New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 1672366 | 46 (0.740) | 6 (0.100) | 6/324 | NT | 12.6% | coding (523/1806 nt) | PP_1467 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
? | AE015451 | = 1672526 | 40 (0.690) | coding (363/1806 nt) | PP_1467 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
AGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGATCTCGCGCCACTGCGACAGGTGCAGGGTCAGGCTGCCTTCGAACAGAATCAGCGCCACCGACAGCGACACCAGCGGCATCAGCAATGGGCCGAACAGCGCCTCGGGGTCGAGCCATCCCAGCGCTGG > AE015451/1672303‑1672759 | agaagaGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGc > 1:202033/1‑236 (MQ=255) aagaGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGGCAAGGTGCCGAAAAGAatcgccagcgccga < 1:208962‑M2/236‑15 (MQ=255) cGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTTAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAAccc < 1:612051/235‑1 (MQ=255) cGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAatcgccagcgccgagggtaacgg > 1:897899‑M2/1‑212 (MQ=255) gAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTc < 2:421604/225‑1 (MQ=255) aaGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGagca < 1:975640/235‑1 (MQ=255) aGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGaa > 1:268474/1‑206 (MQ=255) gCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGACTCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCa < 1:1108356/236‑1 (MQ=255) gCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCa < 1:741433/236‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTg < 1:1024565/235‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTg < 1:257775/235‑1 (MQ=255) ccggcgAGGATGACGCTGTAGCCCCCCACGGCGAGCAGCGCGCCGAGCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAatcgccagcgccgagg > 2:208962‑M2/3‑168 (MQ=255) tgatgaAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGcc < 1:738900/235‑1 (MQ=255) accaccACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGt > 2:908359/1‑209 (MQ=255) caccacGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGtt < 2:1094302/184‑1 (MQ=255) caccacGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCa < 2:568818/197‑1 (MQ=255) gccacGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCa < 2:748886/195‑1 (MQ=255) acGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGcac < 1:251280/236‑1 (MQ=255) agcGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAACGAATCGCCCGCGGCCAGTCGaa > 2:104642/1‑152 (MQ=255) agcGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCt > 2:599099/1‑233 (MQ=255) agcGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGc < 1:999541/235‑1 (MQ=255) gcCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTg < 1:534435/197‑1 (MQ=255) ccGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGcc > 2:887434/1‑139 (MQ=255) cGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAg > 2:539112/1‑158 (MQ=255) ccAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCAcc > 2:790873/1‑178 (MQ=255) aTGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGATCTCGCGCCACTGCGACAGGTGCAGGGTCAGGCTGCCTTc < 1:547108/236‑1 (MQ=255) aTGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGATCTCGCGCCACTGCGACAGGTGCAGGGTCAGGCTGCCTTc > 1:233160/1‑236 (MQ=255) cgATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCCGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGAcct > 2:774180/1‑192 (MQ=255) gATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGATCTCGCGCCACTGCGACAGGTGCAGGGTCAGGCTGCCTTCGAACAg > 1:573788/1‑234 (MQ=255) gATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGATCTCGCGCCACTGCGACAGGTGCAGGGTCAGGCTGCCTTCGAACAGa > 1:710513/1‑235 (MQ=255) cGCACCCCGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGATCTCGCGCCACTGCGACAGGTGCAGGGTCAGGCTGCCTTCGAACAGAATCAGCGCCACCGACAg < 1:174616/236‑1 (MQ=255) acGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGGTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGaa > 2:304696/1‑166 (MQ=255) gcagcaTGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGATCTCGCGCCACTGc < 1:433/176‑1 (MQ=255) tGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTAGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGATCTCGCGCCACTGCg > 2:1132446/1‑171 (MQ=255) tGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTAGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGATCTCGCGCCACTGCg < 1:1132447/171‑1 (MQ=255) aCCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAatcgccagcgccgagggtaacggcctgagccagagcctcatcaccttcgccggtgtgctcttctgcggcaccaccctgggcgcggcggggggctggctgctggggcaaatcatgcgcggacagtggctaccagagtatct < 1:117909‑M2/179‑141 (MQ=255) cGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAatcgccagcgccgagggtaacggcctgagccagagcctcatccccttcgccggtgtgctcttctgcggcaccaccctgg > 1:185269‑M2/1‑37 (MQ=255) ggggCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGATCTCGCGCCACTGCGACAGGTGCAGGGTCAgg > 1:262220/1‑172 (MQ=255) ggTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGATCTCGCGCCACTGCGGCAGGt > 2:173586/1‑155 (MQ=255) tCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAatcgccagcgccgagggtaacggcctgagccagagcctcatcaccttcgccggtgtgctcttct > 2:4060‑M2/1‑26 (MQ=255) tCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAatcgccagcgccgagggtaacggcctgagccagagcctcatcaccttcgccggtgtgctcttct < 1:4060‑M2/90‑65 (MQ=255) gggTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGATCTCGCGCCACTGCGACAGGTGCAGGGTCAGGCTGCCTTCGAACAGAATCAGCGCCACCGACAGCGACACCAGCGGCATCAGCAATGGGCCGAACAGCGCCTCGGGGTCg < 1:382514/236‑1 (MQ=255) aGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAAt < 1:1019005/64‑1 (MQ=255) aGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAAt > 2:1019004/1‑64 (MQ=255) ccGAAAAGAATCGCCCGCGGCCAGTCGACCCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGATCTCGCGCCACTGCGACAGGTGCAGGGTCAGGCTGCCTTCGAACAGAATCAGCGCCACCGACAGCGacac < 2:202033/185‑1 (MQ=255) ccGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGACCCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGATCTCGCGCCACTGCGACAGGTGCAGGGTCAGGCTGCCTTCGAACAGAATCAGCGCCACCGACAGCGACACCAGCGGCATCAGCAATGGGCCGAACAGCGCCTCGGGGTCGAGCCATCCCAg < 1:377725/236‑1 (MQ=255) aaaaGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAg > 2:1014148/1‑50 (MQ=255) aaaaGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAg < 1:1014149/50‑1 (MQ=255) aaaaGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGATCTCGCGCCACTGCGACAGGTGCAGGGTCAGGCTGCCTTCGAACAGAATCAGCGCCACCGACAGCGACACCAGCGGCATCAGCAATGGGCCGAACAGCGCCTCgg < 1:616446/217‑1 (MQ=255) aGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGATCTCGCGCCACTGCGACAGGTGCAGGGTCAGGCTGCCTTCGAACAGAATCAGCGCCACCGACAGCGACACCAGCGGCATCAGCAATGGGCCGAACAGCGCCTCGGGGTCGAGCCATCCCAGCGCTgg < 1:908360/236‑1 (MQ=255) | AGAAGAGCACACCGGCGAAGGTGATGAGGCTCTGGCTCAGGCCGTTACCCTCGGCGCTGGCGATGATGAAGCTGTAGACCACCACGGCGAGCAGCGCGCCGATCGGGTCGATCATGATCCCTTCCCAACGCAGGATGTTCGCGATCGCTGCCTTTGGCCGCACCACGCGCAGCATGGGCACGATCACCGTGGGGCCGGTCACCAGGGTCAAGGTGCCGAAAAGAATCGCCAGCGGCCAGTCGAACCCGAGCAGCCAGTGGGTTGCCAGTGCAATCACCAGCCAGGTGACCAGTGCGCCCACCGTGACCAGGCGATGCACCACGCTGCCGATCTCGCGCCACTGCGACAGGTGCAGGGTCAGGCTGCCTTCGAACAGAATCAGCGCCACCGACAGCGACACCAGCGGCATCAGCAATGGGCCGAACAGCGCCTCGGGGTCGAGCCATCCCAGCGCTGG > AE015451/1672303‑1672759 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |