New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 3208442 | 20 (0.500) | 3 (0.080) | 3/314 | NT | 10.4% | coding (2091/2415 nt) | PP_2812 | putative Transporter |
? | AE015451 | = 3208493 | 33 (0.880) | coding (2142/2415 nt) | PP_2812 | putative Transporter |
CCATGCTGCTGTATGTCTATGCCGCGATCGCGCTGCTGGTGTTCGCCGTCTACCGCGACCTGCGGGCAGTGCTGGTTTGTTGCCTGCCTTTGACCATCGGCACCTTCATCGGCTACTGGTTCATGAAGGAACTGCAGATCGGCCTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAGCTGCTGGCCTTCATGTTCATCGTCAACATGGTCATGGCCATGACCGTGCTGCCGGCCTTCGCGGTCTGGCTGGAGCGGGTATTCCCACGTA > AE015451/3208258‑3208728 | ccATGCTGCTGTATGTCTATGCCGCGATCGCGCTGCTGGTGTTCGCCGTCTACCGCGACCTGCGGGCAGTGCTGGTTTGTTGCCTGCCTTTGACCATCGGCACCTTCATCGGCTACTGGTTCATGAAGGAACTGCAGATCGGCCTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTg < 1:641782/236‑1 (MQ=255) cTATGCCGCGATCGCGCTGCTGGTGTTCGCCGTCTACCGCGACCTGCGGGCAGTGCTGGTTTGTTGCCTGCCTTTGACCATCGGCACCTTCATCGGCTACTGGTTCATGAAGGAACTGCAGATCGGCCTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGt > 2:484963/1‑233 (MQ=255) cgcgATCGCGCTGCTGGTGTTCGCCGTCTACCGCGCCCTGCGGGCAGTGCTGGTTTGTTGCCTGCCTTTGACCATCGGCACCTTCATCGGCTACTGGTTCACGAAGGAACTGCAGATCGGCCTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTCCAACTGCACCTGgcccacg > 1:464642‑M2/1‑214 (MQ=255) ctgGTGTTCGCCGTCTACCGCGGCCTGCGGGCAGTGCTGGTTTGTTGCCTGCCTTTGACCATCGGCACCTTCATCGGCTACTGGTTCATGAAGGAACTGCAGATCGGCCTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCa < 1:530585/236‑1 (MQ=255) tgGTGTTCGCCGTCTACCGCGACCTGCGGGCAGTGCTGGTTTGTTGCCTGCCTTTGACCATCGGCACCTTCATCGGCTACTGGTTCATGAAGGAACTGCAGATCGGCCTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCAc < 1:389274/236‑1 (MQ=255) ggTGTTCGCCGTCTACCGCGACCTGCGGGCAGTGCTGGTTTGTTGCCTGCCTTTGACCATCGGCACCTTCATCGGCTACTGGTTCATGAAGGAACTGCAGATCGGCCTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCAc < 1:553644/235‑1 (MQ=255) cTACCGCGACCTGCGGGCAGTGCTGGTTTGTTGCCTGCCTTTGACCATCGGCACCTTCATCGGCTACTGGTTCATGAAGGAACTGCAGATCGGCCTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGCCTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGgcccac > 2:588083‑M2/1‑187 (MQ=255) ccGCGACCTGCGGGCAGTGCTGGTTTGTTGCCTGCCTTTGACCATCGGCACCTTCATCGGCTACTGGTTCATGAAGGAACTGCAGATCGGCCTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACCTCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTTgcccacggcac < 2:34668‑M2/195‑12 (MQ=255) ccGCGACCTGCGGGCAGTGCTGGTTTGTTGCCTGCCTTTGACCATCGGCACCTTCATCGGCTACTGGTTCATGAAGGAACTGCAGATCGGCCTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCAc < 2:502732/220‑1 (MQ=255) tcgttTGTTGCCTGCCTTTGCCCCTCGGCACCTTCATCGGCTACTGGTTCATGAAGGAACTGCAGCTCGGCCTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCCACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGgcccacggccaacaccatcaccggcaaggtagcaatggtcaggccgatctgcagttccttcatgaacc > 1:453446‑M2/3‑164 (MQ=255) gCACCTTCATCGGCTACTGGTTCATGAAGGAACTGCAGATCGGCCTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCg > 2:739970/1‑231 (MQ=255) cACCTTCATCGGCTACTGGTTCATGAAGGAACTGCAGATCGGCCTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCg > 1:508657/1‑191 (MQ=255) tGGTTCATGAAGGAACTGCAGATCGGCCTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCg > 1:562369/1‑151 (MQ=255) gTTCATGAAGGAACTGCAGATCGGCCTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTgg < 1:507116/170‑1 (MQ=255) ttCATGAAGGAACTGCAGATCGGCCTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCGCGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGCGGt > 2:684116/1‑167 (MQ=255) aGATCGGCCTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGGTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGc > 1:223854/1‑199 (MQ=255) ccTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGa > 2:100559/1‑141 (MQ=255) gACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGgcccac < 1:363438‑M2/97‑7 (MQ=255) gACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGgcccac > 2:363437‑M2/1‑91 (MQ=255) cATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAgctgc < 1:484964/236‑1 (MQ=255) tGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATgg < 1:352301/224‑1 (MQ=255) gCCGGGGATGGGGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACACCCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGcc < 2:634463/208‑1 (MQ=255) gTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTCCGCCTTCTACATCTACAGCCGGCTGCAACTGCCCCTGgcccacggccagcaccatcaccggcaaggtagcaat > 2:416841‑M2/1‑72 (MQ=255) tGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAGCTGCTGGCCTTCATGTTCATCGTCAACATg < 1:452712/236‑1 (MQ=255) gggCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAGCTGCTGGCCTTCATGTTCATCGTCAACATGGTCATg > 2:450240/1‑235 (MQ=255) ggCAATGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAGCTGCTGGCCTTCATGTTCATCGTCAACATg < 2:408256/228‑1 (MQ=255) gccATGGGTGTCGACTACCCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCCCGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCAtt < 1:249137/130‑1 (MQ=255) cATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAGCTGCTGGCCTTCATGTTCATCGTCAACATGGTCATGGcc > 1:244741/1‑235 (MQ=255) gACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAGCTGCTGGCCTTCATGTTCATCGTCAACATg < 1:34668/216‑1 (MQ=255) aCTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAGCTGCTGGCCtt > 2:690006/1‑196 (MQ=255) aCGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGAc > 1:212857/1‑173 (MQ=255) cTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGgcccacggcca < 2:598571‑M2/45‑12 (MQ=255) cTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGgcccacggcca > 1:598572‑M2/1‑34 (MQ=255) cTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAGCTGCTGGCCTTCATGTTCATCGTCAACATGGTCAt < 1:475110/213‑1 (MQ=255) cTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAGCTGCTGGCCTTCATGTTCATCGTCAACATGGTCAt > 2:475109/1‑213 (MQ=255) cTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAGCTGCTGGCCTTCATGTTCATCGTCAACATGGTCATGGCCATGACCGTGCTGCCGGCCt > 1:215342/1‑236 (MQ=255) catctacaACCGGCTGCAACTGCACCTGgcccacggccaacaccatcaccggcaaggtagcaatggtcaggccgatctgcagttccttcatgaaccagtagacgatgaag < 2:10864‑M2/110‑83 (MQ=255) aaCCGGCTGCAACTGCAGCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCa > 2:604785/1‑60 (MQ=255) aCCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAGCTGCTGGCCTTCATGTTCATCGTCAACATGGTCATGGCCATGACCGTGCTGCCGGCCTTCGCGGTctggct < 1:690007/235‑1 (MQ=255) ccGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCCAGCTGCTGGCCtt > 2:563147/1‑174 (MQ=255) ccGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAGCTGCTGGCCTTCATGTTCATCGTCAACATGGTCATGGCCATGACCGtgc > 2:410533/1‑212 (MQ=255) ggCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAGCTGCTGGCCTTCATGTTc > 2:503545/1‑179 (MQ=255) gCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAGCTGCTGGCCTTCATGTTCATCGTCAACATGGTCAt < 2:743334/192‑1 (MQ=255) gCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAGCTGCTGGCCTTCATGTTCATCGTCAACATGGTCAt > 1:743335/1‑192 (MQ=255) tGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAGCTGCTGGCCTTCATGTTCATCGTCAACATGGTCATGGCCATGACCGTGCTGCCGGCCTTCGCGGTCTGGCTGGAGCGGGTATTc < 1:535952/236‑1 (MQ=255) ggCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAGCTGCTGGCCTTCATGTTCATCGTCAACATGGTCATGGCCATGACCGTGCTGCCGGCCTTCGCGGTCTGGCTGGAGCGGGTATTCCCACGTa > 1:743347/1‑236 (MQ=255) | CCATGCTGCTGTATGTCTATGCCGCGATCGCGCTGCTGGTGTTCGCCGTCTACCGCGACCTGCGGGCAGTGCTGGTTTGTTGCCTGCCTTTGACCATCGGCACCTTCATCGGCTACTGGTTCATGAAGGAACTGCAGATCGGCCTGACCATTGCTACCTTGCCGGTGATGGTGTTGGCCGTGGGCATTGGTGTCGACTACGCCTTCTACATCTACAACCGGCTGCAACTGCACCTGGCCCACGGCCAGTCGATCACCAAGGCGGTCGAGCACGCATTGCTCGAGGTGGGCGTTGCGACGATCTTCACCGCCATTACCCTGGCGGTGGGCGTGGCTACCTGGGCGTTCTCGGAGCTCAAGTTCCAGGCCGACATGGGCAAGCTGCTGGCCTTCATGTTCATCGTCAACATGGTCATGGCCATGACCGTGCTGCCGGCCTTCGCGGTCTGGCTGGAGCGGGTATTCCCACGTA > AE015451/3208258‑3208728 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |