| New junction evidence | |||||||||||
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ggCCAAGGGTGGCCTCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGcggtgagcacaaggccgatgtc < 1:757487‑M2/235‑23 (MQ=255) tCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGcggtgagcacaagg < 1:913687‑M2/213‑15 (MQ=255) tCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGcggtgagcacaagg > 2:913686‑M2/1‑199 (MQ=255) tCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGACAGGGCCTGggcggc > 2:929592/1‑203 (MQ=255) 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2:394214/1‑203 (MQ=255) gccgATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTc > 2:872859/1‑187 (MQ=255) ccgATCCCACAGACAGCGGCCTTGTGCTCCCCGTCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGTCCGCAGGGCGGCCCtt < 2:375192/151‑1 (MQ=255) gATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGGTCGGACATGGCCGGCTCCAg > 2:54639/1‑114 (MQ=255) tCACGCAGACGTCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGTTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTaaa < 2:275951/158‑1 (MQ=255) aGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAgg < 2:561199/196‑1 (MQ=255) cATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAAcc < 2:472598/151‑1 (MQ=255) aTCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCt < 2:134242/136‑1 (MQ=255) ggCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGcc > 1:98453/1‑228 (MQ=255) ggCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTACAGGGGTCGGTGTCGCGTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACACGCGGACCGGGGGCCAGGCCCCCGGc > 2:305995/1‑227 (MQ=255) ttGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCgg > 2:846443/1‑161 (MQ=255) gCTCACCGGCCAGGGCGTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCgggg < 1:929593/205‑1 (MQ=255) gCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTgg < 1:1089143/167‑1 (MQ=255) ggCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCAAGCAGCATCCAtcc > 1:74541/1‑226 (MQ=255) ggCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCCTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCCTCAATACATCAGTc > 1:843128/1‑235 (MQ=255) ccAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCAt > 1:979242/1‑220 (MQ=255) gggCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCgg > 1:737407/1‑191 (MQ=255) gggCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCACTa > 1:296940/1‑222 (MQ=255) ggCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCGGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTGTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTa < 2:259172/166‑1 (MQ=255) ccTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGt > 1:910238/1‑173 (MQ=255) ccTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGt < 2:910237/173‑1 (MQ=255) ggcggcGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATAc < 1:681843/234‑1 (MQ=255) gcggcgACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTgg < 2:725012/147‑1 (MQ=255) gcggcgACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGcccc < 1:1133206/195‑1 (MQ=255) | GCTACCCTGCTTCTGGCCAAGGGTGGCCTCGACGTCGTCGGGGCGGATCCACGTGCCGGCGTTGACCAGGCCGACGTTGCGCCCGGAGCCACCGTGGCCGATCTTCCAGGCCTCCAGCACGATCACCGACTTGCCCTGTTCGAGCAGGTGGATGGCCGCCGACAGGCCGGTAATACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGGACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATAC > AE015451/6002004‑6002462 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |