New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | AE015451 | = 6002217 | 63 (1.020) | 8 (0.130) | 7/338 | NT | 11.1% | coding (84/1299 nt) | amaA | L‑pipecolate oxidase |
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CCAAGCACCTTGTTCAGGCGGCTACCCTGCTTCTGGCCAAGGGTGGCCTCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTC > AE015451/6001984‑6002451 | ccAAGCACCTTGTTCAGGCGGCTACCCTGCTTCTGGCCAAGGGTGGCCTCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCG < 2:572363‑M1/234‑1 (MQ=255) cTTGTTCAGGCGGCTACCCTGCTTCTGGCCAAGGGTGGCCTCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGcc < 1:454782/235‑1 (MQ=255) gTTCAGGCGGCTACCCTGCTTCTGGCCAAGGGTGGCCTCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTgg > 1:848525/1‑235 (MQ=255) gcTGCCCTGCTTCTGGCCAAGGGTGGCCTCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGAc < 1:170323/234‑1 (MQ=255) cTACCCTGCTTCTGGCCAAGGGTGGCCTCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCG < 2:931509‑M1/213‑1 (MQ=255) ccTGCTTCTGGCCAAGGGTGGCCTCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGAcggtcggt > 1:561200/1‑236 (MQ=255) ccTGCTTCTGGCCAAGGGTGGCCTCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGAcggtc < 2:1112539/233‑1 (MQ=255) ccTGCTTCTGGCCAAGGGTGGCCTCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGAcggtc < 2:728551/233‑1 (MQ=255) tGCTTCTGGCCAAGGGTGGCCTCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGAcgg < 2:658926/229‑1 (MQ=255) ttCTGGCCAAGGGTGGCCTCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCG < 1:328838‑M1/204‑1 (MQ=255) ggCCAAGGGTGGCCTCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGcggtgagcacaaggccgatgtc < 1:757487‑M2/235‑23 (MQ=255) gggTGGCCTCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAg < 1:341114/199‑1 (MQ=255) 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1:975656/235‑1 (MQ=255) tcgtcgGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTCTGCTGACGTGTTCCTACAAGCAttgttg < 1:599074/236‑1 (MQ=255) ggCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGcggtgagcacaaggccgatgtctgtgtgatcgg > 2:713282‑M2/1‑186 (MQ=255) gATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCG > 2:1094702‑M1/1‑169 (MQ=255) gATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCG < 1:1094703‑M1/169‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGAc < 2:872149/213‑1 (MQ=255) aTACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGcccaggccctggcaggtgagcacaaggccgatgtctgtctgatcggcggcggcattaccggcctgtcggcggccatccaccg > 2:812920‑M1/1‑42 (MQ=255) cgccgccgATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTgggg < 2:332850/140‑1 (MQ=255) cgccgccgATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 2:328127/1‑177 (MQ=255) cgccgccgATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGCGCGGCCCTTTCGCGGGt > 1:729599/1‑164 (MQ=255) cgccgATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGAc < 2:492409/196‑1 (MQ=255) cgccgATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGGTCTTGTTGGTGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGGCGCTTGGACGAACCCt > 2:394214/1‑203 (MQ=255) gccgATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTc > 2:872859/1‑187 (MQ=255) ccgATCCCACAGACAGCGGCCTTGTGCTCCCCGTCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGTCCGCAGGGCGGCCCtt < 2:375192/151‑1 (MQ=255) ccgATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGcccaggccctggccggtgagcacaaggccgatgtctgtgtgatcggcggcggtattaccggcctgtcggcggccatccacctgctcgaacagggcaagtcggtgatcgtgctggaggcctggaagatcggccacggtggctccgggcgcaacgtcggcctggtcaacgccggcacgtggatccgccccgacgacgt > 2:757486‑M1/1‑33 (MQ=255) ccgATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGcccaggccctggccggtgagcacaaggccgatgtctgtgtgatcggcggcggtattaccggcctgtcggcggccatccacctgctcgaacagggcaagtcggtgatcgtgctggaggcctggaagatcggccacggtggctccgggcgcaacgtcggcctggtcaacgccggcacgtggatccgcc > 2:713282‑M1/1‑33 (MQ=255) gATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGGTCGGACATGGCCGGCTCCAg > 2:54639/1‑114 (MQ=255) tCACGCAGACGTCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGTTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTaaa < 2:275951/158‑1 (MQ=255) aGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAgg < 2:561199/196‑1 (MQ=255) gACATCGGCCTTGTGCTCACCGcccaggccctggccggtgagcacaaggccgatgtctgtgtgatcggcggcggtattaccggcctgtcggcggccatccacctgctcgaacagggcaagtcggtgatcgtgctggaggcctggaagatcggccacggtggctccgggcgcaacgtcggcctggtcaacgccggcacgtggatccgccccgacgacgtcgaggccacccttggcc < 1:757487‑M1/235‑214 (MQ=255) cATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAAcc < 2:472598/151‑1 (MQ=255) aTCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCt < 2:134242/136‑1 (MQ=255) 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ttGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCgg > 2:846443/1‑161 (MQ=255) gCTCACCGGCCAGGGCGTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCgggg < 1:929593/205‑1 (MQ=255) gCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTgg < 1:1089143/167‑1 (MQ=255) cGcccaggccctggccggtgagcacaaggccgatgtctgtgtgatcggcggcggtattaccggcctgtcggcggccatccacctgctcgaacagggcaagtcggtgatcgtgctggaggcctggaagatcggccacggtggctccgggcgcaacgtcggcctggtcaacgccggcacgtggat > 1:401041‑M1/1‑2 (MQ=255) ggCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCAAGCAGCATCCAtcc > 1:74541/1‑226 (MQ=255) ggCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCCTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCCTCAATACATCAGTc > 1:843128/1‑235 (MQ=255) gcccaggccctggccggtgagcacaaggccgatgtctgtgtgatcggcggcggtattaccggcctgtcggcggccatccacctgctcgaacagggcaagtcggtgatcgtgctggaggcctggaagatc > 1:388405‑M1/1‑1 (MQ=255) gcccaggccctggccggtgagcacaaggccgacgtctgtgtgatcggcggcggtattaccggcctgtcggcggccatccacctgctcgaacagggcaagtcggtgatcgtgctggaggcctggaagatcggccacggtggctccgggcgcaacgtcgtcctggtcaacgccggcacgtgga > 2:750141‑M1/1‑1 (MQ=255) | CCAAGCACCTTGTTCAGGCGGCTACCCTGCTTCTGGCCAAGGGTGGCCTCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTC > AE015451/6001984‑6002451 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |