New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AE015451 | 1217706 = | 75 (1.210) | 6 (0.100) | 4/324 | NT | 8.5% | coding (704/918 nt) | metR‑I | DNA‑binding transcriptional regulator, homocysteine‑binding |
? | AE015451 | 1217888 = | 59 (1.010) | coding (522/918 nt) | metR‑I | DNA‑binding transcriptional regulator, homocysteine‑binding |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GCCGCTGTATCGCCAGGCGCTCAACGCACCGCGCTGACGCCGTCGAGGGTGGCGAACGAGGTGTCCTTGGCCGTCAGCAAAAAGTCGCGCATGTAAGGGGCATCGAGCATGTCGGTGCGTACGGCGGCATAAAGCGTGGCAAACAGGCCTTTCTCGCCCAGGCGTTTGCCCTTCACATAGCCGCGCGAGCTGTACTCGTGCAGCGCCCAATGCGGCATGCCGCACACGCCACGGCCGCTGGCCACCAGTTGCATCATCATCACCGTCAGCTCCGAGGTACGCACGGCGGCTGGCTCGATATCGGCCGGCTCCAGGAAGCGCGTGAAGATGTCCAGGCGATCGCGCTCCACCGGGTAGGTGATCAGCGTCTGGTCGAGCAAGTCTTGCGGCACGATGTAAGGCTTGCTGGCCAGCGGGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAA > AE015451/1217472‑1217939 | gctattgaatgccacagttgcttccagtggctgatgccgaccatcgaccagttccgtgatgcctggccggaagtggaactggacctggcctcgggctttgccttcgccccgctaccggccctggcccgcggcgaccttgacctggtggtgacctccgacccggtggacctggcaggcatcacttacgtgccgctgttcacctacgaggcgatgctggcagtggccaaccaacaccc > 1:1106562‑M1/235‑236 (MQ=255) ttgaatgccacagttgcttccagtggctgatgccgaccatcgaccagttccgtgatgcctggccggaagtggaactggacctggcctcgggctttgccttcgccccgctaccggccctggcccgcggcgaccttgacctggtggtgacctccgacccggtggacctggcaggcatcacttacgtgccgctgttcacctacgaggcgatgctggcagtggccaaccaacacCCg < 2:1076058‑M1/3‑1 (MQ=255) ttgaatgccacagttgcttccagtggctgatgccgaccatcgaccagttccgtgatgcctggccggaagtggaactggacctggcctcgggctttgccttcgccccgctaccggccctggcccgcggcgaccttgacctggtggtgacctccgacccggtggacctggcaggcatcacttacgtgccgctgttcacctacgaggcgatgctggcagtggccaaccaacacCCGCTg < 1:407326‑M1/6‑1 (MQ=255) agtgccacagttgcttccagtggctgatgccgaccatcgaccagttccgtgatgcctggccggaagtggaactggacctggcctcgggctttgccttcgccccgctaccggccctggcccgcggcgaccttgacctggtggtgacctccgacccggtggacctggcaggcatcacttacgtgccgctgttcacctacgaggcgatgctggcagtggccaaccaacacCCGCTGGcc > 1:830037‑M1/228‑236 (MQ=255) aatgccacagttgcttccagtggctgatgccgaccatcgaccagttccgtgatgcctggccggaagtggaactggacctggcctcgggctttgccttcgccccgctaccggccctggcccgcggcgaccttgacctggtggtgacctccgacccggtggacctggcaggcatcacttacgtgccgctgttcacctacgaggcgatgctggcagtggccaaccaacacCCGCTGGcc > 1:747219‑M1/228‑236 (MQ=255) aatgccacagttgcttccagtggctgatgccgaccatcgaccagttccgtgatgcctggccggaagtggaactggacctggcctcgggctttgccttcgccccgctaccggccctggcccgcggcgaccttgacctggtggtgacctccgacccggtggacctggcaggcatcacttacgtgccgctgttcacctacgaggcgatgctggcagtggccaaccaacacCCGCTGGcc > 1:1022788‑M1/228‑236 (MQ=255) aatgccacagttgcttccagtggctgatgccgaccatcgaccagttccgtgatgcctggccggaagtggaactggacctggcctcgggctttgccttcgccccgctaccggccctggcccgcggcgaccttgacctggtggtgacctccgacccggtggacctggcaggcatcacttacgtgccgctgttcacctacgaggcgatgctggcagtggccaaccaacacCCGCTGGcc > 1:1079214‑M1/228‑236 (MQ=255) aatgccacagttgctaccagtggctgatgccgaccatcgaccagttccgtgatgcctggccggaagtggaactggacctggcctcgggctttgccttcgccccgctaccggccctggcccgcggcgaccttgacctggtggtgacctccgacccggtggacctggcaggcatcacttacgtgccgctgttcacctacgaggcgatgctggcagtggacaaccaacacCCGCTGGcc > 1:276545‑M1/228‑236 (MQ=255) atgccacagttgcttccagtggctgatgccgaccatcgaccagttccgtgatgcctggccggaagtggaactggacctggcctcgggctttgccttcgccccgctaccggccctggcccgcggcgaccttgacctggtggtgacctccgacccggtggacctggcaggcatcacttacgtgccgctgttcacctacgaggcgatgctggcagtggccaaccaacacCCGCTGGcc > 1:261200‑M1/227‑235 (MQ=255) atgccacagttgcttccagtggctgatgccgaccatcgaccagttccgtgatgcctggccggaagtggaactggacctggcctcgggctttgccttcgccccgctaccggccctggcccgcggcgaccttgacctggtggtgacctccgacccggtggacctggcaggcatcacttacgtgccgctgttcacctacgaggcgatgctggcagtggccaaccaacacCCGCTGGcc > 1:196565‑M1/227‑235 (MQ=255) cacagttgcttccagtggctgatgccgaccatcgaccagttccgtgatgcctggccggaagtggaactggacctggcctcgggctttgccttcgccccgctaccggccctggcccgcggcgaccttgacctggtggtgacctccgacccggtggacctggcaggcatcacttacgtgccgctgttcacctacgaggcgatgctggcagtggccaaccaacacCCGCTGGcca > 2:407325‑M1/223‑232 (MQ=255) 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gCCGTCAGCAAAAAGTCGCGCATGTAAGGGGCATCGAGCATGTCGGTGCGTACGGCGGCATAAAGCGTGGCAAACAGGCCTTTCTCGCCCAGGCGTTTGCCCTTCACATAGCCGCGCGAGCTGTACTCGTGCAGCGCCCAATGCGGCATGCCGCACACGCCACGGCCGCTGGCCACCAGTTGCATCATCATCACCGTCAGCTCCGAGGTACGCACGGCGGCTGGCTCGATATcgg < 1:707418/235‑1 (MQ=255) gCAAAAAGTCGCGCATGTAAGGGGCATCGAGCATGTCGGTGCGTACGGCGGCATAAAGCGTGGCAAACAGGCCTTTCTCGCCCAGGCGTTTGCCCTTCACATAGCCGCGCGAGCTGTACTCGTGCAGCGCCCAATGCGGCATGCCGCACACGCCACGGCCGCTGGCCACCAGTTGCATCATCATCACCGTCAGCTCCGAGGTACGCACGGCGGCTGGCTCGatat > 1:850574/1‑225 (MQ=255) gCAAAAAGTCGCGCATGTAAGGGGCATCGAGCATGTCGGTGCGTACGGCGGCATAAAGCGTGGCAAACAGGCCTTTCTCGCCCAGGCGTTTGCCCTTCACATAGCCGCGCGAGCTGTACTCGTGCAGCGCCCAATGCGGCATGCCGCACACGCCACGGCCGCTGGCCACCAGTTGCATCATCATCACCGTCAGCTCCGAGGTACGCACGGCGGCTGGCTCGATATc > 2:489619/1‑226 (MQ=255) gCAAAAAGTCGCGCATGTAAGGGGCATCGAGCATGTCGGTGCGTACGGCGGCATAAAGCGTGGCAAACAGGCCTTTCTCGCCCAGGCGTTGGCCCTTCACATAGCCGCGCGAGCTGTACTCGTGCAGCGCCCAATGCGGCATGCCGCACACGCCACGGCCGCGGGCACCCAgct > 2:178942/1‑172 (MQ=255) 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cGAGCATGTCGGTGCGTACGGCGGCATAAAGCGTGGCAAACAGGCCTTTCTCGCCCAGGCGTTTGCCCTTCACATAGCCGCGCGAGCTGTACTCGTGCAGCGCCCAATGCGGCATGCCGCACACGCCACGGCCGCTGGCCACCAGTTGCATCATCATCACCGTCAGCTccac > 2:343064/1‑170 (MQ=255) cGAGCATGTCGGTGCGTACGGCGGCATAAAGCGTGGCAAACAGGCCTTTCTCGCCCAGGCGTTTGCCCTTCACATAGCCGCGCGAGCTGTACTCGTGCAGCGCCCAATGCGGCATGCCGCACACGCCACGGCCGCTGGCCACCAGTTGCATCATCATCACCGTCAGCTCCGAGGTACGCACGGCGGCTGGCTCGATATCGGCCGGCTCCa > 1:875702/1‑210 (MQ=255) cGAGCATGTCGGTGCGTACGGCGGCATAAAGCGTGGCAAACAGGCCTTTCTCGCCCAGGCGTTTGCCCTTCACATAGCCGCGCGAGCTGTACTCGTGCAGCGCCCAATGCGGCATGCCGCACACGCCACGGCCGCTGGCCACCAGTTGCATCATCATCACCGTCAGCTCCGAGGTACGCACGGCGGCTGGCTCGATATCGGCCGGCTCCAGGAAGCGCGTGAAGATGTCCAGGCg > 1:959346/1‑235 (MQ=255) aGCATGTCGGTGCGTACGGCGGCATAAGGCGTGGCAAACAGGCCTTTCTCGCCCAGGCGTTTGCCCTTCACATAGCCGCGCGAGCTGTACTCGTGCAGCGCCCAATGCGGCATGCCGCACACGCCACGGCCGCTGGCCACCAGTTGCATCATCATCACCGTCAGCTCCGAGGTACGCACGGCGGCTGGCTCGATATCGGCCGGCTCCACGAAGCGCGTGAAGATGTCCAGGCGATc < 1:597325/236‑1 (MQ=255) 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gCCGCTGGCCACCAGTTGCATCATCATCACCGTCAGCTCCGAGGTACGCACGGCGGCTGGCTCGATATCGGCCGGCTCCAGGAAGCGCGTGAAGATGTCCAGGCGATCGCGCTCCACCGGGTAGGTGATCAGCGTCTGGTCGAGCAAGTCTTGCGGCACGATGTAAGGCTTGCTGGCCAGCGGGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCg > 2:801083/1‑227 (MQ=255) | GCCGCTGTATCGCCAGGCGCTCAACGCACCGCGCTGACGCCGTCGAGGGTGGCGAACGAGGTGTCCTTGGCCGTCAGCAAAAAGTCGCGCATGTAAGGGGCATCGAGCATGTCGGTGCGTACGGCGGCATAAAGCGTGGCAAACAGGCCTTTCTCGCCCAGGCGTTTGCCCTTCACATAGCCGCGCGAGCTGTACTCGTGCAGCGCCCAATGCGGCATGCCGCACACGCCACGGCCGCTGGCCACCAGTTGCATCATCATCACCGTCAGCTCCGAGGTACGCACGGCGGCTGGCTCGATATCGGCCGGCTCCAGGAAGCGCGTGAAGATGTCCAGGCGATCGCGCTCCACCGGGTAGGTGATCAGCGTCTGGTCGAGCAAGTCTTGCGGCACGATGTAAGGCTTGCTGGCCAGCGGGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAA > AE015451/1217472‑1217939 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |