| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 521092 = | 66 (1.070) | 4 (0.070) | 4/328 | NT | 6.2% | coding (204/1092 nt) | anmK | Anhydro‑N‑acetylmuramic acid kinase |
| ? | AE015451 | 521162 = | 58 (0.980) | coding (134/1092 nt) | anmK | Anhydro‑N‑acetylmuramic acid kinase | |||||
GGAAGGCCGGTACCAGTGGCGCGCCTTGGCCGCCGGCAGCCACATCGCGACGGCGGAAGTCGGCGACCACGCTGATGCCGGTCAGTTCGGCGAGCAGTGCGGGGTTACCGATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTG > AE015451/520857‑521326 | ggAAGGCCGGTACCAGTGGCGCGCCTTGGCCGCCGGCAGCCACATCGCGACGGCGGAAGTCGGCGACCACGCTGATGCCGGTCAGTTCGGCGAGCAGTGCGGGGTTACCGATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAgg > 1:676558/1‑236 (MQ=255) caagaacgagcgtcagcgcttcctgcagcagagccagccgctgattgcccgtatggatcaggaaaaggccaccctgctcgcagcgaacaagcgctaagccatggcgctctacttgggggtgatgtccggcaccagcctcgatggcctggatatcgccctggtcgaacaaggcgagcagcttgaactgctcgccacccactacctgcccatgcccccggacctgcgccaggacctgc > 1:649384‑M1/235‑236 (MQ=255) agaacgagcgtcagcgcttcctgcagcagagccagccgctgattgcccgtatggatcaggaaaaggccaccctgctcgcagcgaacaagcgctaagccatggcgctctacttgggggtgatgtccggcaccagcctcgatggcctggatatcgccctggtcgaacaaggcgagcagcttgaactgctcgccacccactacctgcccatgcccccggacctgcgccaggacctgctg > 1:773743‑M1/233‑236 (MQ=255) agaacgagcgtcagcgcttcctgcagcagagccagccgctgattgcccgtatggatcaggaaaaggccaccctgctcgcagcgaacaagcgctaagccatggcgctctacttgggggtgatgtccggcaccagcctcgatggcctggatatcgccctggtcgaacaaggcgagcagcttgaactgctcgccacccactacctgcccatgcccccggacctgcgccaggacctgctg > 1:699251‑M1/233‑236 (MQ=255) agaacgagcgtcagcgcttcctgcagcagagccagccgctgattgcccgtatggatcaggaaaaggccaccctgctcgcagcgaacaagcgctaagccatggcgctctacttgggggtgatgtccggcaccagcctcgatggcctggatatcgccctggtcgaacaaggcgagcagcttgaactgctcgccacccactacctgcccatgcccccggacctgcgccaggacctgctg > 1:621654‑M1/233‑236 (MQ=255) agaacgagcgtcagcgcttcctgcagcagagccagccgctgattgcccgtatggatcaggaaaaggccaccctgctcgcagcgaacaagcgctaagccatggcgctctacttgggggtgatgtccggcaccagcctcgatggcctggatatcgccctggtcgaacaaggcgagcagcttgaactgctcgccacccactacctgcccatgcccccggacctgcgccaggacctgctg > 1:976712‑M1/233‑236 (MQ=255) catcagcgtGGCCGCCGGCAGCCACATCGCGACGGCGGAAGTCGGCGACCACGCTGATGCCGGTCAGTTCGGCGAGCAGTGCGGGGTTACCGATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGTTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTc > 1:664736/9‑235 (MQ=255) tcctgcagcagagccagccgctgattgcccgtatggatcaggaaaaggccaccctgctcgcagcgaacaagcgctaagccatggcgctctacttgggggtgatgtccggcaccagcctcgatggcctggatatcgccctggtcgaacaaggcgagcagcttgaactgctcgccacccactacctgcccatgcccccggacctgcgccaggacctgc > 1:594792‑M1/215‑216 (MQ=255) ccTTGGCCGCCGGCAGCCACATCGCGCGGGCGGAAGTCGGCGACCACGCTGATGCCGGTCAGTTCGGCGAGCAGTGCGGGGTTACCGATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGc < 1:91342/233‑1 (MQ=255) gccgccGGCAGCCACATCGCGACGGCGGAAGTCGGCGACCACGCTGATGCCGGTCAGTTCGGCGAGCAGTGCGGGGTTACCGATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGtgctg < 1:404638/236‑1 (MQ=255) ccgGCAGCCACATCGCGACGGCGGAAGTCGGCGACCACGCTGATGCCGGTCAGTTCGGCGAGCAGTGCGGGGTTACCGATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCgg < 1:241833/216‑1 (MQ=255) cgctgattgcccgtatggatcaggaaaaggccaccctgctcgcagcgaacaagcgctaagccatggcgctctacttgggggtgatgtccggcaccagcctcgatggcctggatatcgccctggtcgaacaaggcgagcagcttgaactgctcgccacccactacctgcccatgcccccggacctgcgccaggacctGCTGGCCCAGCGGTTTTc > 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ggaaaaggccaccctgctcgcagcgaacaagcgctaagccatggcgctctacttgggggtgatgtccggcaccagcctcgatggcctggatatcgccctggtcgaacaaggcgagcagcttgaactgctcgccacccactacctgcccatgcccccggacctgcgccaggacctgctg > 2:1015114‑M1/175‑178 (MQ=255) agacagggccaccctgctcgcagcgaacaagcgctaagccatggcgctctacttgggggtgatgtccggcaccagcctcgatggcctggatatcgccctggtcgaacaaggcgagcagcttgaactgctcgccacccactacctgcccatgcccccggacctgcgccaggacctGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGcac > 1:497582‑M1/175‑235 (MQ=255) aCGCTGATGCCGGTCATTTCGGCGAGCAGTGCGGGGTTACCGATCTACACAGTAAAGCCGCGGGCTGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGccc < 1:628194/175‑1 (MQ=255) ctgctcgcagcgaacaagcgctaagccatggcgcgctactggggggtgatgtccggcaccagcctcgatggcctggatatcgccctggtcgaacaaggcgagcagcttgaactgctcgccacccactacctgcccatgcccccggacctgcgccaggacctgctg > 2:16365‑M1/162‑165 (MQ=255) cGGTCAGTTCGGCGAGCAGTGCGGGGTTACCGATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTg < 1:838536/235‑1 (MQ=255) ggTCAGTTCGGCGAGCAGTGCGGGGTTACCGATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTgg < 1:587904/235‑1 (MQ=255) cagcgaacaagcgctaagccatggcgctctacttgggggtgatgtccggcaccagcctcgatggcctggatatcgccctggtcgaacaaggcgagcagcttgaactgctcgccacccactacctgcccatgcccccggacctgcgccaggacctGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCg < 2:497581‑M1/52‑1 (MQ=255) gCAGTGCGGGGTTACCGATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCCGTGCTGCACGGGCAATCCCGTCAGGGCCgctgct > 2:46718/1‑199 (MQ=255) cAGTGCGGGGTTACCGATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGTTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCgggg < 2:664735/233‑1 (MQ=255) ggggTTACCGATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAggg < 1:984843/184‑1 (MQ=255) ggggTTACCGATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAggg > 2:984842/1‑184 (MQ=255) ttACCGAGCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAAtctc < 2:1063596/173‑1 (MQ=255) cgctctacttgggggtgatgtccggcaccagcctcgatggcctggatatcgccctggtcgaacaaggcgagcagcttgaactgctcgccacccactacctgcccatgcccccggacctgcgccaggacctgctg > 2:1098317‑M1/131‑134 (MQ=255) gATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTgg < 1:451615/205‑1 (MQ=255) aTCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCgctgct > 2:797468/1‑182 (MQ=255) tCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCAt < 1:796223/220‑1 (MQ=255) 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cGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAg < 2:431706/149‑1 (MQ=255) cGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAggggggg > 1:5463/1‑212 (MQ=255) cGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGc > 1:1077368/1‑236 (MQ=255) aTGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGGCAGGCTGGCCCAGCGGTTATCCGCCAGTTCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAgtgggtgg < 1:616249/209‑1 (MQ=255) 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2:70521/122‑1 (MQ=255) ccgcgACCGGCTTCGGGCTGCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAg < 2:5463/166‑1 (MQ=255) gAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGAGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAgg < 2:692490/209‑1 (MQ=255) gCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGa < 1:797081/236‑1 (MQ=255) gCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGa < 1:493855/236‑1 (MQ=255) tCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGa < 2:676557/233‑1 (MQ=255) cGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGa < 2:263143/195‑1 (MQ=255) gCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAgctgct < 1:1044816/180‑1 (MQ=255) gtCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACa < 2:716781/228‑1 (MQ=255) gTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAgct < 1:704219/171‑1 (MQ=255) gTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATcc < 1:446128/200‑1 (MQ=255) tCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCAcc > 2:625548/1‑229 (MQ=255) atGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAgctgct < 1:823140/169‑1 (MQ=255) gAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAgcgc > 1:657837/1‑235 (MQ=255) cagcagTTGGCGGATCCCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCCGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTc < 1:350111/171‑1 (MQ=255) agcagTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAg < 2:342343/76‑1 (MQ=255) ggCGGATACCTGCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAg < 2:12171/69‑1 (MQ=255) ggATGCCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTGCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAgg < 1:983140/167‑1 (MQ=255) cTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAg > 1:539549/1‑224 (MQ=255) cTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCt > 1:805885/1‑236 (MQ=255) tCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCAAAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACa < 2:670537/193‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCg > 2:699638/1‑227 (MQ=255) aGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAg > 1:323766/1‑213 (MQ=255) aGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGGGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCGGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAgtgggtgg < 1:1070039/115‑1 (MQ=255) ggCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGAGATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAg < 2:719657/194‑1 (MQ=255) GCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGa > 1:340282‑M1/1‑180 (MQ=255) GCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTg < 1:891586‑M1/235‑1 (MQ=255) | GGAAGGCCGGTACCAGTGGCGCGCCTTGGCCGCCGGCAGCCACATCGCGACGGCGGAAGTCGGCGACCACGCTGATGCCGGTCAGTTCGGCGAGCAGTGCGGGGTTACCGATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTG > AE015451/520857‑521326 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |