| New junction evidence | |||||||||||
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aGCGCCCAATGCGGCATGCCGCACACGCCACGGCCGCTGGCCACCAGTTGCATCATCATCACCGTCAGCTCCGAGGTACGCACGGCGGCTGGCTCGATATCGGCCGGCTCCAGGAAGCGCGTGAAGATGTCCAGGCGATCGCGCTCCACCGGGTAGGTGATCAGCGTCTGGTCGAGCAAGTCTTGCGGCACGATGTAAGGCTTGCTGGCCAGCGGGTGTTGGTTGGCCACTGCCAg > 1:680339/1‑236 (MQ=255) cccAATGCGGCATGCCGCACACGCCACGGCCGCTGGCCACCAGTTGCATCATCATCACCGTCAGCTCCGAGGTACGCACGGCGGCTGGCTCGATATCGGCCGGCTCCAGGAAGCGCGTGAAGATGTCCAGGCGATCGCGCTCCACCGGGTAGGTGATCAGCGTCTGGTCGAGCAAGTCTTGCGGCACGATGTAAGGCTTGCTGGCCAGCGGGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCAt > 1:774061/1‑235 (MQ=255) cccAATGCGGCATGCCGCACACGCCACGGCCGCTGGCCACCAGTTGCATCATCATCACCGTCAGCTCCGAGGTACGCACGGCGGCTGGCTCGATATCGGCCGGCTCCAGGAAGCGCGTGAAGATGTCCAGGCGATCGCGCTCCACCGGGTAGGTGATCAGCGTCTGGTCGAGCAAGTCTTGCGGCACGATGTAAGGCTTGCTGGCCAGCGGGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATc > 1:512695/1‑236 (MQ=255) 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gTCTTGCGGCACGATGTAAGGCTTGCTGGCCAGCGGGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAAGTGATGCCTGCCAGGTCCACCGGGTCGGAGGTCACCACCAGGTCAAGGTCGCCGCGGGCCAGGGCCGGTAGCGGGGCGAAGGCAAAGCCCGAGGCCAGGTCCAGTTCCACTTCCGGCCAGGCATCACGGAACTGGTCGATGGTCGGc > 1:900626/1‑235 (MQ=255) tGCGGCACGATGTAAGGCTTGCTGGCCAGCGGGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAAGTGATGCCTGCCAGGTCCACCGGGTCGGAGGTCACCACCAGGTCAAGGTCGCCGCGGGCCAGGGCCGGTAGCGGGGCGAAGGCACAGCCCGAGGCCAGGTCCAGTTCCACTTCCGGCCAGGCCTCACGGAACGGGTCGATGGTc > 1:291566/1‑228 (MQ=255) cGATGTAAGGCTTGCTGGCCAGCGGGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAAGTGATGCCTGCCAGGTCCACCGGGTCGGAGGTCACCACCAGGTCAAGGTCGCCGCGGGCCAGGGCCGGTAGCGGGGCGAAGGCAAAGCCCGAGGCCAGGTCCAGTTCCACTTCCGGcc < 2:888882/195‑1 (MQ=255) aggcaactggtggccagcggGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGaa < 1:198535‑M2/39‑1 (MQ=255) aaGGCTTGCTGGCCAGCGGGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAAGTGATGCCTGCCAGGTCCACCGGGTCGGAGGTCACCACCAGGTCAAGGTCGCCGCGGGCCAGGGCCGGTAGCGGGGCGAAGGCAAAGCCCGac > 1:136761/1‑163 (MQ=255) gCTTGCTGGCCAGCGGGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAAGTGATGCCTGCCAGGTCCACCGGGTCGGAGGTCACCACCAGGTCAAGGTCGCCGCGGGCCAGGGCCGGTAGCGGGGCGAAGGCAAAGCCCGAGGCCAGGTCCAGTTCCACTTCCGGCCAGGCATCAc < 2:512694/195‑1 (MQ=255) tGCTGGCCAGCGGGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAAGTGATGCCTGCCAGGTCCACCGGGTCGGAGGTCACCACCAGGTCAAGGTCGCCGCGGGCCAGGGCCGGTAGCGGGGCGAAGGCAAAGCCCGAGGCCAGGTCCAGTTCCACTTCCGGCCAGGCATCACGGAACTGGTCGATGGTCGGCATCAGCCACTGGAAGCAACtgtg < 1:510330/235‑1 (MQ=255) tggccagcggGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAAGTGATGCCTGCCAGGTCCACCGGGTCGGAGGTCACCACCAGGTCAAGGTCGCCGCGGGCCAGGGCCGGTAGCGGGGCGAAGGCAAAGCCCGAGGCCAGGTCCAGTTCCACTTCCGGCCAGGCATCACGGAACTGGTCGATGGTCGGCATCAGCCACTGGAAGCAACtgtg > 2:407325‑M2/11‑232 (MQ=255) ggccagcggGTGTTGGTTGTCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAAGTGATGCCTGCCAGGTCCACCGGGTCGGAGGTCACCACCAGGTCAAGGTCGCCGCGGGCCAGGGCCGGTAGCGGGGCGAAGGCAAAGCCCGAGGCCAGGTCCAGTTCCACTTCCGGCCAGGCATCACGGAACTGGTCGATGGTCGGCATCAGCCACTGGTAGCAACTGTGGCAtt > 1:276545‑M2/10‑236 (MQ=255) ggccagcggGTGTTGGTTGGCCACTGTCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAAGTGATGCCTGCCAGGTc < 2:1063544‑M2/69‑1 (MQ=255) ggccagcggGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAAGTGATGCCTGCCAGGTCCACCGGGTCGGAGGTCACCACCAGGTCAAGGTCGCCGCGGGCCAGGGCCGGTCGCGGGGCGCAGGCCAAGcc > 2:145587‑M2/10‑150 (MQ=255) ggccagcggGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAAGTGATGCCTGCCAGGTCCACCGGGTCGGAGGTCACCACCAGGTCAAGGTCGCCGCGGGCCAGGGCCGGTAGCGGGGCGCAGGCAAAGCCCGAGGCCAgg > 1:210911‑M2/10‑160 (MQ=255) ggccagcggGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAAGTGATGCCTGCCAGGTCCACCGGGTCGGAGGTCACCACCAGGTCAAGGTCGCCGCGGGCCAGGGCCGGTAGCGGGGCGAAGGCAAAGCCCGAGGCCAGGTCCAGTTCCACTTCCGGCCAGGCATCACGGAACtggg > 1:101761‑M2/10‑196 (MQ=255) 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cagcggGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAAGTGATGCCTGCCAGGTCCACCGGGTCGGAGGTCACCACCAGGTCAAGGTCGCCGCGGGCCAGGGCCGGTAGCGGGGCGAAGGCAAAGCCCGAGGCCAGGTCCAGTTCCACTTCCGGCCAGGCATCACGGAACTGGTCGATGGTCGGCATCAGCCACTGGAAGCAACTGTGGCATTCaa < 1:407326‑M2/230‑1 (MQ=255) cggGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAAGTGATGCCTGCCAGGTCCACCGGGTCGGAGGTCACCACCAGGTCAAGGTCGCCGCGGGCCAGGGCCGGTAGCGGGGCGAAGGCAAAGCCCGAGGCCAGGTCCAGTTCCACTTCCGGCCAGGCATCACGGAACTGGTCGATGGTCGGCATCAGCCACTGGAAGCAACTGTGGCATTCaa < 2:1076058‑M2/230‑1 (MQ=255) cggGTGTCGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAAGTGATGCCTGCCAGGTCCACCGGGTCGGAGGTCACCACCAGGTCAAGGTCGCCGCGGGCCAGGGCCGGTAGCGGGGCGAAGGCAAAGCCCGAGGCCAGGTCCAGTTCCACTTCCGGCCAGGCATCACGAAACTGGTCGATGGTCGGCTTc < 1:622935‑M2/202‑1 (MQ=255) ggGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAAGTGATGCCTGCCAGGTCCACCGGGTCGGAGGTCACCACCAGGTCAAGGTCGCCGCGGGCCAGGGCCGGTAGCGGGGCGAAGGCAAAGCCCGAGGCCAGGTCCAGTTCCACTTCCGGCCAGGCATCACGGAACTGGTCGATGGTCGGCATCAGCCACTGGAAGCAACTGTGGCATTCAATAGc > 1:1106562‑M2/3‑236 (MQ=255) | GAGCTGTACTCGTGCAGCGCCCAATGCGGCATGCCGCACACGCCACGGCCGCTGGCCACCAGTTGCATCATCATCACCGTCAGCTCCGAGGTACGCACGGCGGCTGGCTCGATATCGGCCGGCTCCAGGAAGCGCGTGAAGATGTCCAGGCGATCGCGCTCCACCGGGTAGGTGATCAGCGTCTGGTCGAGCAAGTCTTGCGGCACGATGTAAGGCTTGCTGGCCAGCGGGTGTTGGTTGGCCACTGCCAGCATCGCCTCGTAGGTGAACAGCGGCACGTAAGTGATGCCTGCCAGGTCCACCGGGTCGGAGGTCACCACCAGGTCAAGGTCGCCGCGGGCCAGGGCCGGTAGCGGGGCGAAGGCAAAGCCCGAGGCCAGGTCCAGTTCCACTTCCGGCCAGGCATCACGGAACTGGTCGATGGTCGGCATCAGCCACTGGAAGCAACTGTGGCATTCAATAGC > AE015451/1217658‑1218121 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |