New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 923303 | 60 (0.970) | 4 (0.070) | 4/318 | NT | 6.6% | coding (1890/2169 nt) | PP_0804 | Protein secretion ABC efflux system, permease and ATP‑binding protein |
? | AE015451 | = 923379 | 58 (1.010) | coding (1814/2169 nt) | PP_0804 | Protein secretion ABC efflux system, permease and ATP‑binding protein |
GACGATGCGCCCGGCGTCCAGCACCAGGATGCGGTCGACCCGCTGCAGAACACTCAGGCGATGGGTTGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATG > AE015451/923078‑923528 | gACGATGCGCCCGGCGTCCAGCACCAGGATGCGGTCGACCCGCTGCAGAACACTCAGGCGATGGGTTGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCa < 1:418772/236‑1 (MQ=255) gcCCGGCGTCCAGCACCAGGATGCGGTCGACCCGCTGCAGAACACTCAGGCGATGGGTTGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGccccg > 1:1055022/1‑227 (MQ=255) gcCCGGCGTCCAGCACCAGGATGCGGTCGACCCGCTGCAGAACACTCAGGCGATGGGTTGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGcctcct > 1:1125602/1‑236 (MQ=255) gcCCGGCGTCCAGCACCAGGATGCGGTCGACCCGCTGCAGAACACTCAGGCGATGGGTTGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGcctc > 1:992334/1‑234 (MQ=255) cGGCGTCCAGCACCAGGATGCGGTCGACCCGCTGCAGAACACTCAGGCGATGGGTTGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCg < 1:10108/236‑1 (MQ=255) cAGCACCAGGATGCGGTCGACCCGCTGCAGAACACTCAGGCGATGGGTTGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATc < 1:1053836/235‑1 (MQ=255) gATGCGGTCGACCCGCTGCAGAACACTCAGGCGATGGGTTGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGt < 2:874570/233‑1 (MQ=255) cGCTGCAGAACACTCAGGCGATGGGTTGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCA > 1:755746‑M1/1‑186 (MQ=255) cGCTGCAGAACACTCAGGCGATGGGTTGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCA < 2:755745‑M1/186‑1 (MQ=255) gAACCCTCAGGCGATGGGTTGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGgcggcg < 1:162526/235‑1 (MQ=255) acTCAGGCGATGGGTTGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATc < 1:246461/202‑1 (MQ=255) aGGCGATGGGTTGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTc > 1:492007/1‑236 (MQ=255) ggCGATGGGTTGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTcc > 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ttGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCt > 2:526388/1‑204 (MQ=255) ttGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCa > 1:1080884/1‑236 (MQ=255) tGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCa > 2:593345/1‑197 (MQ=255) tGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCa > 1:412426/1‑235 (MQ=255) gtgtACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGtggcggccagc > 1:881155‑M2/1‑225 (MQ=255) aCGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGCCAAGCCCAGGcctc > 2:988997/1‑161 (MQ=255) cTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGccac < 1:418265/234‑1 (MQ=255) tGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTTGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGtggcgggcc < 1:206804‑M2/223‑10 (MQ=255) cAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGcc > 2:513620/1‑143 (MQ=255) cAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAggg > 1:317533/1‑147 (MQ=255) cAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCa > 2:434279/1‑202 (MQ=255) cAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGt > 2:886198/1‑234 (MQ=255) gAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAg > 1:700216/1‑183 (MQ=255) cgcTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGcgcg > 2:545205/1‑219 (MQ=255) aGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATc < 1:795040/150‑1 (MQ=255) aGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATc > 2:795039/1‑150 (MQ=255) aGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCACGTGGTCCATGcc > 2:1016618/1‑164 (MQ=255) aGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGt < 2:689712‑M2/200‑2 (MQ=255) tATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGtggcggcc > 1:872106‑M2/1‑195 (MQ=255) aTCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGctggccgcca < 1:728645/236‑5 (MQ=255) agcagcTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCGGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAggt > 2:353217/1‑138 (MQ=255) agcagcTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGc < 1:1085430/236‑1 (MQ=255) agcagcTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCGCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGc < 1:887534/236‑1 (MQ=255) gcagcTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCActggcgcactggacttcgtccgccgcctgcccaagggcatggaccacttgatcctcgaaggaggcctgggcttgtctggcggccagcg < 1:743448‑M1/201‑89 (MQ=255) gcagcTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCActggcgcactggacttcgtccgccgcctgcccaagggcatggaccacttgatcctcgaaggaggcctgggcttgtctggcggccagcg > 2:743447‑M1/1‑113 (MQ=255) gcagcTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCgg > 2:1025306/1‑234 (MQ=255) ttGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGa < 1:555181/235‑1 (MQ=255) cATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGTACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGACCAGGCCTCCTTCGAGGAGCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGAc > 1:429089/1‑156 (MQ=255) tcgtcCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACA‑‑ACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGtggcggccagcgccaagccct > 2:600509‑M2/1‑167 (MQ=255) cgtcCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGGACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCActggcgcactggacttcgtccgccgcctgcccaagggcatggaccacttgatcctcgaagga < 2:7039‑M1/154‑63 (MQ=255) tcCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGtggcggcc > 1:757416‑M2/1‑166 (MQ=255) cGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGc > 1:961566/1‑236 (MQ=255) cGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGc > 1:653507/1‑236 (MQ=255) cGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGc > 1:97798/1‑236 (MQ=255) cGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAACCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTg > 1:256972/1‑155 (MQ=255) cgcgGTCGCCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAgg < 2:1103414/133‑1 (MQ=255) cgGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTg < 2:589372/235‑1 (MQ=255) tCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGa > 2:494163/1‑234 (MQ=255) tCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGct < 2:666649/182‑1 (MQ=255) tCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGctggccgcca < 2:1125601/187‑5 (MQ=255) aGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGaa < 2:912798/122‑1 (MQ=255) gCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCgg < 1:1025307/235‑1 (MQ=255) cACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGa < 1:895944/215‑1 (MQ=255) tGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCGCCAGGGCTTGGCGCGGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATc < 2:370425/81‑1 (MQ=255) cGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTgacgtcg < 2:757491/213‑7 (MQ=255) gggCGTACCGGCAGGCGCGACAGCGCCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATAAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCAc < 2:205179/171‑1 (MQ=255) cccAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGCCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTgg < 2:690630/146‑1 (MQ=255) cgACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTca < 1:417271/235‑1 (MQ=255) aGGGCTTGGCGCTGGCCGCCActggcgcactggacttcgtccgccgcctgcccaagggcatggaccacttgatcctcgaaggaggcctgggcttgtctggcggccagcgccaagccctggttgtcgcgcctgctggtacgccagccgcaggtgctgttgctggacgagccgaccgcgtcgctggacga > 2:600509‑M1/1‑21 (MQ=255) gccgcgcTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGcgcg > 2:322106/4‑106 (MQ=255) ggCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGc < 1:1097497/235‑1 (MQ=255) cgcTGGCCGCCGGACGAGCCCAGGCCGCCTTCGAGGATCAAGTGGGCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGaa < 2:178210/74‑1 (MQ=255) cgcTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGtggcggccagcgccaagccctggtgctgtcgcgcctgctggtacgccagccgcaggtgctgttgctggacgagccgaccgcgtcgctggacgacatgaccgagcgcaagctgc < 1:743448‑M2/201‑114 (MQ=255) cgcTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGtggcggccagcgccaagccctggtgctgtcgcgcctgctggtacgccagccgcaggtgctgttgctggacgagccgaccgcgtcgctggacgacatgaccgagcgcaagctgc > 2:743447‑M2/1‑88 (MQ=255) gcTTGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCtggcctggcc > 2:947018/1‑130 (MQ=255) gcTGGCCGCCActggcgcactggacttcgtccgccgcctgcccaagggcatggaccacttgatcctcgaaggaggcctgggcttgtctggcggccagcgccaagccctggtgctgtcgcgcctgctggtacgccagccgcaggtgctgttgctggacgagccgaccgcgtcgctggacgacatgaccgagcgcaagctgctggataacctggagcgcttctgtcagggccgtacac > 1:881155‑M1/1‑11 (MQ=255) gcTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGCAGTCCAGGTCGCAAGGGGCGGCCAGCGTGGccac > 2:1026522/1‑106 (MQ=255) gcTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCa > 2:741524/1‑234 (MQ=255) gcTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATg > 1:926216/1‑236 (MQ=255) ggcccgccactggcgcactggacttcgtccgccgcctgcccaagggcatggaccacttgatcctcgaaggaggcctgggcttgtctggcggccagcgcaaagccctggtgctgtcgcgcctgctggtacgccagccgcaggtgctgttgctggacgagccgaccgcgtcgctggacgacatgaccgagcgcaagctgctggataacctggagcgcttctgtca < 1:206804‑M1/220‑215 (MQ=255) ggCCGCCActggcgcactggacttcgtccgccgcctgcccaagggcatggaccacttgatcctcgaaggaggcctgggcttgtctggcggccagcgccaagccctggtgctgtcgcgcctgctggtacgccagccgcaggtgctgttgctggacgagccgaccgcgtcgctggacgacatgaccgagcgcaagctgctggata > 1:872106‑M1/1‑8 (MQ=255) ggCCGCCActggcgcactggacttcgtccgccgcctgcccaagggcatggaccacttgatcctcgaaggaggcctgggcttgtctggcggccagcgccaagccctggtgctgtcgcgcctgctggtacgccagccgcaggtgctgttgctggacgagccgaccgcgtcgctgga > 1:757416‑M1/1‑8 (MQ=255) actggcgcactggacttcgtccgccgcctgcccaagggcatggaccacttgatcctcgaaggaggcctgggcttgtctggcggccagcgccaagccctggtgctgtcgcgcctgctggtacgccagccgcaggtgctgttgctggacgagccgaccgcgtcgctggacgacatgaccgagcgcaagctgctggataacct < 2:689712‑M1/200‑200 (MQ=255) | GACGATGCGCCCGGCGTCCAGCACCAGGATGCGGTCGACCCGCTGCAGAACACTCAGGCGATGGGTTGCGATCACCAGTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATG > AE015451/923078‑923528 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |