| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 4062647 | 52 (0.840) | 3 (0.050) | 3/322 | NT | 5.9% | coding (1692/2088 nt) | PP_3581 | conserved membrane protein of unknown function |
| ? | AE015451 | = 4062757 | 47 (0.810) | coding (1582/2088 nt) | PP_3581 | conserved membrane protein of unknown function | |||||
CCAACGCCTGGCCCAGTGCGACGATTGCCGAAACAATCGCTGCATCGTCACTGTCCTGCTCCAGATCACGTACGAAGCCGCGGTCGATTTTCAGCTCGTTGGCTGGCAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGC > AE015451/4062418‑4062854 | ccAACGCCTGGCCCAGTGCGACGATTGCCGAAACAATCGCTGCATCGTGACTGTCCTGCTCCAGATCACGTACGAAGCCGCGGTCGATTTTCAGCGCGTTGGCTGGCAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCg < 1:1002421/236‑1 (MQ=255) cccAGTGCGACGATTGCCGAAACAATCGCTGCATCGTCACTGTCCTGCTCCAGATCACGTACGAAGCCGCGGTCGATTTTCAGCTCGTTGGCTGGCAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTcc > 2:1047852/1‑234 (MQ=255) ccAGTGCGACGATTGCCGAAACAATCGCTGCATCGTCACTGTCCTGCTCCAGATCACGTACGAAGCCGCGGTCGATTTTCAGCTCGTTGGCTGGCAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAgt < 1:833215/236‑1 (MQ=255) gAAACAATCGCTGCATCGTCACTGTCCTGCTCCAGATCACGTACGAAGCCGCGGTCGATTTTCAGCTCGTTGGCTGGCAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTtggctgg > 1:1006377/1‑236 (MQ=255) aaTCGCTGCATCGTCACTGTCCTGCTCCAGATCACGTACGAAGCCGCGGTCGATTTTCAGCTCGTTGGCTGGCAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAg < 1:133775/235‑1 (MQ=255) cATCGTCACTGTCCTGCTCCAGATCACGTACGAAGCCGCGGTCGATTTTCAGCTCGTTGGCTGGCAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTctg < 1:261612/235‑1 (MQ=255) cACTGTCCTGCTCCAGATCACGTACGAAGCCGCGGTCGATTTTCAGCTCGTTGGCTGGCAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAgg < 1:1047853/236‑1 (MQ=255) tCCAGATCACGTACGAAGCCGCGGTCGATTTTCAGCTCGTTGGCTGGCAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCAc > 1:578653/1‑236 (MQ=255) cAGATCACGTACGAAGCCGCGGTCGATTTTCAGCTCGTTGGCTGGCAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACg > 1:708932/1‑235 (MQ=255) cAGATCACGTACGAAGCCGCGGTCGATTTTCAGCTCGTTGGCTGGCAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGGTTCGGTAATTTcc > 2:803202/1‑184 (MQ=255) cAGATCACGTACGAAGCCGCGGTCGATTTTCAGCTCGTTGGCTGGCAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGGTTCGGTAATTTCCAGCGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAgtc > 1:322288/1‑208 (MQ=255) ctcgcGTACGAAGCCGCGGTCGATTGTCAGCTCGTTGGCTGGCAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAg < 2:344281/201‑1 (MQ=255) cACGTACGAAGCCGCGGTCGATTTTCAGCTCGTTGGCTGGCAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTg > 2:968381/1‑233 (MQ=255) ccGCGGTCGATTTTCAGCTCGTTGGCTGGCAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAgt > 2:811320/1‑171 (MQ=255) tCGTTGGCTGGCAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTtggctggc < 1:98892/171‑1 (MQ=255) tCGTTGGCTGGCAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATgg > 1:389505/1‑235 (MQ=255) ggctggcAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAgcc > 2:862752/1‑207 (MQ=255) gCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAAttt < 2:684100/134‑1 (MQ=255) gCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAAttt > 1:684101/1‑134 (MQ=255) tCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCgccagcca > 1:967255/1‑236 (MQ=255) gCCCGTACCAAACTCATCAATGCACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAggg < 1:952739/149‑1 (MQ=255) cccGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGAcc < 1:937891/168‑1 (MQ=255) gTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCa > 1:950625/1‑235 (MQ=255) gTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGGTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACg > 2:376437/1‑156 (MQ=255) cAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGCCCGGCATgg > 2:762520/1‑173 (MQ=255) cAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCa > 1:526975/1‑235 (MQ=255) cAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCAGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCTACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCa > 1:603586/1‑235 (MQ=255) aaaGTCATGAATGGACAAGTCCACGCCCATGTAGGACAGGCGCTGCAGCAGGGTCAGGCGGGCATCGGGATCGTATAAGGCGGTGGATTCGGTAATTTCCAgt > 2:1025676/1‑103 (MQ=255) aaGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTg < 1:464079/236‑1 (MQ=255) tcaATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCa < 1:115022/235‑1 (MQ=255) aaTGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCa > 1:727433/1‑225 (MQ=255) aTGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGGACTGGATg > 2:245747/1‑174 (MQ=255) gACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGAc < 1:962155/235‑1 (MQ=255) aCAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGaacctgtcggccatccagttctgccatgccggtctgg > 2:1019569‑M1/1‑71 (MQ=255) aCAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGaacctgtcggccatccagttctgccatgccggtctgg < 1:1019570‑M1/108‑38 (MQ=255) aGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCAACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCa > 1:357906/1‑225 (MQ=255) cACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGc < 2:708931/234‑1 (MQ=255) aCGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACt > 1:572649/1‑157 (MQ=255) aCGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACt < 2:572648/157‑1 (MQ=255) agCCCATGTCGGACAGGCGCGGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCAt < 1:244177/191‑1 (MQ=255) gCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTcacc < 2:553247‑M2/175‑5 (MQ=255) gCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCa > 1:421465/1‑235 (MQ=255) ccATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGt < 1:1134692/235‑1 (MQ=255) ccATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGt > 1:478462/1‑235 (MQ=255) cGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGaacctgtcggccatccagttctgccatgccggtctggtcgacagcgtggcccgcgccctgcagcagaacggcttgccagccaactgcctgacactggaaattaccgcaaccaccg > 1:1088190‑M1/1‑53 (MQ=255) cGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACCGGtt > 2:359540/1‑163 (MQ=255) cGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGAc > 1:178890/1‑207 (MQ=255) gACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCGGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTAc < 2:578652/233‑1 (MQ=255) aCGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAg < 2:252323/89‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATc > 1:450079/1‑235 (MQ=255) cAGGCTGGCATCGGCATCGTGCAGGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTg < 2:845260/192‑1 (MQ=255) gCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGc < 1:18643/235‑1 (MQ=255) tGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAgg < 1:1100072/181‑1 (MQ=255) aTGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAg > 1:647721/1‑188 (MQ=255) aTGGCGGTGGTTGCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTAc < 1:205879/191‑1 (MQ=255) ggCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGTAGCTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATCCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCa < 2:1066679/164‑1 (MQ=255) cGGTGGTTGCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTcaccgccatgcacgatgccgatgccagcctgaccgtgctgcagcgcctgtccg > 1:1088190‑M2/1‑115 (MQ=255) ggTGaacctgtcggccatccagttctgccatgccggtctggtcgacagcgtggcccgcgccctgcagcagaacggcttgccagccaactgcctgacactggaaattaccgaaaccaccgccatgcacgatgccgatgccagcctgaccgtgctgcagcgcctgtccgacatgggc < 2:553247‑M1/175‑172 (MQ=255) | CCAACGCCTGGCCCAGTGCGACGATTGCCGAAACAATCGCTGCATCGTCACTGTCCTGCTCCAGATCACGTACGAAGCCGCGGTCGATTTTCAGCTCGTTGGCTGGCAGGCGTTTGAGGTACATCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGC > AE015451/4062418‑4062854 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |