| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 1094944 = | 60 (0.970) | 6 (0.100) | 5/326 | NT | 9.2% | coding (1117/1494 nt) | rpoN | RNA polymerase sigma‑54 factor |
| ? | AE015451 | 1095025 = | 62 (1.060) | coding (1036/1494 nt) | rpoN | RNA polymerase sigma‑54 factor | |||||
AGAAAAAGTATTTCAGTTCGTAGATGCCACGCGGGGTGTGCATGTATTTCTGCGTGGTAACCCGCGAAATGGTCGATTCGTGCATGCCTACGGCTTCGGCAATGTCATGCAGTACCAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAGTTCTACCAGCCAACGGTCGCTGTCCTTGCGCACGATGACGTCGGGCACCACGTACTCGGGCTCGCTGGACTCGATCTGCGAACCAGGGCGCGGGTTAAGGCTTTGCACCAGTTCGATGAC > AE015451/1094791‑1095256 | agaAAAAGTATTTCAGTTCGTAGATGCCACGCGGGGTGTGCATGTATTTCTGCGTGGTAACCCGCGAAATGGTCGATTCGTGCATGCCTACGGCTTCGGCAATGTCATGCAGTACCAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCt < 1:332818/236‑1 (MQ=255) ttCTGCGTGGTAACCCGCGAAATGGTCGATTCGTGCATGCCTACGGCTTCGGCAATGTCATGCAGTACCAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCg < 2:654354/234‑1 (MQ=255) gCGTGGTAACCCGCGAAATGGTCGATTCGTGCATGCCTACGGCTTCGGCAATGTCATGCAGTACCAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACg > 1:463012/1‑235 (MQ=255) ggTAACCCGCGAAATGGTCGATTCGTGCATGCCTACGGCTTCGGCAATGTCATGCAGTACCAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGgc > 1:656320/1‑216 (MQ=255) ggTAACCCGCGAAATGGTCGATTCGTGCATGCCTACGGCTTCGGCAATGTCATGCAGTACCAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCGTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGGGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCa > 1:227146/1‑236 (MQ=255) ccGCGAAATGGTCGATTCGTGCATGCCTACGGCTTCGGCAATGTCATGCAGTACCAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACg < 1:235432/232‑1 (MQ=255) gcgAAATGGTCGATTCGTGCATGCCTACGGCTTCGGCAATGTCATGCAGTACCAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGgcgc < 1:532224/227‑1 (MQ=255) ctgcgcgtcaacccacaatacgccggcttcgtgcgccgtgccgacaccagcgccgacaacaccttcatgcgcaaccagctgcaggaagcgcgctggttcatcaagagcctgcaaagccgtaacgaaaccctgatgaaggttgccacgcagatcgtcgagcaccagcgcgCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCgg < 2:956997‑M2/36‑1 (MQ=255) gATTCGTGCATGCCTACGGCTTCGGCAATGTCATGCAGTACCAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGCGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCa > 2:228558/1‑169 (MQ=255) tGCATGCCTACGGCTTCGGCAATGTCATGCAGTACCAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGAc < 1:125088/236‑1 (MQ=255) acgccggcttcgtgcgccgtgccgacaccagcgccgacaacaccttcatgcgcaaccagctgcaggaagcgcgctggttcatcaagagcctgcaaagccgtaacgaaaccctgatgaaggttgccacgcagatcgtcgagcaccagcgcgCTTCCTGCAGCTg < 2:753458‑M2/13‑1 (MQ=255) cAATGTCATGCAGTACCAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCt < 1:461179/236‑1 (MQ=255) aaTGTCATGCAGTACCAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGgc < 1:117004/171‑1 (MQ=255) aaTGTCATGCAGTACCAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGgc > 2:117004/1‑171 (MQ=255) tGCAGTACCAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGcc < 2:149897/191‑1 (MQ=255) aGTACCAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCt < 1:885685/229‑1 (MQ=255) aGTACCAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAg > 1:417942/1‑236 (MQ=255) cAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTgc > 1:567835/1‑137 (MQ=255) cAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGGTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAGTTCTa > 1:198842/1‑236 (MQ=255) ccgacaacaccttcatgcgcaaccagctgcaggaagC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAg < 2:956997‑M1/169‑1 (MQ=255) aCGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCACCCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTgg > 2:4133/1‑131 (MQ=255) aCGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAGTTCTAc > 1:968857/1‑235 (MQ=255) gCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGGTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGGTGACGCGCGGGCGTGGGATGGCt > 1:355427/1‑215 (MQ=255) tCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCt > 2:959616/1‑212 (MQ=255) aTCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGGC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCGGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCt < 1:167729/210‑1 (MQ=255) aTCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCt < 2:713267/210‑1 (MQ=255) aTCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAGGTCTACCCGCCAACg > 1:529582/1‑236 (MQ=255) aTCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGAGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTg > 1:220034/1‑202 (MQ=255) cGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAGTTCTACCAGCCAACg > 1:1027199/1‑234 (MQ=255) 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atcaGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAGTTCTACCAGCCAACGGTCGCTGTCCTTGCGCACGATGACGTCggg > 1:1132029/1‑203 (MQ=255) atcaGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGGTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCa > 2:502281/1‑103 (MQ=255) ccgggTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGtt < 2:848956/151‑1 (MQ=255) aGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAGTTCTACCAGCCAACGGTCGCTGTCCTTGCGCACGATGACGTCGGGCACCACGTACTCGGGCTc > 2:882713/1‑218 (MQ=255) gggTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAGTTCTACCAGCCAACGGTCGCTGTCCtt < 2:618505/181‑1 (MQ=255) ggTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGAc < 1:753459/123‑1 (MQ=255) tttCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCGGCGCGCGTCCGGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGcc < 2:326932/103‑1 (MQ=255) cGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCGGGCGTGGGGTGGCGTCCTGGt > 2:151525/1‑144 (MQ=255) cGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGGGGCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTa > 2:348897/1‑106 (MQ=255) ttACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAGTTCTACCAGCCAACGGTCGCTGTCCTTGCGCACGATGACGTCGGGCACCACGTACTCGGGCTCGCTGGACTCGATCTGCGAACCAGGgcg > 1:117036/1‑236 (MQ=255) ttACGGCTTTGCAGGCTCCTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCCGGTTGCGAACGAAGGGGTTGTc > 2:600600/1‑68 (MQ=255) 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cAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAGTTCTACCAGCCAACGGTCGCTGTCCTTGCGCACGATGACGTCGGGCACCACGTACTCGGGCTCGCTGGACTCGATCTGCGAACCAGGGCGCGGGTTaa > 2:612280/1‑233 (MQ=255) aGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAGTTCTACCAGCCAACGGTCGCTGTCCTTGCGCACGATGACGTCGGGCACCACGTACTCGGGCTCGCTGGACTCGATCTGCGAACCAGGGCGCGGGt < 1:297207/229‑1 (MQ=255) ctTGATGACCCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGTATGGCTTCCTGGTTCAGTTCTACCAGCCAACGGTCGCTGTCCTTGCGCACGATGACGTCGGGCACCACGTACTCGGGCTCGCTGGAc < 1:96408/199‑1 (MQ=255) gcgcgCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAGTTCTACCAGCCAACGGTCGCTGTCCTTGCGCACGATGACGTCGGGCACCACGTACTCGGGCTCGCTGGACTCGATCTGCGAACCAGGGCGCGGGTTAAGGCTTTGCACCAGTTCGATGa > 1:582084‑M2/6‑236 (MQ=255) gcgCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTg < 2:1114731‑M2/93‑1 (MQ=255) gcgCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTg > 1:1114732‑M2/4‑96 (MQ=255) gcgCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAGTTCTACCAGCCAACGGTCGCTGTCCTTGCGCACGATGACGTCGGGCACCACGGACTCGGGCTCGCTGGACTCGATCTGCGAACCAGGGCGCGGGTTAAGGCGTTGCACCAGTTCGatgcc > 1:185540‑M2/4‑233 (MQ=255) gCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAGTTCTACCa > 1:447973‑M2/2‑121 (MQ=255) gCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAGTTCTACCa < 2:447972‑M2/120‑1 (MQ=255) gCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAGTTCTACCAGCCAACGGTCGCTGTCCTTGCGCACGATGACGTCGGGCACCACGTACTCGGGCTCGCTg > 2:570316‑M2/2‑180 (MQ=255) gCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAGTTCTACCAGCCAACGGTCGCTGTCCTTGCGCACGATGACGTCGGGCACCACGTACTCGGGCTCGCTGGACTCGATCTGCGAACCAGGGCGCGGGt > 2:296724‑M2/2‑208 (MQ=255) | AGAAAAAGTATTTCAGTTCGTAGATGCCACGCGGGGTGTGCATGTATTTCTGCGTGGTAACCCGCGAAATGGTCGATTCGTGCATGCCTACGGCTTCGGCAATGTCATGCAGTACCAACGGCTTCATCGCTTCGTCGCCGTGGTCGAGGAAGCC‑GCGCTGGTGCTCGACGATCTGCGTGGCAACCTTCATCAGGGTTTCGTTACGGCTTTGCAGGCTCTTGATGAACCAGCGCGCTTCCTGCAGCTGGTTGCGCATGAAGGTGTTGTCGGCGCTGGTGTCGGCACGGCGCACGAAGCCGGCGTATTGTGGGTTGACGCGCAGGCGTGGGATGGCTTCCTGGTTCAGTTCTACCAGCCAACGGTCGCTGTCCTTGCGCACGATGACGTCGGGCACCACGTACTCGGGCTCGCTGGACTCGATCTGCGAACCAGGGCGCGGGTTAAGGCTTTGCACCAGTTCGATGAC > AE015451/1094791‑1095256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |