New junction evidence | |||||||||||
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? | AE015451 | = 728945 | 64 (1.080) | coding (434/963 nt) | rluD | 23S rRNA pseudouridine(1911,1915,1917) synthase |
AGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCACGGCGGCATGCGCCAGCGCATGGCTGTAACCGACGGCGGCAAGCCGGCGGTCAGTCACTACCGCGTACTCAAGCGCTTCCGCTCGCACACCCA > AE015451/728711‑729176 | aGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATg > 1:1017530‑M2/1‑235 (MQ=255) aGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATg > 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tGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATg > 2:719267‑M2/1‑209 (MQ=255) gATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGa > 1:1049426/1‑236 (MQ=255) agatCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGgcg < 2:588712/219‑1 (MQ=255) atCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCg < 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gcgcCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCAcggcg < 1:220912/189‑1 (MQ=255) cGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCACGGCGGCATGCGCCAGCGCATGGCTGTAACCGACGGCGGCAAGCcgg < 1:833228/227‑1 (MQ=255) tCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCa < 2:211909/150‑1 (MQ=255) gTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATGGTGGTGGCCAAGCCCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCACGGCGGCATGCGCCAGCGCATGGCTGTAACCGACGGCGGCAAGCCGGCGGTCAGTCACTAcc < 1:985713/235‑1 (MQ=255) aCCGCCTGGACAAGGTCACCACCGGGCTGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTGGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCAGCTACGACTGCATCGGGATTGGCg > 2:926123/1‑126 (MQ=255) aCCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGCTTGGCGTGGTTACTGCCGGTGGCAAGATCGAcg > 1:665410/1‑153 (MQ=255) gCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCACGGCGGCATGCGCCAGCGCATGGCTGTAACCGACGGCGGCAAGCCGGCGGTCAGTCACTACCGCGTACTc < 1:881776/236‑1 (MQ=255) ggACAAGGACACCACCGGCCTGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCACGGCGGCATGCGCCAGCGCATGGCTGTAACCGACggcggc > 1:205487/1‑202 (MQ=255) cAAGGACACCACCGGCCTGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCACGGCGGCATGCGCCAGCGCATGGCTGTAACCGACGGCGGCAAGCCGGCGGTCAGTCACTACCGCGTACTCAAgcgc > 1:948365/1‑235 (MQ=255) aaaGGACACCACCGGCCTGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCACGGCGGCATGCGCCAGCGCATGGCTGTAACCGACGGCGGCAAGCCGGCGGTCAGTCACTACCGCGTACTCAAGCGCt < 2:677109/235‑1 (MQ=255) caccacCGGCCTGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGCTCGGCccgc > 2:825754/1‑140 (MQ=255) accaccGGCCTGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGCTGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCACGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCAcggc > 2:88407/1‑156 (MQ=255) ccccGGCCTGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCACGGCGGCATg < 1:117681/158‑1 (MQ=255) cGGCCTGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGa > 2:40066/1‑87 (MQ=255) tGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCACGGCGGCATGCGCCAGCGCATGGCTGTAACCGACGGCGGCAAGCCGGCGGTCAGTCACTACCGCGTACTCAAGCGCTTCCGCTCGcccaccca > 1:696851/1‑235 (MQ=255) tGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGAGGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCACCGTGATTGCCGGGGTGACTGCCGGTg > 2:1093485/1‑114 (MQ=255) | AGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATGGTGGTGGCCAAGACCCTGCAGGCGCAGACCAAGCTGGTCGAGCAGATGCAGGCCCGCAAGGTCAGCCGCATCTACGAGTGCATCGTGATTGGCGTGGTGACTGCCGGTGGCAAGATCGACGCGCCCATCGGCCGCCACGGCGGCATGCGCCAGCGCATGGCTGTAACCGACGGCGGCAAGCCGGCGGTCAGTCACTACCGCGTACTCAAGCGCTTCCGCTCGCACACCCA > AE015451/728711‑729176 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |