| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 449057 = | 46 (0.740) | 6 (0.100) | 4/328 | NT | 12.5% | coding (228/1779 nt) | PP_0370 | Acyl‑CoA dehydrogenase family protein |
| ? | AE015451 | 449107 = | 40 (0.680) | coding (278/1779 nt) | PP_0370 | Acyl‑CoA dehydrogenase family protein | |||||
TTGTCATGGCTGACTATAAAGCGCCGCTGCGCGACATGCGCTTCGTACTGAATGAAGTCTTCAACGTGGCCGAGCAGTGGACGCAGTTGCCCGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAATACCTTCCGA > AE015451/448825‑449289 | tgcggctcggtcaggcacatggagccggcccaaacgccggcatacatgttcggaaggtatttttccttcaaggcctcgctggcgtgggcgttgatcgacaggcaggcgccggccgtcagcatcgggtacaggccgaaggccaggctggacgcgttgaccatttcctcgacctgggccgagatggccttgggcatacccataccgccgaacagcgggtcgccgcccacgcccaccca < 1:726032‑M1/4‑1 (MQ=255) cTATAAAGCGCCGCTGCGCGACATGCGCTTCGTACTGAATGAAGTCTTCAACGTGGCCGAGCAGTGGACGCAGTTGCCCGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTg < 1:390431/236‑1 (MQ=255) gccggcccaaacgccggcatacatgttcggaaggtatttttccttcaaggcctcgctggcgtgggcgttgatcgacaggcaggcgccggccgtcagcatcgggtacaggccgaaggccaggctggacgcgttgaccatttcctcgacctgggccgagatggccttgggcatacccataccgccgaacagcgggtcgccgcccacgcccac < 2:446878‑M1/1‑1 (MQ=255) gcTGCGCGACATGCGCTTCGTACTGAATGAAGTCTTCAACGTGGCCGAGCAGTGGACGCAGTTGCCCGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTacaaca > 1:689341/1‑236 (MQ=255) cTGCGCGACATGCGCTTCGTACTGAATGAAGTCTTCAACGTGGCCGAGCAGTGGACGCAGTTGCCCGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTacaa > 2:726031/1‑233 (MQ=255) tGCGCGACATGCGCTTCGTACTGAATGAAGTCTTCAACGTGGCCGAGCAGTGGACGCAGTTGCCCGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTacaa > 2:979226/1‑232 (MQ=255) gcgcTTCGTACTGAATGAAGTCTTCAACGTGGCCGAGCAGTGGACGCAGTTGCCCGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGa < 1:833283/234‑1 (MQ=255) cTGAATGAAGTCTTCAACGTGGCCGAGCAGTGGACGCAGTTGCCCGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAggcg > 1:661468/1‑229 (MQ=255) aCGTGGCCGAGCAGTGGACGCAGTTGCCCGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGGAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGAc > 1:634500/1‑236 (MQ=255) gCCGAGCAGTGGACGCAGTTGCCCGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAgg < 1:118624/206‑1 (MQ=255) aGCAGTGGACGCAGTTGCCCGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGcc > 1:934266/1‑197 (MQ=255) aCGCAGTTGCCCGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGtt > 1:748850/1‑163 (MQ=255) gcgtgggcgttgatcgccaggcaggcgccggccgtcagcatcgggtacaggccgaaggccaggctggacccgtttaccatttcctcgacctgggccgagatggccttgggcatacccataccgccgaacagcgggtcgccgcccacgcccaCCCAGCCGGTTTCATTGAAGcc > 2:202669‑M1/152‑173 (MQ=255) aGTTGCCCGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCggtatg < 2:661467/233‑1 (MQ=255) gtGCCCGGGCTGGCCGGGGGTGGCGATGCCGACACGGCCAGGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCgc < 2:77691/154‑2 (MQ=255) cccGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCggtatgg > 1:295242/1‑229 (MQ=255) ccGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGcc > 1:634729/1‑235 (MQ=255) gggCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGACGc > 2:751694/1‑161 (MQ=255) ggCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTcggcgg > 2:843286/1‑216 (MQ=255) aGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCg < 1:979227/236‑1 (MQ=255) aGGTTGGCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTg < 1:730493/203‑1 (MQ=255) aTGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGCGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTCCAACACCTACGcc > 2:194115/1‑158 (MQ=255) tGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGtt < 1:980578/195‑1 (MQ=255) gCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAAcg < 1:649118/235‑1 (MQ=255) ccGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGcc < 2:447692/203‑1 (MQ=255) tGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCaa < 2:38619/196‑1 (MQ=255) cTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAgg < 1:784538/211‑1 (MQ=255) tGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCAtt < 2:233133/113‑1 (MQ=255) ggAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTCTCAtt > 2:317097/1‑112 (MQ=255) ggagaagCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGcc < 1:223030/193‑1 (MQ=255) gaagaaGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGcc < 1:843287/235‑1 (MQ=255) gccaggctggacgcgttgaccatttcctcgacctgggccgagatggccttgggcatacccataccgccgaacagcgggtcgccgcccctgcccaccca < 2:1049668‑M1/4‑1 (MQ=255) ggCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCg > 2:550500/1‑235 (MQ=255) gCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCAtctc > 1:720084/1‑190 (MQ=255) gcgcCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGCTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCAtcg > 2:205685/1‑165 (MQ=255) aGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCCGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAggct > 2:248316/1‑96 (MQ=255) gccgcgccgcCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGAcggc > 1:1103669/1‑223 (MQ=255) ccgcgccgcCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCgcctgc < 1:143463/232‑1 (MQ=255) cgcgccgcCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAg > 1:769173/1‑168 (MQ=255) cgccgACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCg > 1:69455/1‑232 (MQ=255) aggaAGAGGGCGGCCACGGGGACAACGGCGCGGGGCGGCCCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAgg < 2:707785/151‑1 (MQ=255) cgaAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTc < 2:817280/187‑1 (MQ=255) cataccgccgaacagcgggtcgccgcccacgcccaCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGcc < 2:917248‑M1/37‑1 (MQ=255) cataccgccgaacagcgggtcgccgcccacgcccaCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGcc > 1:917249‑M1/36‑72 (MQ=255) aacagcgggtcgccgcccacgcccaCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACCACACCTACGCCGaa < 2:55413‑M1/40‑1 (MQ=255) aacagcgggtcgccgcccacgcccaCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCCCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCCACCTGGCCTTCGGCCCGTCCCCGa < 2:1134332‑M1/161‑1 (MQ=255) aCTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGt < 1:447217/151‑1 (MQ=255) aCAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGc < 2:1090105/163‑1 (MQ=255) aCAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCGGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCACCGCCCACGc > 1:332193/1‑220 (MQ=255) ggCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGaaaa > 1:811879/1‑236 (MQ=255) ggCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGaaaa > 1:673503/1‑236 (MQ=255) cgcgGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAAt > 1:291024/1‑236 (MQ=255) gcgGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTg > 2:125977/1‑177 (MQ=255) tGCGGACGCCAGCCGGTTTCATTGAGGCCTACAACCCCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAg < 2:441824/145‑1 (MQ=255) gcgccgaCCCGGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCt > 2:90162‑M1/8‑54 (MQ=255) ggACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACCACACCTACGCCGaa > 2:72083/1‑44 (MQ=255) aCCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAATACCTTCCGa > 1:447096/1‑235 (MQ=255) | TTGTCATGGCTGACTATAAAGCGCCGCTGCGCGACATGCGCTTCGTACTGAATGAAGTCTTCAACGTGGCCGAGCAGTGGACGCAGTTGCCCGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAATACCTTCCGA > AE015451/448825‑449289 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |