| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 4399867 = | 78 (1.260) | 7 (0.120) | 6/328 | NT | 9.5% | coding (23/972 nt) | PP_3878 | putative Phage minor capsid protein C |
| ? | AE015451 | 4399923 = | 59 (1.000) | coding (1235/1272 nt) | PP_3879 | Phage portal protein, HK97 family | |||||
ATGGACGGGGATCACCTCCACACCCGTCTGGGCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCATA > AE015451/4399635‑4400092 | agggACGGGGAGCACCTCCACACCCGTCTGGGCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTgg < 2:1061123/231‑1 (MQ=255) ggACGGGGATCACCTCCACACCCGTCTGGGCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAg > 1:722776/1‑234 (MQ=255) atgggcATCACCTCCACCCCCGTCTGGGCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAgcgcg < 1:357831/234‑1 (MQ=255) aTCACCTCCACACCCGTCTGGGCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAAt > 1:414924/1‑235 (MQ=255) acCCGTCTGGGCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGc > 1:870814/1‑236 (MQ=255) tGGGCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCa > 2:1077016/1‑233 (MQ=255) gCGATGGCGGCTCGGCGCTGTTCCTCGCGGCGATCCTGCTCCGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCg < 1:372358/227‑1 (MQ=255) gCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGACCAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATc > 1:84609/1‑236 (MQ=255) tgaacatgggcggcgcTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATcc > 1:715552/10‑235 (MQ=255) cggcgaccagaaaagccgctacgacgcctatgcaattggccggcagtgggggtggctgtcgatcaacgacatccggcgcctggaaaacatgccgcccgttgccaacggcgacagttatctgcagccgctcaacatgaccgacgtagccaatgacctgcccgacatgactaaccccaacgtccgcgcccagctggaacaGCAgcgcg > 2:781245‑M1/199‑206 (MQ=255) atgggcggcgcTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCa > 1:869547/5‑204 (MQ=255) cggcgcTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAgc > 1:332895/1‑194 (MQ=255) 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ggcgATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGtcgtcg < 2:257436/223‑1 (MQ=255) ggcgATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTc < 2:910677/234‑1 (MQ=255) tgcaattggccggcagtgggggtggctgtcgatcaacgacatccggcgcctggaaaacatgccgcccgttgccaacggcgacagttatctgcagccgctcaacatgaccgacgtagccaatgacctgcccgacatgactaaccccaacgtccgcgcccagctggaacagcag < 2:819626‑M1/4‑1 (MQ=255) tCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAACTGTCGtt > 2:782398/1‑187 (MQ=255) cAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAgcgc < 2:326396/168‑1 (MQ=255) gccggcagtgggggtggctgtcgatcaacgacatccggcgcctggaaaacatgccgcccgttgccaacggcgacagttatctgcagccgctcaacatgaccgacgtagccaatgacctgcccgacatgactaaccccaacgtccgcgcccagctggaacag < 2:537123‑M1/1‑1 (MQ=255) aGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGAc < 1:1083227/236‑1 (MQ=255) ggTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGTATTGGCTACAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGACGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCAGTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCgctg > 2:697157/1‑210 (MQ=255) ggTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATTCGGCAAGCATCCTCAGGATGtcgtcga > 1:6301/1‑205 (MQ=255) aTCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCCGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGAAGCGCGCAAAGGTCGtt > 2:544282/1‑164 (MQ=255) aTCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGgc > 1:18749/1‑215 (MQ=255) aTCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGt > 1:351899/1‑233 (MQ=255) 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gaccTGGCAGTGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCATa < 2:697254/229‑1 (MQ=255) gaacaGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATg < 1:513665‑M1/167‑1 (MQ=255) | ATGGACGGGGATCACCTCCACACCCGTCTGGGCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCATA > AE015451/4399635‑4400092 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |