| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 4399867 = | 78 (1.260) | 7 (0.120) | 6/328 | NT | 9.5% | coding (23/972 nt) | PP_3878 | putative Phage minor capsid protein C |
| ? | AE015451 | 4399923 = | 59 (1.000) | coding (1235/1272 nt) | PP_3879 | Phage portal protein, HK97 family | |||||
GGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCATAGGCGTCGTAGCGGCTTTTCTGGTCGCCGCGCAGCAGGCCAGAGAGGTTGAACT > AE015451/4399694‑4400145 | ggcgATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTc < 2:910677/234‑1 (MQ=255) aGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGAc < 1:1083227/236‑1 (MQ=255) aTCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGgc > 1:18749/1‑215 (MQ=255) aTCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGt > 1:351899/1‑233 (MQ=255) aTCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTc > 2:1033112/1‑234 (MQ=255) aTCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCa > 1:1028555/1‑235 (MQ=255) aTCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGGTTCATGCGGCAAGCCTCCTCAGGATGGCGTCGCGCTGCTGTTc > 2:361162/1‑206 (MQ=255) gTCATAGAACATCGATGGATGGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTc < 1:188119/236‑1 (MQ=255) tcaacgacctccggcgcctggaaaacatgccgcccgttgccaacggcgacagttatctgcagccgctcaacatgaccgacgtagccaatgccctgcccgacatgactaaccccaacgtccgcgcccagctggaacagcagcgcgacgacatcctgaggatgcttgccgcatgaaacgacatttgcgcgctgcTGTTCCa < 1:355663‑M2/7‑1 (MQ=255) cATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCGAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGTCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGATGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAg < 2:702122/233‑1 (MQ=255) cGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTAGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCAtt > 1:85557/1‑236 (MQ=255) aTGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGgcg > 2:421053/1‑199 (MQ=255) aTGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGgc < 2:1120972/198‑1 (MQ=255) 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ctggaaaacatgccgcccgttgccaacggcgacagttatctgcagccgctcaacatgaccgacgtagccaatgacctgcccgacatgactaaccccaacgtccgcgcccagctggaacagcagcgcgacgacatcctgaggatgcttgccgcatgaaacgacatttgcgcgctgcTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTc < 1:940444‑M2/33‑1 (MQ=255) gcgcCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGtt > 2:511014/1‑174 (MQ=255) gccgccCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGtt < 1:1069335/236‑1 (MQ=255) catgccgcccgttgccaacggcgacagttatctgcagccgctcaacatgaccgacgtagccaatgacctgcccgacatgactaaccccaacgtccgcgcccagctggaacagcagcgcgacgacatcctgaggatgcttgccgcatgaaacgacatttgcgcgctgcTGTTc < 1:513665‑M2/5‑1 (MQ=255) tCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCa < 1:48848/236‑1 (MQ=255) gccaacggcgacagttatctgcagccgctcaacatgaccgacgtagccaatgacctgcccgacatgactaaccccaacgtccgcgcccagctggaacagcagcgcgacgacatcctgaggatgcttgccgcatgaaacgacatttgcgcgctgcTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTc < 1:1097282‑M2/33‑1 (MQ=255) tGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAAc < 1:1033113/236‑1 (MQ=255) gACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAAc > 1:588288/1‑235 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gctggaacagcagcgcgacgacatcctgaggctgcttgccgcatgaaacgacattggcgcgctgcTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAg < 2:1034312‑M2/71‑1 (MQ=255) aGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGCTGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGcc > 1:292155/1‑222 (MQ=255) tggaacaGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGGCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGAGGTCGTTGa < 1:355663‑M1/192‑1 (MQ=255) gaccTGGCAGTGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCATa < 2:697254/229‑1 (MQ=255) gaacaGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATg < 1:513665‑M1/167‑1 (MQ=255) CGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCATAGGc < 1:835150‑M1/223‑1 (MQ=255) aaaTGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTc > 2:374499/1‑163 (MQ=255) aaTGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCATAGGCGTCGTAGCGGCTTTTCt < 1:749186/236‑1 (MQ=255) aaTGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGCTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCATAGGCGTCTTAGCGGCTTTTCt < 1:697158/236‑1 (MQ=255) gTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTg < 2:373871/195‑1 (MQ=255) gTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCATAGGCGTCGTAGCGGCTTTTCTGGTcg < 1:880042/235‑1 (MQ=255) ttCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGGCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGGTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCggc > 2:159963/1‑164 (MQ=255) tGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCATAGGCGTCGTAGCGGCTTTTCTGGTCGCcgcg < 1:891361/234‑1 (MQ=255) ggCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCACACTGCCGGCCAATTGCATAGGCGTCGTAGCGGCTTTTCTGGTcgcc < 1:538132/228‑1 (MQ=255) tCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCg < 2:913256/178‑1 (MQ=255) aGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCATAGGCGTCGTAGCGGCTTTTCt < 1:898699/208‑1 (MQ=255) gATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATGGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCATAGGCGTCGTa > 1:695078/1‑195 (MQ=255) cgtcgAGCTGCTGTTCCAGTTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACg < 2:682815/68‑1 (MQ=255) gtcgCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGCGGATAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGTGCGGCAGGTTTTCCAGGCGACGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCATAGGCGTCGTa > 2:1066349/1‑189 (MQ=255) tcgCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCATAGGCGTCGTAGCGGCTTTTCTGGTCGCCGCGCAGCAGGCCAGAGAGGTTGAACt < 2:609325/232‑1 (MQ=255) cgcgctgcTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAg < 1:567209‑M2/71‑1 (MQ=255) cgcgctgcTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAg > 2:567208‑M2/9‑79 (MQ=255) cgcgctgcTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCATAGGCGTCGTAGCGGCTTTTCTGGTcgccg > 2:781245‑M2/9‑206 (MQ=255) ctgcTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCa < 2:819626‑M2/168‑1 (MQ=255) tgcTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCATAGGCGTCGTAGCg > 2:863068‑M2/4‑185 (MQ=255) cTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGc < 2:537123‑M2/160‑1 (MQ=255) | GGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCATAGGCGTCGTAGCGGCTTTTCTGGTCGCCGCGCAGCAGGCCAGAGAGGTTGAACT > AE015451/4399694‑4400145 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |