| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 449057 = | 46 (0.740) | 6 (0.100) | 4/328 | NT | 12.5% | coding (228/1779 nt) | PP_0370 | Acyl‑CoA dehydrogenase family protein |
| ? | AE015451 | 449107 = | 40 (0.680) | coding (278/1779 nt) | PP_0370 | Acyl‑CoA dehydrogenase family protein | |||||
ACGTGGCCGAGCAGTGGACGCAGTTGCCCGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAATACCTTCCGAACATGTATGCCGGCGTTTGGGCCGGCTCCATGTGCCTGACCGAGCCGCA > AE015451/448888‑449338 | aCGTGGCCGAGCAGTGGACGCAGTTGCCCGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGGAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGAc > 1:634500/1‑236 (MQ=255) aGTTGCCCGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCggtatg < 2:661467/233‑1 (MQ=255) cccGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCggtatgg > 1:295242/1‑229 (MQ=255) ccGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGcc > 1:634729/1‑235 (MQ=255) ggCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTcggcgg > 2:843286/1‑216 (MQ=255) aGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCg < 1:979227/236‑1 (MQ=255) aGGTTGGCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTg < 1:730493/203‑1 (MQ=255) tGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGtt < 1:980578/195‑1 (MQ=255) tcggggacgggccgaaggccaggtgggacgcgttgaccatttcctcgacctgggccgggatggccttgggcatacccataccgccgaacagcgggtcgccgcccacgcccacccagccgccttcggcgtaggtgttgtaggcttcaatgaaaccggctgggTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGtt < 2:1134332‑M2/25‑1 (MQ=255) gCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAAcg < 1:649118/235‑1 (MQ=255) ccGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGcc < 2:447692/203‑1 (MQ=255) tGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCaa < 2:38619/196‑1 (MQ=255) cTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAgg < 1:784538/211‑1 (MQ=255) ggagaagCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGcc < 1:223030/193‑1 (MQ=255) gaagaaGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGcc < 1:843287/235‑1 (MQ=255) ggCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCg > 2:550500/1‑235 (MQ=255) gCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCAtctc > 1:720084/1‑190 (MQ=255) gcgcCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGCTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCAtcg > 2:205685/1‑165 (MQ=255) gccgcgccgcCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGAcggc > 1:1103669/1‑223 (MQ=255) ccgcgccgcCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCgcctgc < 1:143463/232‑1 (MQ=255) cgcgccgcCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAg > 1:769173/1‑168 (MQ=255) cgccgACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCg > 1:69455/1‑232 (MQ=255) aggaAGAGGGCGGCCACGGGGACAACGGCGCGGGGCGGCCCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAgg < 2:707785/151‑1 (MQ=255) cgaAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTc < 2:817280/187‑1 (MQ=255) aacagcgggtcgccgcccacgcccaCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCCCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCCACCTGGCCTTCGGCCCGTCCCCGa < 2:1134332‑M1/161‑1 (MQ=255) aCTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGt < 1:447217/151‑1 (MQ=255) aCAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGc < 2:1090105/163‑1 (MQ=255) aCAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCGGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCACCGCCCACGc > 1:332193/1‑220 (MQ=255) ggCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGaaaa > 1:811879/1‑236 (MQ=255) ggCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGaaaa > 1:673503/1‑236 (MQ=255) cgcgGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAAt > 1:291024/1‑236 (MQ=255) gcgGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTg > 2:125977/1‑177 (MQ=255) tGCGGACGCCAGCCGGTTTCATTGAGGCCTACAACCCCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAg < 2:441824/145‑1 (MQ=255) aCCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAATACCTTCCGa > 1:447096/1‑235 (MQ=255) CCAGCCGGTTTCATTGAAGCCGACAACACCTACGCCGAGGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGAcggc > 2:346323‑M1/1‑170 (MQ=255) agccgccttcggcgtaggtgttgtaggcttcaatgaaaccggccgggtcggcgc > 2:90162‑M2/48‑53 (MQ=255) CGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGTGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCgcctgcct < 2:422‑M1/177‑1 (MQ=255) CGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACccgaggc < 2:199647‑M1/158‑4 (MQ=255) CGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGcctgcctg < 2:1115552‑M1/178‑1 (MQ=255) CGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACg < 2:787960‑M1/188‑1 (MQ=255) CGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAATACCTTCCGaa < 1:5200‑M1/228‑1 (MQ=255) CGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAATACCTTCCGAACATGTa < 2:481662‑M1/234‑1 (MQ=255) CGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAATACCTTCCGAACATGTAt < 1:30316‑M1/235‑1 (MQ=255) CGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAATACCTTCCGAACATGTATg < 1:94285‑M1/236‑1 (MQ=255) CGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAATACCTTCCGAACATGTATg > 1:550501‑M1/1‑236 (MQ=255) gTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCGGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCAtctc > 2:107212/1‑97 (MQ=255) ttcggcgtaggtgtggtaggcttcaatgaaaccggctgggTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGtt < 2:55413‑M2/25‑1 (MQ=255) ggcgtaggtgttgtaggcttcaatgaaaccggctgggTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCggtatg < 2:917248‑M2/35‑1 (MQ=255) ggcgtaggtgttgtaggcttcaatgaaaccggctgggTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCggtatg > 1:917249‑M2/38‑72 (MQ=255) aTTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGcctgcctg > 2:1002690/1‑171 (MQ=255) tGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAATACCTTCCGAACATGTATGCCGGCGttt < 1:125977/236‑1 (MQ=255) ccaacaCCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAATACCTTCCGAACATGTATGCCGGCGTTTGGGCCGGc < 2:783394/235‑1 (MQ=255) ggcttcaatgaaaccggctgggTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTAAACGGGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGGCGATCAACGCCCACGc > 2:202669‑M2/23‑173 (MQ=255) tACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGTGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAATACCTTCCGAACATGTATGCCGGCGTTTGGGCCGGc < 1:422/228‑1 (MQ=255) ccGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTcggcg > 2:1113752/1‑45 (MQ=255) ccGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTcggcg < 1:1113753/45‑1 (MQ=255) ccGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAACATACCTTCCGAACATGTATGCCGGCGTTTGGGCCGGCTCCATGTGCCt > 1:879726/1‑235 (MQ=255) gcggcTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGCAATGGTCAACGCGTCCAGCCTg > 2:251914/1‑101 (MQ=255) gcggcTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAATACCTTCCGAACATGTATGCCGGCGTTTGGGCCGGCTCCATGTGCCTGACCGAg > 1:508611/1‑236 (MQ=255) tgggTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAATACCTTCCGAACATGTATGCCGGCGTTTGGGCCGGCTCCATGTGCCTGACCGAGCCGCa < 1:726032‑M2/232‑1 (MQ=255) tgggTGGGCAGGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGc < 2:1049668‑M2/94‑1 (MQ=255) gTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAATACCTTCCGAACATGTATGCCGGCGTTTGGGCCGGc < 2:446878‑M2/209‑1 (MQ=255) ctgggcgtgggcgGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAATACCTTCCGAACATGTATGCCGGCGTTTGGGCCGGc < 2:879725/209‑1 (MQ=255) | ACGTGGCCGAGCAGTGGACGCAGTTGCCCGGGCTGGCCGAGGTTGTCGATGCCGACACGGCCATGGCCGTGCTGGAAGAAGCCGGCAAGGTCACCGCCAGGACCATTGCGCCGCTCAGCCGCGCCGCCGACGAAGAGGGCTGCCACTGGGACAACGGCGCGGTGCGGACCCCAGCCGGTTTCATTGAAGCCTACAACACCTACGCCGAAGGCGGCTGGGTGGGCGTGGGCGGCGACCCGCTGTTCGGCGGTATGGGTATGCCCAAGGCCATCTCGGCCCAGGTCGAGGAAATGGTCAACGCGTCCAGCCTGGCCTTCGGCCTGTACCCGATGCTGACGGCCGGCGCCTGCCTGTCGATCAACGCCCACGCCAGCGAGGCCTTGAAGGAAAAATACCTTCCGAACATGTATGCCGGCGTTTGGGCCGGCTCCATGTGCCTGACCGAGCCGCA > AE015451/448888‑449338 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |