| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 1369367 = | 61 (0.990) | 6 (0.100) | 6/322 | NT | 9.8% | coding (163/1719 nt) | PP_1195 | conserved exported protein of unknown function |
| ? | AE015451 | 1369415 = | 53 (0.920) | coding (211/1719 nt) | PP_1195 | conserved exported protein of unknown function | |||||
CGATCCGTCGAAGACACCCGGCCCATGACTCTTCCTGTGCGCTACCTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCGATCTGCGTCAATGGCATGGAAGTGCACTATGGCAAGGACGTACCGGTGAGTGAGAACGGT > AE015451/1369181‑1369648 | cGATCCGTCGAAGACACCCGGCCCATGACTCTTCCTGTGCGCTACCTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGccc > 1:891138/1‑235 (MQ=255) gAAGACACCCGGCCCATGACTCTTCCTGTGCGCTACCTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGc < 1:723119/235‑1 (MQ=255) aGACACCCGGCCCATGACTCTTCCTGTGCGCTACCTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAAc > 1:917726/1‑236 (MQ=255) gCCCATGACTCTTCCTGTGCGCTACCTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGggtg < 1:504560/236‑1 (MQ=255) ggtgatggtaccgacgatgcctgtacccccagcaccacccgggcgcaggatcggcgtaccggtaccacctacatcaccgtggcgctgatcaaagtaggtgccgtccacaccctccgccaccgcgcctgtgccgcctgtaccacccgggcgttgctggactggggcaccggtgccaccgacgccgccattttcattgcgtgcaccggtgccCCAGTCCAg < 1:581556‑M2/9‑1 (MQ=255) taccgacgatgcctgtacccccagtaccacccgggcgcaggatcggcgtaccggtaccacctacatcaccgtggcgctgatcaaagtaggtgccgtccacaccctccgccaccgagcctgtgccgcctgtaccacccgggcgttgctggactggggcaccggtgccaccgacgccgccattttcattgcgtgcaccggtgccCCAGTCCAGCAACg < 2:584562‑M2/14‑1 (MQ=255) cTGTGCGCTACCTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGcaca > 1:849192/1‑236 (MQ=255) cTGTGCGCTACCTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGcaca > 1:814506/1‑236 (MQ=255) ccTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCa > 1:631585/1‑193 (MQ=255) ccTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTg > 1:1068759/1‑235 (MQ=255) ccTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTGTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTcc < 1:108066/197‑1 (MQ=255) tCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTgg < 2:402668/234‑1 (MQ=255) gTGCTGTCATGTTTGCCGTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGccc < 1:149206/202‑1 (MQ=255) tGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACgg < 1:20069/234‑1 (MQ=255) ccTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCt > 1:1042703/1‑236 (MQ=255) cGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAg < 2:324764/197‑1 (MQ=255) ggggAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGgtg < 1:697963/212‑1 (MQ=255) gAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGcc < 1:968933/236‑1 (MQ=255) ccTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAgg > 2:770493/1‑203 (MQ=255) agggCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGt < 1:861396/232‑1 (MQ=255) gAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCaa < 2:476800/147‑1 (MQ=255) aGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCgg < 2:519987/177‑1 (MQ=255) tggcgctgatcaaagtgggtgccgtccacaccctccgcccccgcgcctgtgccgcctgtaccacccgggcgttgctggactggggcaccggtgccaccgacgccgccattttcattgcgtgcaccggtgccCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGcac < 2:404096‑M2/35‑1 (MQ=255) gggcCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGtgtg < 1:303512/178‑1 (MQ=255) gcgccgtccacccccgccgccaccgcgcctgtgccgcctgtcccacccgggcgttgctggactggggcaccggcgccaccgacgccgccattgtcattgcgtgcaccggtgccCCAGTCCAGCaa < 2:107616‑M2/12‑1 (MQ=255) tgtCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACgg < 2:442290/174‑1 (MQ=255) ccgtccacaccctccgccaccgcgcctgtgccgcctgtacctcccgggcgttgctggactggggcaccggtgccaccgacgccgccattttcattgcgtgcaccggtgccCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTg < 2:690342‑M2/45‑1 (MQ=255) cAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGggtg > 1:435086/1‑236 (MQ=255) tGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCa > 1:845516/1‑180 (MQ=255) aCGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGGATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGccc < 1:49763/223‑1 (MQ=255) aCGAGATGGGTATAGCCGGTGCCGCAAGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGt > 1:439776/1‑193 (MQ=255) caccgcgcctgtgccgcctgtaccacccgggcgttgctggactggGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGAGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACgg < 2:690342‑M1/110‑1 (MQ=255) cgtgcaccGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTggggg > 1:653100/7‑229 (MQ=255) gCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCAtcg < 1:206209/235‑1 (MQ=255) gtgccgcctgtaccacccgggcgttgctggactggGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGGGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCCACTTTGATCAGCGCCa < 2:404096‑M1/131‑1 (MQ=255) ccGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTAc > 1:1107334/1‑235 (MQ=255) ccGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGGACAg > 1:317660/1‑108 (MQ=255) cGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAATGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAgg < 1:1112104/222‑1 (MQ=255) cGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGCTGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTgc > 2:904212/1‑197 (MQ=255) cGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCa > 1:550051/1‑236 (MQ=255) cGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGACCCCGTCCAg > 2:297200/1‑88 (MQ=255) cAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATc > 1:613496/1‑236 (MQ=255) ggCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACttt < 1:138599/147‑1 (MQ=255) gCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTAc > 2:944525/1‑205 (MQ=255) tGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTgcg < 2:631584/190‑1 (MQ=255) cAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGGGGCGGAGGGGGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGGACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGGACAGGGATCGTCGGTACCATCACCGGCtt > 1:278741/1‑236 (MQ=255) tCCCGGCGGTATGTGCGGCCCCGTTGCACGCCATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCaa < 2:288145/76‑1 (MQ=255) cccGGCGGTATGGGCGGCACCGGGGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACgg < 2:58467/125‑1 (MQ=255) cgttgctggactggGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCTCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTa < 2:584562‑M1/202‑1 (MQ=255) cggcggTATGGGGGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGTTGGTACAGGCAGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTCCGCCGATCCTGCGTCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCa > 2:632986/1‑218 (MQ=255) cggcggTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCt > 2:1022041/1‑233 (MQ=255) ttgctggactggGGCACCGGTGCACGCAATGACAATGGCGGCGTCGGTGGCGCCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGGACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGCGGGGGTGGACggcgc < 2:107616‑M1/113‑3 (MQ=255) ctggactggGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTGCTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCAcc < 1:581556‑M1/210‑1 (MQ=255) gTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCGATCTGc < 1:238994/236‑1 (MQ=255) gggcggcaccggtgccaccgacgccgccattttcattgcgtgcaccggtgccCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGAt < 1:854445‑M2/113‑1 (MQ=255) gggCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCGATCTGc < 1:53708/232‑1 (MQ=255) GGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCg > 2:891137‑M1/1‑222 (MQ=255) CACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTGCAGGCATCGTCGGTACCa < 1:54369‑M1/203‑1 (MQ=255) CGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCGATCTGCGTCAATGGCATg < 1:838080‑M1/235‑1 (MQ=255) GGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGCGGCGGAGGGTGGGGACGGCAc < 2:96493‑M1/107‑1 (MQ=255) TGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCGATCTGCGTCAATGGCCTGGaa < 1:851155‑M1/235‑1 (MQ=255) CACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTAc < 2:1105843‑M1/193‑1 (MQ=255) cAATGAAGATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCGATCTGCGTCAATGGCATGGAAGTGc < 1:160868/233‑1 (MQ=255) aTGAAAGTGGCGGCGTCGGGGGCCCCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCGATCTGCGTCAATg < 2:278740/219‑1 (MQ=255) aTGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCGATCTGCGTCAATGGCATGGAAGTGCACTa < 1:34853/235‑1 (MQ=255) aaaaTGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCGCAGTCCAGCAGCGCCCGGGTGGTACAGGCGTCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTgc < 2:380588/147‑1 (MQ=255) aaaTGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAgg > 2:658989/1‑171 (MQ=255) gggcggcGTCGGTGGCACCGGTGCGCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTAc < 2:321614/125‑1 (MQ=255) gcggcgTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGccc < 2:849191/145‑1 (MQ=255) cggcgTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGccc > 2:715771/1‑144 (MQ=255) cggcgTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGccc < 1:715772/144‑1 (MQ=255) ggcgTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAg < 2:504657/99‑1 (MQ=255) gTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAg > 2:961910/1‑156 (MQ=255) ccggtgccCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCGATCTGCGTCAATg < 1:1125684‑M2/187‑1 (MQ=255) ggtgccCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGccc < 2:434826‑M2/122‑1 (MQ=255) gtggcCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGccc < 2:83133‑M2/122‑1 (MQ=255) gtgccCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGGGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTc > 2:226640‑M2/6‑178 (MQ=255) tgccCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCGATCTGCg > 1:853535‑M2/5‑185 (MQ=255) cCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCGATCTGCGTCAATGGCATg < 2:221910‑M2/192‑1 (MQ=255) ccAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCGATCTGCGTCAATGGCATGGAAGTGCACTATGGCAAGGACGTACCg < 2:961866/219‑1 (MQ=255) ccAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCGATCTGCGTCAATGGCATGGAAGTGCACTATGGCAAGGACGTACCGGTGAGTGAGAACGGt < 1:1022042/234‑1 (MQ=255) | CGATCCGTCGAAGACACCCGGCCCATGACTCTTCCTGTGCGCTACCTCAGTGCTGTCATGTTTGCCCTGGTTTTCGGGGGGAACCTGATGGCCCCGGCCGAGGTGGCCGCAGCGCCGGTGTGTGTCAGCCGTGACGAGATGGGTATGGCCGGTGCCGCAGGCCTGCAGTTTCCCGGCGGTATGGGCGGCACCGGTGCACGCAATGAAAATGGCGGCGTCGGTGGCACCGGTGCCCCAGTCCAGCAACGCCCGGGTGGTACAGGCGGCACAGGCGCGGTGGCGGAGGGTGTGGACGGCACCTACTTTGATCAGCGCCACGGTGATGTAGGTGGTACCGGTACGCCGATCCTGCGCCCGGGTGGTACTGGGGGTACAGGCATCGTCGGTACCATCACCGGCTTCGCCTCGATCTGCGTCAATGGCATGGAAGTGCACTATGGCAAGGACGTACCGGTGAGTGAGAACGGT > AE015451/1369181‑1369648 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |