New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 1672366 | 46 (0.740) | 6 (0.100) | 6/324 | NT | 12.6% | coding (523/1806 nt) | PP_1467 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
? | AE015451 | = 1672526 | 40 (0.690) | coding (363/1806 nt) | PP_1467 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
ATCACGGTCACGGCAAGTAGCCCGGACTCGTGCATGATCTGGTTGGCGGCGATGAATATCCCCAGTACCGCCGCCAGTGACGCGAGGTTGTGCAGATACTCTGGTAGCCACTGTTCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCC > AE015451/1672134‑1672600 | aTCACGGTCACGGCAAGTAGCCCGGACTCGTGCATGATCTGGTTGGCGGCGATGAATATCCCCAGTACCGCCGCCAGTGACGCGAGGTTGTGCAGATACTCTGGTAGCCACTGTTCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCgatg < 2:405909/234‑1 (MQ=255) cGGACTCGTGCATGATCTGGTTGGCGGCGATGAATATCCCCAGTACCGCCGCCAGTGACGCGAGGTTGTGCAGATACTCTGGTAGCCACTGTTCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACg < 2:772655/233‑1 (MQ=255) gACTCGTGCATGATCTGGTTGGCGGCGATGAATATCCCCAGTACCGCCGCCAGTGACGCGAGGTTGTGCAGATACTCTGGTAGCCACTGTTCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGACGCt > 2:1024564/1‑218 (MQ=255) cTGGTTGGCGGCGATGAATATCCCCAGTACCGCCGCCAGTGACGCGAGGTTGTGCAGATACTCTGGTAGCCACTGTTCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCg < 1:693595/236‑1 (MQ=255) cTGGTTGGCGGCGATGAATATCCCCAGTACCGCCGCCAGTGACGCGAGGTTGTGCAGATACTCTGGTAGCCACTGTTCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCg < 1:452750/236‑1 (MQ=255) gcggcgATGAATATCCCCAGTACCGCCGCCAGTGACGCGAGGTTGTGCAGATACTCTGGTAGCCACTGTTCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTc > 2:499116/1‑233 (MQ=255) gAATATCCCCAGTACCGCCGCCAGTGACGCGAGGTTGTGCAGATACTCTGGTAGCCACTGTTCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGa < 2:955814/233‑1 (MQ=255) cgccgcCAGTGACGCGAGGTTGTGCAGATACTCTGGTAGCCACTGTTCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGCGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGa > 1:236631/1‑179 (MQ=255) ccAGTGACGCGAGGTTGTGCAGATACTCTGGTAGCCACTGTTCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCg > 2:547107/1‑197 (MQ=255) gTGACGCGAGGTTGTGCAGATACTCTGGTAGCCACTGTTCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAgg > 1:241887/1‑227 (MQ=255) cgAGGTTGTGCAGATACTCTGGTAGCCACTGTTCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCt < 1:1104761/236‑1 (MQ=255) aGATACTCTGGTAGCCACTGTTCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCg > 2:501628/1‑181 (MQ=255) aGATACTCTGGTAGCCACTGTCCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATtcttttcggcaccttgaccctggtgaccggccccacggt < 1:117909‑M1/179‑40 (MQ=255) gTAGCCACTGTTCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATc > 2:257774/1‑179 (MQ=255) ccACTGTTCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCgcagc < 1:775968/235‑1 (MQ=255) tGTTCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGa < 2:245313/148‑1 (MQ=255) tGTTCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATg < 2:679504/234‑1 (MQ=255) gtCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAg < 2:375904/126‑1 (MQ=255) tCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCAc < 1:499117/236‑1 (MQ=255) cgcgCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCgatga < 1:55297/120‑1 (MQ=255) gcgcATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGAt > 2:897898/1‑189 (MQ=255) cagccagcCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTc < 1:797556/235‑1 (MQ=255) cagccCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCgatg < 2:236630/96‑1 (MQ=255) cccccGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACCCCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTGCCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACgcgc < 2:336387/197‑1 (MQ=255) ccccGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCg < 1:147327/131‑1 (MQ=255) cccAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTCGCTCAGGCTGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGAt < 2:610735/128‑1 (MQ=255) ccAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGGGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATtcttttcggcaccttgaccctggtgaccggccccacg > 1:185269‑M1/1‑79 (MQ=255) gggTGGTGCCGTAGAAGAGCAAACAGGAGAAGGTGATGAGGATATGGCTAAGGAAGTTCACCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGAAGATCgg < 2:261799/118‑1 (MQ=255) ggtggtGCCGCAGGAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCGCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCt < 2:17641/160‑1 (MQ=255) ccGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACg > 2:232412/1‑134 (MQ=255) agaagaGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATtcttttcggcaccttgaccctggtga > 2:4060‑M1/1‑64 (MQ=255) agaagaGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATtcttttcggcaccttgaccctggtga < 1:4060‑M1/90‑27 (MQ=255) agaagaGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGc > 1:202033/1‑236 (MQ=255) aagaGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCCGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCAcgcg > 2:83491/1‑167 (MQ=255) aagaGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGGCAAGGTGCCGAAAAGAatcgccagcgccga < 1:208962‑M2/236‑15 (MQ=255) cagacCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCgca < 1:338104/161‑1 (MQ=255) cacaCCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGc < 2:951760/188‑1 (MQ=255) cGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTTAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAAccc < 1:612051/235‑1 (MQ=255) cGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAatcgccagcgccgagggtaacgg > 1:897899‑M2/1‑212 (MQ=255) cGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATcccc > 2:223495/1‑106 (MQ=255) cGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTCCCCAACGCAGGAt > 1:112973/1‑121 (MQ=255) gAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTc < 2:421604/225‑1 (MQ=255) aaGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGagca < 1:975640/235‑1 (MQ=255) gggCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTg < 2:942061/129‑1 (MQ=255) ggCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGAGCGGGTCGAGCATGATCCCTTCCCAACGCAggcg > 2:57157/1‑101 (MQ=255) aGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGaa > 1:268474/1‑206 (MQ=255) gCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGACTCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCa < 1:1108356/236‑1 (MQ=255) gCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCa < 1:741433/236‑1 (MQ=255) ccGTTACCCTCGGCGCTGGCGATtcttttcggcaccttgaccctggtgaccggccccacggtgatcgtgcccatgctgcgcgtggtgcggccaaaggcagcgatcgcgaacatcctgcgttgggaagggatcatgatcgacccgatcggcgcgctgctcgccgtggtggtctacagcttcatcatcgccagcgccgagggtaacggcctgagccagagcctcatcaccttcgccg > 1:897899‑M1/1‑23 (MQ=255) ccGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCa > 2:616445/1‑163 (MQ=255) ccTCGGCGCTGGCGATtcttttcggcaccttgaccctggtgaccggccccacggtgatcgtgcccatgctgcgcgtggtgcggccaaaggcagcgatcgcgaacatcctgcgttgggaagggatcatgatcgacccgctcggcgcgctgctcgccgtggggggctacagcgtcatcctcgccgg > 2:208962‑M1/1‑16 (MQ=255) ccTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAAc > 1:568819/1‑81 (MQ=255) tCGGCGCTGGCGATtcttttcggcaccttgcccctggtgaccggccccacggtgatcgtgcccatgctgcgcgtggtgcggccaaaggcagcgatcgcgaacatcctgcgttgggaagggatcatgatcgacccgatcggcgcgctgctcgccgtggtggtctacagcttcatcatcgccagcgccgagggtaacggcctgagccagagcctcatcaccttcgccggtgtgctctt < 1:208962‑M1/236‑223 (MQ=255) tCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCCCGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTg < 2:160415/100‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTg < 1:1024565/235‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTg < 1:257775/235‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGCGTCGAGCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTc > 2:685686/1‑87 (MQ=255) ccggcgAGGATGACGCTGTAGCCCCCCACGGCGAGCAGCGCGCCGAGCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAatcgccagcgccgagg > 2:208962‑M2/3‑168 (MQ=255) ggCGCTGATGAACCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCGGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCAt < 2:953578/117‑1 (MQ=255) tgatgaAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGcc < 1:738900/235‑1 (MQ=255) | ATCACGGTCACGGCAAGTAGCCCGGACTCGTGCATGATCTGGTTGGCGGCGATGAATATCCCCAGTACCGCCGCCAGTGACGCGAGGTTGTGCAGATACTCTGGTAGCCACTGTTCGCGCATGATTTGCCCCAGCAGCCAGCCCCCCGCCGCGCCCAGGGTGGTGCCGCAGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCC > AE015451/1672134‑1672600 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |