| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 923303 | 60 (0.970) | 4 (0.070) | 4/318 | NT | 6.6% | coding (1890/2169 nt) | PP_0804 | Protein secretion ABC efflux system, permease and ATP‑binding protein |
| ? | AE015451 | = 923379 | 58 (1.010) | coding (1814/2169 nt) | PP_0804 | Protein secretion ABC efflux system, permease and ATP‑binding protein | |||||
GTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCA > AE015451/923155‑923592 | gtgtACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGtggcggccagc > 1:881155‑M2/1‑225 (MQ=255) cTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGccac < 1:418265/234‑1 (MQ=255) tGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTTGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGtggcgggcc < 1:206804‑M2/223‑10 (MQ=255) cAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGt > 2:886198/1‑234 (MQ=255) cgcTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGcgcg > 2:545205/1‑219 (MQ=255) aGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGt < 2:689712‑M2/200‑2 (MQ=255) tATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGtggcggcc > 1:872106‑M2/1‑195 (MQ=255) aTCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGctggccgcca < 1:728645/236‑5 (MQ=255) agcagcTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGc < 1:1085430/236‑1 (MQ=255) agcagcTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCGCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGc < 1:887534/236‑1 (MQ=255) gcagcTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCgg > 2:1025306/1‑234 (MQ=255) ttGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGa < 1:555181/235‑1 (MQ=255) tcgtcCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACA‑‑ACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGtggcggccagcgccaagccct > 2:600509‑M2/1‑167 (MQ=255) tcCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGtggcggcc > 1:757416‑M2/1‑166 (MQ=255) cGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGc > 1:97798/1‑236 (MQ=255) cGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGc > 1:961566/1‑236 (MQ=255) cGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGc > 1:653507/1‑236 (MQ=255) cgGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTg < 2:589372/235‑1 (MQ=255) tCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGa > 2:494163/1‑234 (MQ=255) tCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGct < 2:666649/182‑1 (MQ=255) tCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGctggccgcca < 2:1125601/187‑5 (MQ=255) gCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCgg < 1:1025307/235‑1 (MQ=255) cACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGa < 1:895944/215‑1 (MQ=255) cGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTgacgtcg < 2:757491/213‑7 (MQ=255) gggCGTACCGGCAGGCGCGACAGCGCCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATAAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCAc < 2:205179/171‑1 (MQ=255) cccAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGCCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTgg < 2:690630/146‑1 (MQ=255) cgACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTca < 1:417271/235‑1 (MQ=255) gccgcgcTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGcgcg > 2:322106/4‑106 (MQ=255) ggCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGc < 1:1097497/235‑1 (MQ=255) cgcTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGtggcggccagcgccaagccctggtgctgtcgcgcctgctggtacgccagccgcaggtgctgttgctggacgagccgaccgcgtcgctggacgacatgaccgagcgcaagctgc < 1:743448‑M2/201‑114 (MQ=255) cgcTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGtggcggccagcgccaagccctggtgctgtcgcgcctgctggtacgccagccgcaggtgctgttgctggacgagccgaccgcgtcgctggacgacatgaccgagcgcaagctgc > 2:743447‑M2/1‑88 (MQ=255) gcTTGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCtggcctggcc > 2:947018/1‑130 (MQ=255) gcTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGCAGTCCAGGTCGCAAGGGGCGGCCAGCGTGGccac > 2:1026522/1‑106 (MQ=255) gcTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCa > 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ctcctTCGAGGTTCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGTTGAGGTTTTCTCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGACGCCGTCCAGGCTGATCTCg < 1:600765/236‑1 (MQ=255) tcctTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGtggcggccagcgccaagccctggtgctgtcgcgcctgctggtccgccagccgcaggtgctgttgctggacgagccgaccgcgtcgctggacg < 2:7039‑M2/154‑93 (MQ=255) ttCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTGGGGCAGGCGGCGGCCGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCCCCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTcagcag < 2:251680/191‑1 (MQ=255) cGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCg > 1:1111961/1‑209 (MQ=255) cGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCt > 1:689513/1‑234 (MQ=255) aGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGgc < 2:442707/156‑1 (MQ=255) aaGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTc < 2:917042/185‑1 (MQ=255) aaGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGAt < 1:981473/235‑1 (MQ=255) aGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCA‑‑GCGACCAGGAACTGGTGGCCGCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGgcgc > 1:43517/1‑170 (MQ=255) aGTGGTCCAGGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCA‑‑GCGACCAGGAACTGGTGGCCGCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGgcgc < 2:43517/170‑1 (MQ=255) gTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGAt < 2:704394/233‑1 (MQ=255) gTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATc > 1:772030/1‑234 (MQ=255) gCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATcc > 1:27695/1‑226 (MQ=255) cccTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGcagcag > 2:535054/1‑143 (MQ=255) cTTGGGCGGGCGGCTGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGGGGACACCAGTTCCTGG‑‑ACGct < 2:384306/69‑1 (MQ=255) cTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCGGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAgg < 1:253830/106‑1 (MQ=255) gCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGa > 2:717729/1‑183 (MQ=255) gCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAgcgc > 1:952272/1‑235 (MQ=255) gCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGGCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGc > 1:174996/1‑181 (MQ=255) gcggcgGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGc < 1:180604/177‑1 (MQ=255) cggcggACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTg < 2:951504/233‑1 (MQ=255) gcggACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCa > 1:518905/1‑185 (MQ=255) gcggACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCt > 1:1080181/1‑200 (MQ=255) gcggACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTgcagca > 1:413464/1‑236 (MQ=255) gcggACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTgca > 2:958680/1‑233 (MQ=255) gcggACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑GCGCCGGCCTGGGCGGCACCGAGGGGGAGGCTTTCCCGCAGGGGGCCGTg > 2:253829/1‑102 (MQ=255) gcggACGAAGTCCAGTGCGACAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑t > 2:105646/1‑53 (MQ=255) cggTGCGCCGGTGGGGGACAGCGCGGCCCCCGTTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAggg < 2:171911/63‑1 (MQ=255) aGTGCGCCAGTGGCGGCCGGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCCCCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCg < 1:254483/147‑1 (MQ=255) tGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGcc < 2:181476/95‑1 (MQ=255) cgcCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCCCCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGAt < 1:277561/192‑1 (MQ=255) gcCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCCGGTc > 2:89785/1‑132 (MQ=255) gTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGAtctc < 1:960600/173‑1 (MQ=255) | GTGTACGGCCCTGACAGAAGCGCTCCAGGTTATCCAGCAGCTTGCGCTCGGTCATGTCGTCCAGCGACGCGGTCGGCTCGTCCAGCAACAGCACCTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGG‑‑TCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCCGTCCAGGCTGATCTCGCCCTGCACCAGATCCATGGCCCCACCCAGCGCCTGCAGCA > AE015451/923155‑923592 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |