New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 5439097 | 48 (0.780) | 3 (0.050) | 3/326 | NT | 7.8% | coding (259/633 nt) | rluE | 23S rRNA pseudouridine 2457 synthase |
? | AE015451 | = 5439256 | 25 (0.430) | coding (100/633 nt) | rluE | 23S rRNA pseudouridine 2457 synthase |
GAATCACCAGTTCCAGCCAGCTGGTCGGCACGCTCTTGCGAAACCGTACCGGCGGGTTACGCGGCCACAGCTCGGGTTCTTCCAGGCGCCGCGCCTCAGCCGGCAAGGTCGGCCCATCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCTGAACTGGGTCAGCACGTCGAACGGTTTGTTGAACAGGATCAGGCGCGGCTCGGCGGGTGGCGCCTTGGCCTGGCGACGCGGGCCGGCGGCAGGCCGCGCCTGGGGGCGGCGC > AE015451/5438866‑5439329 | gAATCACCAGTTCCAGCCAGCTGGTCGGCACGCTCTTGCGAAACCGTACCGGCGGGTTACGCGGCCACAGCTCGGGTTCTTCCAGGCGCCGCGCCTCAGCCGGCAAGGTCGGCCCATCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCa > 2:670298/1‑234 (MQ=255) aGTTCCAGCCAGCTGGTCGGCACGCTCTTGCGAAACCGTACCGGCGGGTTACGCGGCCACAGCTCGGGTTCTTCCAGGCGCCGCGCCTCAGCCGGCAAGGTCGGCCCATCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATc > 2:510940/1‑236 (MQ=255) ccGTACCGGCGGGTTACGCGGCCACAGCTCGGGTTCTTCCAGGCGCCGCGCCTCAGCCGGCAAGGTCGGCCCATCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCa < 2:1122709/191‑1 (MQ=255) cacaGCTCGGGTTCTTCCAGGCGCCGCGCCTCAGCCGGCAAGGTCGGCCCATCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATAc > 1:393611/1‑236 (MQ=255) gggTTCTTCCAGGCGCCGCGCCTCAGCCGGCAAGGTCGGCCCATCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGa < 1:1118301/235‑1 (MQ=255) tcccAGGCGCCGCGCCTCAGCCGGCAAGGTCGGCCCATCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGtt < 1:101333/166‑1 (MQ=255) ccAGGCGCCGCGCCTCAGCCGGCAAGGTCGGCCCATCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTcagcgaca > 2:266116/1‑177 (MQ=255) aGGCGCCGCGCCTCAGCCGGCAAGGTCGGCCCATCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGa > 1:452738/1‑235 (MQ=255) ccgccgcgccTCAGCCGGCAAGGTCGGCCCATCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATAc < 1:294035/215‑1 (MQ=255) gcgccTCAGCCGGCAAGGTCGGCCCGTCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCccggccgg < 2:816337/205‑1 (MQ=255) cTCAGCCGGCAAGGTCGGCCCATCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGCTCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCCTCgg > 2:66767/1‑151 (MQ=255) gCCGGCAAGGTCGGCCCATCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTc < 1:510941/234‑1 (MQ=255) ccGGCAAGGTCGGCCCATCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTcgc < 1:450044/235‑1 (MQ=255) gTCGGCCCATCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGCTGAAGGCCTTGAGCGTCGCGCGCCCtt > 1:135906/1‑235 (MQ=255) tCGGCCCATCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTc < 1:1021177/235‑1 (MQ=255) ctgCCCATCGTTCAGCTCACCGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGc < 2:296503/159‑1 (MQ=255) gCCCATCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCTCTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCccggccgg < 1:307268/184‑1 (MQ=255) ccATCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGt < 1:623833/235‑1 (MQ=255) aTCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCtt < 1:811122/227‑1 (MQ=255) cGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCt < 1:169399/235‑1 (MQ=255) ttCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTcgc < 1:1014072/215‑1 (MQ=255) acaggCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCt < 1:410303/229‑1 (MQ=255) tCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTCCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCTGaa < 1:620414/235‑1 (MQ=255) tCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGCTCACCCTCCACCTGCACCCAGTCGGTCTTGCCCAGCTCGTGCTTCGGCTCGGCACTCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTgg > 2:80941/1‑129 (MQ=255) cAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTG < 2:1020457‑M1/106‑1 (MQ=255) aaCGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCTGAACTGGGTCa < 1:506290/236‑1 (MQ=255) cGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCccg < 1:945321/161‑1 (MQ=255) gCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGGATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCtcg > 1:164888/1‑194 (MQ=255) ccGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATg < 1:281475/180‑1 (MQ=255) cGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCt > 2:410302/1‑215 (MQ=255) cAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCCTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGc < 2:1036916/131‑1 (MQ=255) aaGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGt < 1:885984/208‑1 (MQ=255) aGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCCCCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCccg < 2:125839/149‑1 (MQ=255) gcgcTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCTGAACTGGGTCAGCACGTCGAACGGtt > 1:441378/1‑236 (MQ=255) tGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCTGAACTGGGTCAGCACGTCGAACGGTttgt > 1:434809/1‑235 (MQ=255) aCTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCAc < 1:922899/195‑1 (MQ=255) aCTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCAc > 2:922898/1‑195 (MQ=255) cTCGTCACTCGGTTCCCCCTCCACCTGCTCCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCt < 1:312197/198‑1 (MQ=255) gTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCTGAACTGGGTCAGCACGTCGAACGGTTTGTTGAACAGGa > 2:745420/1‑233 (MQ=255) cACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCTGAACTGGGTCAGCACGTCGAACGGTTTGTTGAACAGGATcag > 1:745421‑M2/1‑232 (MQ=255) tCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCTGAACTGGGTCAGCACGTCGAACGGTTTGTTGAACAGGATcaggcgc > 1:54225‑M2/1‑229 (MQ=255) tCACCCTCCACCCGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGatcctgttcaacaaaccgttcgacgtgctgacccagtt < 2:1057946‑M1/103‑39 (MQ=255) aCCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCCTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTcg < 1:743526/164‑1 (MQ=255) ccTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCACCCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATg < 2:507976/146‑1 (MQ=255) cTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCTGAACTGGGTCAGCACGTCGAACGGTTTGTTGAACAGGATcaggcgcg < 2:562785‑M2/227‑9 (MQ=255) aCCTGCACCCAGTAGGTCTGGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGGCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGt < 2:56845/136‑1 (MQ=255) aCCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCTGAACTGGGTCAGCACGTCGa < 2:330349/190‑1 (MQ=255) ccAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCCTCGGATCGGCCATCCGCGCCTGatcctgttcaacaaaccgttcgatgtgc > 1:189518‑M1/1‑48 (MQ=255) aGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCTGAACTGGGTCAg > 1:848281/1‑178 (MQ=255) tAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGatcctgttcaacaaaccgttcgacgtgctgacccagttcagcgacggtgaagggcgcgcgacgctcaaggacttcatcgacattccgggcgtatacccggccgggcggctggacagcgacagc > 2:982943‑M1/1‑44 (MQ=255) tAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCTGACCTGGGTCAGCACGTCGAACGGTTCGTTGAACAGGAt > 2:943336/1‑203 (MQ=255) ttGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCACTCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCg < 2:250565/120‑1 (MQ=255) gtgCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCTGAACTGGGTCAGCACGTCGAACGGTTTGTTGAACAGGATCAGGCGCGGCTc > 2:957093/1‑198 (MQ=255) gtgCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCTGAACTGGGTCAGCACGTCGAACGGTTTGTTGAACAGGATCAGGCGCGGCTCGGCGGGTGGCGCCTTGGCCTGGCGACGCGGGCcggcg > 1:20189/1‑235 (MQ=255) ttCGTATCCGCACTCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCATTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCg < 2:129448/105‑1 (MQ=255) taggCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCTGAACTGGGTCAGCACGTCGAACGGTTTGTTGAACAGGATCAGGCGCGGCTCGGCGGGTGGCGCCTTGGCCTGGCGACGCGGGCcgg < 2:420618/221‑1 (MQ=255) ccGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCt < 2:73375/129‑1 (MQ=255) cgcgCCTGatcctgttcaacaaaccgttcgacgtgctgacccagttcagcgacggtgaagggcgcgcgacgctcaaggacttcatcgacattccgggcgtatacccggccgggcggctggaccgcgacagcgaaggcttgctgttgctgaccaacgatggcgggttgcaggcgcggattgccgatccgaagcacaagctggccaagacctactgggtgcaggtggag < 2:562785‑M1/227‑220 (MQ=255) gcgcCTGatcctgttcaacaaaccgttcgacgtgctgacccagttcagcgacggtgaagggcgcgcgacgctcaaggacttcatcgacattccgggcgtatacccggccgggcggctggaccgcgacagcgaaggcttgctgttgctgaccaacgatggcgggttgcaggcgcggattgccgatccgaagcacaagctggccaagacctactgggtgcaggtggagggtgaaccga > 1:54225‑M1/1‑7 (MQ=255) gcgcCTGatcctgttcaacaaaccgttcgacgtgctgacccagttcagcgacggtgaagggcgcgcgacgctcaaggacttcatcgacattccgggcgtatacccgg < 2:1036547‑M1/107‑101 (MQ=255) cTGatcctgttcaacaaaccgttcgacgtgctgacccagttcagcgacggtgaagggcgcgcgacgctcaaggacttcatcgacattccgggcgtatacccggccgggcggctggaccgcgacagcgaaggcttgctgttgctgaccaacgatggcgggttgcaggcgcggattgccgatccgaagcacaagctggccaagacctactgggtgcaggtggagggtgaaccgagtg > 1:745421‑M1/1‑3 (MQ=255) | GAATCACCAGTTCCAGCCAGCTGGTCGGCACGCTCTTGCGAAACCGTACCGGCGGGTTACGCGGCCACAGCTCGGGTTCTTCCAGGCGCCGCGCCTCAGCCGGCAAGGTCGGCCCATCGTTCAGCTCAACGCCATCACGCAAGCGCTGCAACTGCTCGTCACTCGGTTCACCCTCCACCTGCACCCAGTAGGTCTTGGCCAGCTTGTGCTTCGGATCGGCAATCCGCGCCTGCAACCCGCCATCGTTGGTCAGCAACAGCAAGCCTTCGCTGTCGCGGTCCAGCCGCCCGGCCGGGTATACGCCCGGAATGTCGATGAAGTCCTTGAGCGTCGCGCGCCCTTCACCGTCGCTGAACTGGGTCAGCACGTCGAACGGTTTGTTGAACAGGATCAGGCGCGGCTCGGCGGGTGGCGCCTTGGCCTGGCGACGCGGGCCGGCGGCAGGCCGCGCCTGGGGGCGGCGC > AE015451/5438866‑5439329 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |