| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 521092 = | 66 (1.070) | 4 (0.070) | 4/328 | NT | 6.2% | coding (204/1092 nt) | anmK | Anhydro‑N‑acetylmuramic acid kinase |
| ? | AE015451 | 521162 = | 58 (0.980) | coding (134/1092 nt) | anmK | Anhydro‑N‑acetylmuramic acid kinase | |||||
CGGTCAGTTCGGCGAGCAGTGCGGGGTTACCGATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCAATCAGCGGCTGGCTCTGCTGCAGGAAGCGCTGACGCTCGTTCTTG > AE015451/520935‑521395 | cGGTCAGTTCGGCGAGCAGTGCGGGGTTACCGATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTg < 1:838536/235‑1 (MQ=255) ggTCAGTTCGGCGAGCAGTGCGGGGTTACCGATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTgg < 1:587904/235‑1 (MQ=255) cAGTGCGGGGTTACCGATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGTTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCgggg < 2:664735/233‑1 (MQ=255) gATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTgg < 1:451615/205‑1 (MQ=255) tCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCAt < 1:796223/220‑1 (MQ=255) tAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTg < 2:754100/193‑1 (MQ=255) tAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAgtg > 1:445497/1‑223 (MQ=255) aGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCCGCAGGTc > 2:211627/1‑187 (MQ=255) gCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGGTCAAgct > 1:433335/1‑232 (MQ=255) cGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAggggggg > 1:5463/1‑212 (MQ=255) cGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGc > 1:1077368/1‑236 (MQ=255) aTGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGGCAGGCTGGCCCAGCGGTTATCCGCCAGTTCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAgtgggtgg < 1:616249/209‑1 (MQ=255) gAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGAc > 1:667422/1‑235 (MQ=255) ggTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAggg > 2:493854/1‑236 (MQ=255) ggTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTCGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAgg < 1:76320/235‑1 (MQ=255) gTCTGGCGGTGGCTGCGGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCgggg < 2:125945/178‑1 (MQ=255) gTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGc > 1:836017/1‑236 (MQ=255) ggCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGGAGTGGGGGGCGAGcc > 1:141804/1‑200 (MQ=255) tGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGCTACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCACTCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAgtgg < 1:304080/186‑1 (MQ=255) gCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTg < 2:769274/153‑1 (MQ=255) ccgcgACCGGCTTCGGGCTGCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAg < 2:5463/166‑1 (MQ=255) gAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGAGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAgg < 2:692490/209‑1 (MQ=255) gCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGa < 1:493855/236‑1 (MQ=255) gCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGa < 1:797081/236‑1 (MQ=255) tCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGa < 2:676557/233‑1 (MQ=255) cGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGa < 2:263143/195‑1 (MQ=255) gCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAgctgct < 1:1044816/180‑1 (MQ=255) gtCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACa < 2:716781/228‑1 (MQ=255) gTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAgct < 1:704219/171‑1 (MQ=255) gTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATcc < 1:446128/200‑1 (MQ=255) tCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCAcc > 2:625548/1‑229 (MQ=255) atGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAgctgct < 1:823140/169‑1 (MQ=255) gAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAgcgc > 1:657837/1‑235 (MQ=255) cagcagTTGGCGGATCCCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCCGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTc < 1:350111/171‑1 (MQ=255) ggATGCCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTGCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAgg < 1:983140/167‑1 (MQ=255) cTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAg > 1:539549/1‑224 (MQ=255) cTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCt > 1:805885/1‑236 (MQ=255) tCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCAAAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACa < 2:670537/193‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCg > 2:699638/1‑227 (MQ=255) aGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAg > 1:323766/1‑213 (MQ=255) aGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGGGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCGGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAgtgggtgg < 1:1070039/115‑1 (MQ=255) ggCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGAGATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAg < 2:719657/194‑1 (MQ=255) GCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGa > 1:340282‑M1/1‑180 (MQ=255) GCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTg < 1:891586‑M1/235‑1 (MQ=255) aGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCg > 1:757089/1‑170 (MQ=255) aGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTcc < 1:316993/236‑1 (MQ=255) gtgcagcagcggccctgacgagattgcccgtgcagcactggcggaaaaccgctgggccagcAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAgggtggccctgtct > 1:497582‑M2/62‑229 (MQ=255) gCGGTTTTCCGCGAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTGCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAgctgct < 2:311104/122‑1 (MQ=255) gCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCATGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCt > 2:396328/1‑162 (MQ=255) ttttCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGCAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTGCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCgggc > 2:206695/1‑166 (MQ=255) tttCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGa > 1:121509/1‑166 (MQ=255) ttCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGTTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAgc < 1:280109/184‑1 (MQ=255) ttCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCgg < 1:927914/164‑1 (MQ=255) cggccctgacgagattgcccgtgcagcactggcggaaaaccgctgggccagcAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTg < 2:497581‑M2/154‑1 (MQ=255) ctgacgagattgcccgtgcagcactggcggaaaaccgctgggccagcAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGatat > 2:665246‑M2/48‑132 (MQ=255) agcGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGACGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCa < 1:379082/199‑1 (MQ=255) gCAATCCCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGTCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCAATCAGCggctg < 1:92745/236‑1 (MQ=255) aTCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCAATCAGCggctg < 2:657836/233‑1 (MQ=255) aTCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCCGCGAGCCGGGCGGCCTTTTCCTGATCCATAc > 2:82975/1‑217 (MQ=255) tctcGTCAGGGCCGCTGCGGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGa < 2:236735/142‑1 (MQ=255) cGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGc > 2:1046878/1‑208 (MQ=255) gaaaaccgctgggccagcAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCAATCAGCg > 2:1110986‑M2/19‑214 (MQ=255) ctgcACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGTGCGATATCCACGCCCTCGAAGCTGGTGCCGGAccg > 2:3146/1‑126 (MQ=255) ctgcACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGtt < 2:400345/164‑1 (MQ=255) ctgcACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCAATCAGCGGCTGGCTCTGCTGCAGGAAGCGCt > 1:613325/1‑235 (MQ=255) cacaGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCAATCAGCggctg < 2:1032302/212‑1 (MQ=255) ggccagcAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGa < 2:167600‑M2/110‑1 (MQ=255) cagcAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCCAGTAGCGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAg > 2:16365‑M2/5‑165 (MQ=255) cagcAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAgcg > 2:1098317‑M2/5‑134 (MQ=255) cagcAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTttcccg > 1:570650‑M2/5‑178 (MQ=255) cagcAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTcc > 2:1015114‑M2/5‑178 (MQ=255) cagcAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCAATCAGCGGCTGGCTCTGCTGCAGGAAGCGCTGACGCTCGTTCt > 1:699251‑M2/5‑236 (MQ=255) cagcAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCAATCAGCGGCTGGCTCTGCTGCAGGAAGCGCTGACGCTCGTTCt > 1:773743‑M2/5‑236 (MQ=255) cagcAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCAATCAGCGGCTGGCTCTGCTGCAGGAAGCGCTGACGCTCGTTCt > 1:621654‑M2/5‑236 (MQ=255) cagcAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCAATCAGCGGCTGGCTCTGCTGCAGGAAGCGCTGACGCTCGTTCt > 1:976712‑M2/5‑236 (MQ=255) gcAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCAATCAGCGGCTGGCTCTGCTGCAGGa > 1:594792‑M2/3‑216 (MQ=255) gcAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCAATCAGCGGCTGGCTCTGCTGCAGGAAGCGCTGACGCTCGTTCTTg > 1:649384‑M2/3‑236 (MQ=255) | CGGTCAGTTCGGCGAGCAGTGCGGGGTTACCGATCTGCACAGTAAAGCCGCGGGCCGGTTCATGGCGAATGGTCTGGCCGTGGCTGCCGATGGCGCGAACGGCTTCGGGCTTCAGTCCCTGGCGAGCCAGCAGTTGGCGGATACCTTCGCCGGCCAGGCTGGCCCAGCGGTTTTCCGCCAGTGCTGCACGGGCAATCTCGTCAGGGCCGCTGCTGCACAGGGCCAGCAGGTCCTGGCGCAGGTCCGGGGGCATGGGCAGGTAGTGGGTGGCGAGCAGTTCAAGCTGCTCGCCTTGTTCGACCAGGGCGATATCCAGGCCATCGAGGCTGGTGCCGGACATCACCCCCAAGTAGAGCGCCATGGCTTAGCGCTTGTTCGCTGCGAGCAGGGTGGCCTTTTCCTGATCCATACGGGCAATCAGCGGCTGGCTCTGCTGCAGGAAGCGCTGACGCTCGTTCTTG > AE015451/520935‑521395 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |