New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AE015451 | 1369367 = | 61 (0.990) | 6 (0.100) | 6/322 | NT | 9.8% | coding (163/1719 nt) | PP_1195 | conserved exported protein of unknown function |
? | AE015451 | 1369415 = | 53 (0.920) | coding (211/1719 nt) | PP_1195 | conserved exported protein of unknown function |
TATTTCTACACTGAAGCTACCGATTCCGATCCGTCGAAGACACCCGGCCCATGACTCTTCCTGTGCGCTACCTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCGATCTGC > AE015451/1369155‑1369594 | tATTTCTACACTGAAGCTACCGATTCCGATCCGTCGAAGACACCCGGCCCATGACTCTTCCTGTGCGCTACCTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGaaa > 2:504559/1‑234 (MQ=255) tACACTGAAGCTACCGATTCCGGTCCGTCGAAGACACCCGGCCCATGACTCTTCCTGTGCGCTCCCTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCAcc < 1:348824/212‑1 (MQ=255) aGCTACCGATTCCGATCCGTCGAAGACACCCGGCCCATGACTCTTCCTGTGCGCTACCTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTg > 1:813795/1‑235 (MQ=255) catgccattgacgcagatcgaggcgaagccggtgatggtaccgacgatgcctgtacccccagtaccacccgggcgcaggatcggcgtaccggtaccacctacatcaccgtggcgctgatcaaagtaggtgccgtccacaccctccgccaccgcgcctgtgccgcctgtaccacccgggcgttgctggactggg < 2:221910‑M1/1‑1 (MQ=255) cattgacgcagatcgaggcgaagccggtgatggtaccgacgatgcctgtacccccagtaccacccgggcgcaggatcggcgtaccggtaccacctacatcaccgtggcgctgatcaaagtaggtgccgtccacaccctccgccaccgcgcctgtgccgcctgtaccacccgggcgttgctggactggGGCACCgg < 1:1125684‑M1/8‑1 (MQ=255) cGATCCGTCGAAGACACCCGGCCCATGACTCTTCCTGTGCGCTACCTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGccc > 1:891138/1‑235 (MQ=255) ctCCGTCGAAGACACCCGGCCCATGACTCTTCCTGTGCGCTACCTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGccgcc < 1:431771/234‑4 (MQ=255) agccGTCGAAGACACCCGGCCCATGACTCTTCCTGTGCGCTACCTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCAc < 1:346910/223‑1 (MQ=255) cgcagatcgaggcgaagccggtgatggtaccgacgatgcctgtacccccagtaccacccgggcgcaggatcggcgtaccggtaccacctacatcaccgtggcgctgatcaaagtaggtgccgtccacaccctccgccaccgcgcctgtgccgcctgtaccacccgggcgttgctggactggGGCa > 1:853535‑M1/182‑185 (MQ=255) gAAGACACCCGGCCCATGACTCTTCCTGTGCGCTACCTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGc < 1:723119/235‑1 (MQ=255) 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ggCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACttt < 1:138599/147‑1 (MQ=255) gCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTAc > 2:944525/1‑205 (MQ=255) tGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTgcg < 2:631584/190‑1 (MQ=255) cAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGGGGCGGAGGGGGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGGACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGGACAGGGATCGTCGGTACCATCACCGGCtt > 1:278741/1‑236 (MQ=255) tCCCGGCGGTATGTGCGGCCCCGTTGCACGCCATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCaa < 2:288145/76‑1 (MQ=255) cccGGCGGTATGGGCGGCACCGGGGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACgg < 2:58467/125‑1 (MQ=255) cgttgctggactggGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCTCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTa < 2:584562‑M1/202‑1 (MQ=255) cggcggTATGGGGGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGTTGGTACAGGCAGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTCCGCCGATCCTGCGTCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCa > 2:632986/1‑218 (MQ=255) cggcggTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCt > 2:1022041/1‑233 (MQ=255) cggcggTAGGGGCGGCGCCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCGCCGGTg < 2:192349/59‑1 (MQ=255) ttgctggactggGGCACCGGTGCACGCAATGACAATGGCGGCGTCGGTGGCGCCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGGACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGCGGGGGTGGACggcgc < 2:107616‑M1/113‑3 (MQ=255) ctggactggGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTGCTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCAcc < 1:581556‑M1/210‑1 (MQ=255) gTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCGATCTGc < 1:238994/236‑1 (MQ=255) gggCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCGATCTGc < 1:53708/232‑1 (MQ=255) GGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCg > 2:891137‑M1/1‑222 (MQ=255) | TATTTCTACACTGAAGCTACCGATTCCGATCCGTCGAAGACACCCGGCCCATGACTCTTCCTGTGCGCTACCTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCGATCTGC > AE015451/1369155‑1369594 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |