| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 378076 = | 81 (1.310) | 4 (0.070) | 4/318 | NT | 5.9% | intergenic (+19/+46) | PP_0314/gbcA | conserved protein of unknown function/putative glycine‑betaine dioxygenase subunit |
| ? | AE015451 | 378109 = | 53 (0.930) | intergenic (+52/+13) | PP_0314/gbcA | conserved protein of unknown function/putative glycine‑betaine dioxygenase subunit | |||||
CGCTGGAGGCATCAGCGCTTCATTGAGTATTGGTACGGCTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGACGGCGGTC > AE015451/377841‑378301 | cccgagaacatgcgcaaggtgtgggacgccaccaacgaccaggaccgccgtctggccgaagagaaccagcgtgggatcaactccacggcgtaccagccgggcccgtattcgaagacttacgagtttggtgtggtgaacttcattgactggtacagcgggcgcgtgctgaacaacctgggggcagagccggcgccatacctgaaagaagtgcaggcgccgtagtaacggatgcaccc < 1:364176‑M1/1‑1 (MQ=255)cccgagaacatgcgcaaggtgtgggacgccaccaacgaccaggaccgccgtctggccgaagagaaccagcgtgggatcaactccacggcgtaccagccgggcccgtattcgaagacttacgagtttggtgtggtgaacttcattgactggtacagcgggcgcgtgctgaacaacctgggggcagagccggcgccatacctgaaagaagtgcaggcgcagtagtaactgatgcaccc < 1:340869‑M1/1‑1 (MQ=255) gCTGGAGGCATCAGCGCTTCATTGAGTATTGGTACGGCTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAgcg > 1:641778/1‑236 (MQ=255) acatgcgcaaggtgtgggacgccaccaacgaccaggaccgccgtctggccgaagagaaccagcgtgggatcaactccacggcgtaccagccgggcccgtattcgaagacttacgagtttggtgtggtgaacttcattgactggtacagcgggcgcgtgctgaacaacctgggggcagagccggcgccatacctgaaagaagtgcaggcgcagtagtaactgatgcaccCGCCATg < 1:724597‑M1/7‑1 (MQ=255) acatgcgcaaggtgtgggacgccaccaacgaccaggaccgccgtctggccgaagagaaccagcgtgggatcaactccacggcgtaccagccgggcccgtattcgaagacttacgagtttggtgtggtgaacttcattgactggtacagcgggcgcgtgctgaacaacctgggggcagagccggcgccatacctgaaagaagtgcaggcgcagtagtaactgatgcaccCGCCATg < 1:39608‑M1/7‑1 (MQ=255) acatgcgcaaggtgtgggacgccaccaacgaccaggaccgccgtctggccgaagagaaccagcgtgggatcaactccacggcgtaccagccgggcccgtattcgaagacttacgagtttggtgtggtgaacttcattgactggtacagcgggcgcgtgctgaacaacctgggggcagagccggcgccatacctgaaagaagtgcaggcgcagtaggaactgatgcaccCg < 1:382675‑M1/2‑1 (MQ=255) tGAGTATTGGTACGGCTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAtcgc > 2:810281/1‑215 (MQ=255) aTTGGTACGGCTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCAt < 1:468152/236‑1 (MQ=255) aTTGGTACGGCTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCAt < 1:810282/236‑1 (MQ=255) aTTGGTACGGCTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCAt < 1:258041/236‑1 (MQ=255) tACGGCTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGc > 2:557439/1‑234 (MQ=255) cGGCTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCgg > 1:867098/1‑234 (MQ=255) cGGCTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGt > 1:1087516/1‑236 (MQ=255) cTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGt < 2:968544/233‑1 (MQ=255) cTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGt < 2:1080293/233‑1 (MQ=255) cTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGt < 2:496892/233‑1 (MQ=255) cTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTAATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCggg > 1:625391/1‑232 (MQ=255) aCCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGc < 2:420009/227‑1 (MQ=255) cgcgcgGTTGATTACACCGGAATCCGAGTTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCAt < 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cacCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGt < 1:908603/215‑1 (MQ=255) cacCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCt < 1:662156/236‑1 (MQ=255) tCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCa < 1:555775/199‑1 (MQ=255) ccGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGt < 1:969258/206‑1 (MQ=255) gCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATgg > 1:897355/1‑235 (MQ=255) cTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCggg > 2:1021875/1‑192 (MQ=255) ggggTTGAGTTGGGGGTGGCCTCATTCGCGACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGt < 2:9837/191‑1 (MQ=255) ggTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCg < 1:1003280/235‑1 (MQ=255) gTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCg < 1:929381/234‑1 (MQ=255) cTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTctgc > 1:673095/1‑154 (MQ=255) cTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTctgc < 2:673094/154‑1 (MQ=255) tCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGt > 2:898409/1‑179 (MQ=255) aTTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTc < 2:933262/144‑1 (MQ=255) 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ttATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGCAcc < 2:592300/232‑1 (MQ=255) tATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCgg < 1:440825/193‑1 (MQ=255) cGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCa < 1:1121575/225‑1 (MQ=255) ggATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCg > 1:924542/1‑180 (MQ=255) 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gTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGtt > 1:760093/1‑187 (MQ=255) gTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGtt < 2:760092/187‑1 (MQ=255) gTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTaa > 2:104648/1‑206 (MQ=255) gTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGccc > 1:804098/1‑224 (MQ=255) gTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGcc > 1:534917/1‑236 (MQ=255) cagagccggcgccatacctgaaagaagtgcaggcgcagtagtaactgatgcaccCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGCAGCATGGCgg < 2:213091‑M1/34‑1 (MQ=255) ggCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCg > 1:869597/1‑235 (MQ=255) gCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTactact > 1:361968/1‑102 (MQ=255) ttATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGa > 1:790075/1‑236 (MQ=255) ccggcgccatacctgaaagaagtgcaggcgcagtagtaactgatgcaccCGCCATGCTTCGGTCTGATGCCGAAGCATGGCg < 2:325801‑M1/33‑1 (MQ=255) tATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCt < 2:902128/222‑1 (MQ=255) tATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGc < 1:293028/229‑1 (MQ=255) catacctgaaagaagtgcaggcgcagtagtaactgatgcaccCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTcaccacac < 2:716640‑M1/141‑1 (MQ=255) tacgtacgGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATc < 1:899565/235‑1 (MQ=255) tACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGct > 1:337771/1‑113 (MQ=255) cAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTg < 2:337770/202‑1 (MQ=255) gCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCgggg > 2:276346/1‑60 (MQ=255) ccTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGc > 2:560214/1‑138 (MQ=255) ccTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGt > 1:816565/1‑178 (MQ=255) ccTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGt < 1:541969/201‑1 (MQ=255) gaTGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGa > 1:1081947/1‑236 (MQ=255) tggtgTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCgg > 2:364175/1‑45 (MQ=255) tggtgTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGcc < 1:61768/193‑1 (MQ=255) tggtgTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGAcggcgg < 1:676234/235‑1 (MQ=255) gtgtGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGACGGCGGTc < 1:712609/235‑1 (MQ=255) tgAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGtt > 1:617930/1‑211 (MQ=255) accCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACGACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTtcc < 2:729981‑M1/102‑2 (MQ=255) aaGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCggggg > 1:362614/1‑38 (MQ=255) | CGCTGGAGGCATCAGCGCTTCATTGAGTATTGGTACGGCTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGACGGCGGTC > AE015451/377841‑378301 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |