New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 3194834 = | 36 (0.580) | 3 (0.050) | 3/330 | NT | 7.9% | coding (36/1332 nt) | PP_2802 | Amino acid permease family protein |
? | AE015451 | 3194851 = | 35 (0.590) | coding (19/1332 nt) | PP_2802 | Amino acid permease family protein |
GCGGGTGTAGGTGTAGGCCGAACCTGCCACCGGGAACACCCTGACCAGTCGGCCATAGCTCAAGGCCGTGAACACAACGCCGGTGGCTGCGACCAGGTAGGCCATGGCCGTGGTGTTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTGGCGTCCGAGAAGTTCTGCTTGGACTTCTCGGCAATGGTCGGGAAGTCTTCCTCGCGCACACCCTTGACCTCGGCGAAGCGGGGGATGCCCAGGTCCTTGCTCATCTGGAACAGATGGCCGACGGCGGCCTCG > AE015451/3194621‑3195086 | gCGGGTGTAGGTGTAGGCCGAACCTGCCACCGGGAACACCCTGACCAGTCGGCCATAGCTCAAGGCCGTGAACACAACGCCGGTGGCTGCGACCAGGTAGGCCATGGCCGTGGTGTTGCCGCTGGCCTGGGGGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCgg > 1:448753/1‑233 (MQ=255) taggCCGAACCTGCCACCGGGAACACCCTGACCAGTCGGCCATAGCTCAAGGCCGTGAACACAACGCCGGTGGCTGCGACCAGGTAGGCCATGGCCGTGGTGTTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCa > 1:664268/1‑235 (MQ=255) ccTGACCAGTCGGCCATAGCTCAAGGCCGTGAACACAACGCCGGTGGCTGCGACCAGGTAGGCCATGGCCGTGGTGTTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTAcgcg < 1:783552/229‑1 (MQ=255) aGTCGGCCATAGCTCAAGGCCGTGAACACAACGCCGGTGGCTGCGACCAGGTAGGCCATGGCCGTGGTGTTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACGCATGACGGAGCCCTCTTACGcgacg > 1:60552/1‑225 (MQ=255) gTCGGCCATAGCTCAAGGCCGTGAACACAACGCCGGTGGCTGCGACCAGGTAGGCCATGGCCGTGGTGTTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGtt < 1:456094/191‑1 (MQ=255) ggCCATAGCTCAAGGCCGTGAACACAACGCCGGTGGCTGCGACCAGGTAGGCCATGGGCGTGGTGTTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGGCAGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGcgac > 2:608373/1‑220 (MQ=255) gCCATAGCTCAAGGCCGTGAACACAACGCCGGTGGCTGCGACCAGGTAGGCCATGGCCGTGGTGTTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCggtg > 1:663317/1‑235 (MQ=255) gCCGTGAACACAACGCCGGTGGCTGCGACCAGGTAGGCCATGGCCGTGGTGTTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTg < 1:618123/236‑1 (MQ=255) acacAACGCCGGTGGCTGCGACCAGGTAGGCCATGGCCGTGGTGTTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTtgactgac > 2:800974/1‑174 (MQ=255) acacAACGCCGGTGGCTGCGACCAGGTAGGCCATGGCCGTGGTGTTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCGCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGGCGTGGTAGGc > 1:618366/1‑235 (MQ=255) ccGGTGGCTGAGACCAGGTGGGCCATGGCCGTGGTGTTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGcgacg < 1:214439/192‑1 (MQ=255) gccAGGTAGGCCATGGCCGTGGTGTTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATg < 2:27930/158‑1 (MQ=255) ccAGGTAGGCCATGGCCGTGGTGTTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGcgac > 1:616241/1‑178 (MQ=255) ggCCGTGGTGTTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAACGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACGGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGGGGTGGTGATGATGTCGTGGt > 1:853488/1‑197 (MQ=255) ccGTGGTGTTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTGGCGTCCgag > 1:931323/1‑236 (MQ=255) gtggtgTTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTg > 1:918094/1‑222 (MQ=255) tgtTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTg > 2:467526/1‑221 (MQ=255) gtTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACg > 1:330014/1‑199 (MQ=255) tgccacggcgatgtccgtagaggcctaccacgacatcatcaccaccgcttaccacttcgtcgcgtaagagggctccgtcatgagtcagtcaacctccggcgcctcgttgaggcgcCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGt < 2:541965‑M2/45‑1 (MQ=255) gCCGCTGGCCGGGGTGAGCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTg < 2:143977/183‑1 (MQ=255) gCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCt > 2:202400/1‑203 (MQ=255) gCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCt < 1:202400/203‑1 (MQ=255) tGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTg < 2:765600/178‑1 (MQ=255) cgcACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTAc < 2:110262/130‑1 (MQ=255) aggcctaccacgacatcatcaccaccgcttaccacttcgtcgcgtaagagggctccgtcatgagtcagtcaacctccggcgcctcgttgaggcgcCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTAc < 1:1063137‑M2/35‑1 (MQ=255) aggcctaccacgacatcatcaccaccgcttaccacttcgtcgcgtaagagggctccgtcatgagtcagtcaacctccggcgcctcgttgaggcgcCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTAc > 2:1063136‑M2/96‑130 (MQ=255) gCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCctct > 2:1030175/1‑163 (MQ=255) gCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATc > 1:419441/1‑172 (MQ=255) cGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTGGCGTCCGAGAAGTTCTGCTTGGACTTCTCGGCAATGGTCGGGAAGTCTTCCTcgc < 2:931322/234‑1 (MQ=255) aTTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGCACATCGCCTTGGCAtt < 2:868727/173‑1 (MQ=255) tAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTGGCGTCCGAGAAGTTCTGCTTGGACTTCTCGGCAATGGTCGGGAAGTCTTCCTcgc < 1:392229/230‑1 (MQ=255) acttcgtcgcgtaagagggctccgtcatgagtcagtcaacctccgGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCGTGGCa < 2:541965‑M1/115‑1 (MQ=255) aGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTGGCGTCCGAGAAGTTCTGCTTGGACTTCTCGGCAATGGTCGGGAAGTCTTCCTCGCGCACACCCTTGACCTc > 1:812613/1‑236 (MQ=255) gAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTGGCGTCCGAGAAGTTCTGCTTGGACTTCTCGGCAATGGTCGGGAAGTCTTCCTcgc < 2:755643/218‑1 (MQ=255) gtaagagggctccgtcatgagtcagtcaacctccgGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCct < 1:1063137‑M1/95‑1 (MQ=255) gtaagagggctccgtcatgagtcagtcaacctccgGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCct > 2:1063136‑M1/36‑130 (MQ=255) ccGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCTGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCACTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTGGCGTCCGAGAAGTTCTGCTTGGACTTCTCGGCAATGGTCGGGAAGTCTTCCTCTCGCACACCCTTGACCTCGGCGAAGCgg < 2:699470/234‑1 (MQ=255) gAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTa > 1:1009027/1‑120 (MQ=255) gAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTGGCGTCCGAGAAGTTCTGCTTGGACTTCTCGGCAATGGTCGGGAAGTCTTCCTCGCGCACACCCTTGACCTCGGCgg > 1:739013/1‑226 (MQ=255) aaaaCGGGCCCGGGCTGCGCCTCCACGAGGCGCCGGAGGTTGACGGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTGGCGTCCGAGAAGTTCTGCTTGGACTTCTCGGCAATGGTCGGGAAGTCTTCCTcgc < 2:152041/192‑1 (MQ=255) gCCCAGGCTGCTCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCTTTGCTGGCGTCCgaga < 2:551568/140‑1 (MQ=255) tGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGGAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTGGCGTCCGAGAAGTTc > 2:136790/1‑137 (MQ=255) CTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTGGCGTCCGAGAAGTTCTGCTTGGACTTCTCGGCAATGGTCGGGAAGTCTTCCTCGCGCACACCCTTGACCTCGGCGAAGCGGGGGGTGCCCAGGTCCTTGCTCATCTGGAACAGATGGcc < 1:945997‑M1/236‑1 (MQ=255) CTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTGGCGTCCGAGAAGTTCTGCTTGGACTTCTCGGCAATGGTCGGGAAGTCTTCCTCGCGCACACCCTTGACCTCGGCGAAGCGGGGGATGCCCAGGTCCTTGCTCATCTGGAACAGATgg < 2:885866‑M1/234‑1 (MQ=255) CTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTGGCGTCCGAGAAGTTCTGCTTGGACTTCTCGGCAATGGTCGGGAAGTCTTCCTCGCGCACACCCTTGACCTCGGCGAAGCGGGGGATGCCCAGGTCCTTGCTCATCTGGAACAGATGGcc < 1:885845‑M1/236‑1 (MQ=255) TCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTGGCGTCCGAGAAGTTCTGCTTGGACTTCTCGGCAATGGTCGGGAAGTCTTCCTCGCGCACACCCTTGACCTCGGCGAAGCgg > 2:872994‑M1/1‑197 (MQ=255) CAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTGGCGTCCgaga > 2:880073‑M1/1‑125 (MQ=255) cGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTGGCGTCCGAGAAGTTCTGCTTGGACTTCTCGGCAATGGTCGGGAAGTCTTCCTCGCGCACACCCTTGACCTCGGCGAAGCGGGGGATGCCCAGGTCCt < 1:344227/209‑1 (MQ=255) cGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTGGCGTCCGAGAAGTTCTGCTTGGACTTCTCGGCAATGGTCGGGAAGTCTTCCTCGCGCACACCCTTGACCTCGGCGAAGCGGGGGATGCCCAGGTCCTTGCTCATCTGGAACAGATGGCCGACGGCGGCCTcg > 1:980523/1‑236 (MQ=255) | GCGGGTGTAGGTGTAGGCCGAACCTGCCACCGGGAACACCCTGACCAGTCGGCCATAGCTCAAGGCCGTGAACACAACGCCGGTGGCTGCGACCAGGTAGGCCATGGCCGTGGTGTTGCCGCTGGCCTGGGTGATCACGCCGTAGGTGCCGAAGACGATTAGCGGGGCCAGGAAGGCCAGGCCGAACAGCAGCACGGAAAACGGGCCCAGGCTGCGCCTCAACGAGGCGCCGGAGGTTGACTGACTCATGACGGAGCCCTCTTACGCGACGAAGTGGTAAGCGGTGGTGATGATGTCGTGGTAGGCCTCTACGGACATCGCCTTGGCATTGCTGGCGTCCGAGAAGTTCTGCTTGGACTTCTCGGCAATGGTCGGGAAGTCTTCCTCGCGCACACCCTTGACCTCGGCGAAGCGGGGGATGCCCAGGTCCTTGCTCATCTGGAACAGATGGCCGACGGCGGCCTCG > AE015451/3194621‑3195086 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |