New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 4062647 | 52 (0.840) | 3 (0.050) | 3/322 | NT | 5.9% | coding (1692/2088 nt) | PP_3581 | conserved membrane protein of unknown function |
? | AE015451 | = 4062757 | 47 (0.810) | coding (1582/2088 nt) | PP_3581 | conserved membrane protein of unknown function |
TCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGATGAAGCGGTCAGGCAGCAGCAGGCCCTGCTGCGGGTGCTCCCAGCGCAGCAACGCTTCGGCACCGATCGGTTGGCAGGCCTGGGCGTCGAACTTGGGCTGGTAATG > AE015451/4062541‑4062982 | tCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCgccagcca > 1:967255/1‑236 (MQ=255) gTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCa > 1:950625/1‑235 (MQ=255) cAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCa > 1:526975/1‑235 (MQ=255) cAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCAGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCTACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCa > 1:603586/1‑235 (MQ=255) aaGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTg < 1:464079/236‑1 (MQ=255) tcaATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCa < 1:115022/235‑1 (MQ=255) aaTGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCa > 1:727433/1‑225 (MQ=255) gACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGAc < 1:962155/235‑1 (MQ=255) aGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCAACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCa > 1:357906/1‑225 (MQ=255) cACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGc < 2:708931/234‑1 (MQ=255) agCCCATGTCGGACAGGCGCGGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCAt < 1:244177/191‑1 (MQ=255) gCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTcacc < 2:553247‑M2/175‑5 (MQ=255) gCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCa > 1:421465/1‑235 (MQ=255) ccATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGt > 1:478462/1‑235 (MQ=255) ccATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGt < 1:1134692/235‑1 (MQ=255) cGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACCGGtt > 2:359540/1‑163 (MQ=255) cGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGAc > 1:178890/1‑207 (MQ=255) gACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCGGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTAc < 2:578652/233‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATc > 1:450079/1‑235 (MQ=255) cAGGCTGGCATCGGCATCGTGCAGGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTg < 2:845260/192‑1 (MQ=255) gCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGc < 1:18643/235‑1 (MQ=255) tGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAgg < 1:1100072/181‑1 (MQ=255) aTGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAg > 1:647721/1‑188 (MQ=255) aTGGCGGTGGTTGCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTAc < 1:205879/191‑1 (MQ=255) ggCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGTAGCTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATCCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCa < 2:1066679/164‑1 (MQ=255) cGGTGGTTGCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTcaccgccatgcacgatgccgatgccagcctgaccgtgctgcagcgcctgtccg > 1:1088190‑M2/1‑115 (MQ=255) tttCGGTCATCTCCAGCGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGAc < 1:587452/162‑1 (MQ=255) tttCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGgatga > 2:1020358/1‑201 (MQ=255) tCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGATGAAGCgg < 1:43038/234‑1 (MQ=255) aaTTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGCCGGCAGGcc > 1:915257/1‑163 (MQ=255) cAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGATGAAGCGGTCAGGCAGCAGCAGGcc > 2:959253/1‑234 (MQ=255) cAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTccg > 2:262079/1‑149 (MQ=255) ctgctgCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGATGAAGCGGTCAGGCAGCAGCAGGCCCTGCTGCGGGTGCTCCCAgcg > 2:997882/1‑231 (MQ=255) ctgcAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGATGAAGCGGTCAGgca > 2:804436/1‑197 (MQ=255) cAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGATGAAGCGGTCAGGcagcagcag < 1:1105975/201‑1 (MQ=255) cgcgGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGGTGGCCGACAGGTTCACCGCCATgcgc > 2:857065/1‑68 (MQ=255) gggCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTGTCCGCCAGGCCGac > 2:151457/1‑171 (MQ=255) gCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGATGAAGCGGTCAGGCAGCAGCAGGCCCTGCTGCGGGTGCTCCCAGCGCAGCAAc > 1:147497/1‑222 (MQ=255) tGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGATGAAGCGGTCAGGCAGCAGCAGGCCCTGCTGCGGGTGCTCCCAGCGCAGCAACGCTTCGGCACCGATCGGt < 1:888018/233‑1 (MQ=255) tGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCAGATGAAGCGGTCAGGCAGCAGCAGGCCCTGCTGCGGGTGGTCCCAGCGCAGCAACGCTTCGGCACCGATCGGt < 2:603585/233‑1 (MQ=255) aCCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGATGAAGCGGTCAGGCAGCAGCAGGCCCTGCTGCGGGTGCTCCCAGCgcag < 1:89774/206‑1 (MQ=255) ccAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTcaccgccatgcacgatgccgatgccagcctgaccgtgctgcagcgcctgtccgacatgggcgtggacttgt > 2:1019569‑M2/1‑37 (MQ=255) ccAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTcaccgccatgcacgatgccgatgccagcctgaccgtgctgcagcgcctgtccgacatgggcgtggacttgt < 1:1019570‑M2/108‑72 (MQ=255) aCCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATTCGCCAGCCATGGAGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCATCAGTGAGTACCCACTCACCAATg > 2:661125/1‑118 (MQ=255) ggCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGATGAAGCGGTCAGGCAGCAGCAGGCCCTGCTGCGGGTGCTCCCAGCGCAGCAACGCTTCGGCACCGATCGGTTGGCGGGCCTggg > 1:173277/1‑233 (MQ=255) cATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGATGAAGCGGTCAGGCAGCAGCAGGCCCTGCTGCGGGTGCTCCCAGCGCAGCAACGCTTCGGCACCGATCGGTTGGCAGGCCTGGGCGTc > 1:821967/1‑235 (MQ=255) aTGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCCCCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGa < 2:178890/146‑1 (MQ=255) aTGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGATGAAGCGGTCAGGCAGCAGCAGGCCCTGCTGCGGGTGCTCCCAGCGCAGCAACGCTTCGGCACCGATCGGTTGGCAGGCCTGGGCGTCGa < 1:1020359/236‑1 (MQ=255) tGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGATGAAGCGGTCAGGCAGCAGCAGGCCCTGCTGCGGGTGCTCCCAGCGCAGCAACGCTTCGGCACCGATCGGTTGGCAGGCCTGGGCGTCGa < 1:959254/235‑1 (MQ=255) aaCTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGATGAAGCGGTCAGGCAGCAGCAGGCCCTGCTGCGGGTGCTCCCAGCGCAGCCACGCTTCGGCACCGAt > 1:236694/1‑206 (MQ=255) tGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGATGAAGCGGTCAGgcagcagca < 2:1025719/157‑1 (MQ=255) gCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGATGAAGCGGTCAGGCAGCAGCAGGCCCTGCTGCGGGTGCTCCCAGCGCAGCAACGCTTCGGCACCGATCGGTTGGCAGGCCTGGGCGTCGAACTTGGGCTGGTAAt > 1:840051/1‑235 (MQ=255) ccGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGATGAAGCGGTCAGGCAGCAGCAGGCCCTGCTGCGGGTGCTCCCAGCGCAGCAACGCTTCGGCACCGATCGGTTGGCAGGCCTGGGCGTCGAACTTGGGCTGGTAATg > 1:844351/1‑235 (MQ=255) | TCAGGCTGGAATAGCCCGTACCAAAGTCATCAATGGACAAGTCCACGCCCATGTCGGACAGGCGCTGCAGCACGGTCAGGCTGGCATCGGCATCGTGCATGGCGGTGGTTTCGGTAATTTCCAGTGTCAGGCAGTTGGCTGGCAAGCCGTTCTGCTGCAGGGCGCGGGCCACGCTGTCGACCAGACCGGCATGGCAGAACTGGATGGCCGACAGGTTCACCGCCATGCGCCAGCCATGGTGCCCCTGGTCCAGCCACTGACGCATCTGACGGCAGGCCTCAGTGAGTACCCACTCACCAATGGGGATGATCAGCCCGGTCTTTTCCGCCAGGCCGATGAAGCGGTCAGGCAGCAGCAGGCCCTGCTGCGGGTGCTCCCAGCGCAGCAACGCTTCGGCACCGATCGGTTGGCAGGCCTGGGCGTCGAACTTGGGCTGGTAATG > AE015451/4062541‑4062982 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |