New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 378076 = | 81 (1.310) | 4 (0.070) | 4/318 | NT | 5.9% | intergenic (+19/+46) | PP_0314/gbcA | conserved protein of unknown function/putative glycine‑betaine dioxygenase subunit |
? | AE015451 | 378109 = | 53 (0.930) | intergenic (+52/+13) | PP_0314/gbcA | conserved protein of unknown function/putative glycine‑betaine dioxygenase subunit |
CGGCTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGACGGCGGTCCTGGTCGTTGGTGGCGTCCCACACCTTGCGCATGTTCTCGGGG > AE015451/377876‑378344 | cGGCTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCgg > 1:867098/1‑234 (MQ=255) cGGCTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGt > 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cTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTAATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCggg > 1:625391/1‑232 (MQ=255) gggcgGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGt < 1:8581/226‑1 (MQ=255) gcgGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTta > 1:687942/1‑236 (MQ=255) cacCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGt < 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tttGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCt < 1:313878/236‑1 (MQ=255) ttGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCggg > 2:265525/1‑155 (MQ=255) cTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCActtct < 1:1053011/178‑1 (MQ=255) cTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGc < 2:739314/217‑1 (MQ=255) ttATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGCAcc < 2:592300/232‑1 (MQ=255) tATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCgg < 1:440825/193‑1 (MQ=255) gtgtggtgaacttcattgactggtacagcgggcgcgtgctgaacaacctgggggcagagccggcgccatacctgaaagaagtgcaggcgcagtagtaactgatgcacccgccatgcttcggcagcagaccgaagcatggcgGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATg < 2:716640‑M2/42‑1 (MQ=255) cGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCa < 1:1121575/225‑1 (MQ=255) 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ccTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGc > 2:560214/1‑138 (MQ=255) ccTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGt > 1:816565/1‑178 (MQ=255) ccTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGt < 1:541969/201‑1 (MQ=255) gaTGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGa > 1:1081947/1‑236 (MQ=255) tggtgTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCgg > 2:364175/1‑45 (MQ=255) tggtgTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGcc < 1:61768/193‑1 (MQ=255) tggtgTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGAcggcgg < 1:676234/235‑1 (MQ=255) gtgtGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGACGGCGGTc < 1:712609/235‑1 (MQ=255) tgAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGtt > 1:617930/1‑211 (MQ=255) accCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACGACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTtcc < 2:729981‑M1/102‑2 (MQ=255) aaGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCggggg > 1:362614/1‑38 (MQ=255) ccgccatgctgcggcagcagaccgaagcatggcgGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTg < 2:213091‑M2/54‑1 (MQ=255) cgccatgcttcggcatcagaccgaagcatggcgGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCgg < 2:325801‑M2/49‑1 (MQ=255) GCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTtact < 1:149464‑M1/47‑1 (MQ=255) CATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGACGGCGGTCCTGGTCGTtg > 2:777313‑M1/1‑233 (MQ=255) ATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGt < 2:138236‑M1/32‑1 (MQ=255) GCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGACGGCGGTCCTGGTCGTtg > 2:720475‑M1/1‑230 (MQ=255) TTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGa > 2:379147‑M1/1‑152 (MQ=255) TTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGACGGCGGTCCTGGTCGTtg > 1:874382‑M1/1‑228 (MQ=255) tgcCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACggg < 2:477540/149‑1 (MQ=255) catggcgGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGACGGCGGTCCTGGTCGTTGGTGGCGTCCCACACCTTGCGCATGt < 1:724597‑M2/228‑1 (MQ=255) catggcgGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGACGGCGGTCCTGGTCGTTGGTGGCGTCCCACACCTTGCGCATGt < 1:39608‑M2/228‑1 (MQ=255) cgGGTGCATCAGTTCCTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGACGGCGGTCCTGGTCGTTGGTGGCGTCCCACACCTTGCGCATGt < 1:382675‑M2/228‑1 (MQ=255) gGGTGCATCCGTTACTACGGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGACGGCGGTCCTGGTCGTTGGTGGCGTCCCACACCTTGCGCATGTTCTCggg < 1:364176‑M2/235‑1 (MQ=255) gGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGACGGCGGTCCTGGTCGTTGGTGGCGTCCCACACCTTGCGCATGTTCTCggg < 1:340869‑M2/235‑1 (MQ=255) ggTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGACGGCGGTCCTGGTCGTTGGTGGCGTCCCACACCTTGCGCATGTTCTCgggg < 1:552053/236‑1 (MQ=255) ggTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGACGGCGGTCCTGGTCGTTGGTGGCGTCCCACACCTTGCGCATGTTCTCgggg < 1:1105816/236‑1 (MQ=255) | CGGCTACCGCGCGGTTGATTACACCGGAATCCGAGGTGTTGGCCTGGGTTGATTTTGGGGTGGCCTCATTCGCCACAGTTTTGTCAGCTTATGAGCTTTACGGATTGGCAACGTCGTCTGCCGAGCGGCGCTATCCCATACAGCCGGTGGCTTATGAGATACGTACGGGAGTACAGCCTTGAGATGCAGTGGTGTGAAAGCGCCATGCTTCGGTCTGCTGCCGAAGCATGGCGGGTGCATCAGTTACTACTGCGCCTGCACTTCTTTCAGGTATGGCGCCGGCTCTGCCCCCAGGTTGTTCAGCACGCGCCCGCTGTACCAGTCAATGAAGTTCACCACACCAAACTCGTAAGTCTTCGAATACGGGCCCGGCTGGTACGCCGTGGAGTTGATCCCACGCTGGTTCTCTTCGGCCAGACGGCGGTCCTGGTCGTTGGTGGCGTCCCACACCTTGCGCATGTTCTCGGGG > AE015451/377876‑378344 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |