MQ=255) cGAATACTGGAACTCGTCGCCGCGCTCGCCGCCGGCATCTTCAAAGCCGATGGAGAAGGTCGACAGGTCGTCAACGCCCACTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGTTCACGCTCGTCgg < 1:448975/236‑1 (MQ=255) tGGCACTCGTCGCCGCGCTCGCCGCCGGCATCTTCAAAGCCGATGGAGAAGGTCGACAGGTCGTCAACGCCCACTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGTTCACGCtc < 1:151495/224‑1 (MQ=255) cgccgcGCTCGCCGCCGGCATCTTCAAAGCCGATGGAGAAGGTCGACAGGTCGTCAACGCCCACTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGTTCACGCTCGTCGGGGGGGGGGCCg > 1:152460/1‑230 (MQ=255) gccgcGCTCGCCGCCGGCATCTTCAAAGCCGATGGAGAAGGTCGACAGGTCGTCAACGCCCACTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGGTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGggtg > 1:75876/1‑184 (MQ=255) ccgcGCTCGCCGCCGGCATCTTCAAAGCCGATGGAGAAGGTCGACAGGTCGTCAACGCCCACTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGTTCACGCTCGGCGGGGTGGGGGCCGTAGTGCa > 1:700446/1‑235 (MQ=255) gccgccGGCATCTTCAAAGCCGATGGAGAAGGTCGACAGGTCGTCAACGCCCACTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTAcg < 2:121723‑M2/145‑3 (MQ=255) gtCAAAGCCGATGGAGAAGGTCGACAGGTCGTCAACGCCCACTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCAcg < 1:82327/156‑1 (MQ=255) gaAGGTCGACAGGTCGTCAACGCCCACTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGTTCACGCTCGTCGGGGTGGGGGCCGTAGTGc < 1:346579/199‑1 (MQ=255) cGACAGGTCGTCAACGCCCACTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTAcggcgtcgcgggtggcgtcgattccagcctgctggtcggcttgctgcgcgaagtgggcgttgacgacctgtcgaccttctc > 2:724081‑M2/1‑110 (MQ=255) cGCCCACTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGTTCACGCTCGTCGGGGTGGGGGCCGTAGTGCAGTTGCCACCAGACCTGGCGTTCCACTTCGCCATGGCGGTCGATGCGCATCCAGGt < 1:688671/235‑1 (MQ=255) aCTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGTTCACGCTCGTCGGGGTGGGGGCCGTAGTGCAGTTGCCACCAGACCTGGCGTTCCACGTCGCCATGGCGGGCGATGCGCATCCAGGGGCCgg > 1:186142/1‑235 (MQ=255) ttCGCGCAGCAAGCCGCCCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGTTCACGCTCGTCGGGGTGGGGGCCGTAGTGCAGTTGCCACCAGACCTGGCGTTCCACTTCGCCATGGCGGTCGATGCGCATCCAGGTGCCGGGc < 1:128170/235‑1 (MQ=255) agcaAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTAcggcgtcgattccagcctgctggtcggcttg > 2:665016‑M2/1‑82 (MQ=255) ccAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACCCCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTCcggcgtcggttccagcctgctggtcggcttgctgcgcgaagtgggcgttgacgacctgtcgaccttctccatcg > 1:234586‑M2/1‑72 (MQ=255) aTCGCCGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGTTCACGCTCGTCGGGGTGGGGGCCGTAGTGCAGTTGCCACCAGACCTGGCGTTCCACTTCGCCATGGCGGTCGATGCGCATCCAGGTGCCGGGCTCCAGCTTCTGCACGTTGGCCAGCAGGGTgc < 1:601334/236‑1 (MQ=255) aCGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGTTCACGCTCGTCGGGGTGGGGGCCGTAGTGCAGTTGCCACCAGACCTGGCGTTCCACTTCGCCATGGCGGTCGATGCGCATCCAGGTGCCGGGCTCCAGCTTCTGCACGTTGGCCAGCAGGGTGCGCgg < 1:9532/236‑1 (MQ=255) gccgccGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGGGCACGCGGGTGGTCCAGCCt < 2:153454/94‑1 (MQ=255) ccccaTCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGTTCACGCTCGTCGGGGTGGGGGCCGTAGTGCAGTTGCCACCAGACCTGGCGTTCCACTTCGCCATGGCGGTCGATGCGCATCCAGGTGCCGGGCTCCAGCTTCTGCACGTTGGCCAGCAGGGTg < 2:152460/206‑1 (MQ=255) ccACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGTTCACGCTCGGCGGGGTGGGGGCCGTAGTGCAGTTGCCACACGACCTGGCGTTCCACTTCGCCATGGCgggc > 2:16133/1‑155 (MQ=255) gtCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGTTCACGCTCGTCGGGGTGGGGGCCGTAGTGCAGTTGCCACCAGACCTGGc < 2:54661/130‑1 (MQ=255) tCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGTTCACGCTCGTCGGGGTGGGGGCCGTAGTGCAGTTGCCACCAGACCTGGCGTTCCACTTc < 2:499812/140‑1 (MQ=255) gACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGTTCACGCTCGTCGGGGTGGGGGCCGTAGTGCAGTTGCCACCAGACCTGGCGTTCCACTTCGCCATGGCGGTCGATGCGCATCCAGGTGCCGGGCTCCAGCTTCTGCACGTTGGCCAGCAGGGTGCGCGGTGCCGGTACCACGGCGTGGAAATTCAgg < 1:425751/235‑1 (MQ=255) cTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGTTCACGCTCGTCGGGGTGGGGGCCGTAGTGCAGTTGCCACCAGACCTGGCGTTCCACTTCGCCATGGCGGTCGATGCGCATCCAGGTGCCGGGCTCCAGCTTCTGCACGTTGGCCAGCAGGGTGCGCGGTGCCGGTACCACGGCGTGGAAATTCAGGTAGTGGTTGAGGGCCACCGGGTc > 1:685104/1‑235 (MQ=255) | ACTGGTGGTGACGGGTGCCGTAGTGTTTGGCGATCAGGTCCGAATACTGGAACTCGTCGCCGCGCTCGCCGCCGGCATCTTCAAAGCCGATGGAGAAGGTCGACAGGTCGTCAACGCCCACTTCGCGCAGCAAGCCGACCAGCAGGCTGGAATCGACGCCGCCGGACAGCAACACACCCACATCGACGGCTGCCCGTTGGCGGATGGCTACGGCGTCGCGGGTGGCGTCGAGCACGCGGGTGGTCCAGCCTTCCAGGTCCAGTTCACGCTCGTCGGGGTGGGGGCCGTAGTGCAGTTGCCACCAGACCTGGCGTTCCACTTCGCCATGGCGGTCGATGCGCATCCAGGTGCCGGGCTCCAGCTTCTGCACGTTGGCCAGCAGGGTGCGCGGTGCCGGTACCACGGCGTGGAAATTCAGGTAGTGGTTGAGGGCCACCGGGTC > AE015451/1950464‑1950905 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |