New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 4585388 | 44 (0.710) | 4 (0.070) | 4/328 | NT | 8.5% | coding (196/1986 nt) | glgE | Alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
? | AE015451 | = 4585403 | 44 (0.750) | coding (181/1986 nt) | glgE | Alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
AGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATGCGTGGCGCCAACAGCGCCTGGGCCAGGCTAATGGCCTGGTCCGGGTGATCGTTCGCCATGGGCACGCTTTCAAAGGGCTCGTTTCGTGACATCGACCTTGCTCCC > AE015451/4585181‑4585629 | aGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACcgccaggcccaca > 1:737485‑M2/1‑223 (MQ=255) gCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑c < 1:580145/236‑1 (MQ=255) cttcttCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCg < 1:872071/236‑1 (MQ=255) tccagttTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTcagcaccaag < 1:1047696/236‑10 (MQ=255) cagttTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑c < 1:632733/221‑1 (MQ=255) cGCCGGCGGGGTACTTCTTCTCCGGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑c < 2:747665/207‑1 (MQ=255) gATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCGGTAGGCCTTgg > 1:348189/1‑201 (MQ=255) tCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGc < 2:969893/202‑1 (MQ=255) ggCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGCCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGCTGAGCATCACCGCCAGGCggcc > 2:165470/1‑170 (MQ=255) aTAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGGCCCGTCGCTGTAGGCCTTGGTg < 2:671048/194‑1 (MQ=255) gCAAACGGTTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCt < 2:1035494/209‑1 (MQ=255) aCGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGt > 1:76494/1‑165 (MQ=255) gggTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGa < 1:773562/235‑1 (MQ=255) ggTCGATCCAGGCCTCGAGACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGa < 2:480689/234‑1 (MQ=255) aTCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCGGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAgg < 1:583172/166‑1 (MQ=255) tCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCg > 1:168105/1‑186 (MQ=255) tCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGgcggcgga > 1:119117/1‑204 (MQ=255) cccGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACgg < 1:154071/161‑1 (MQ=255) cGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGgcggcg > 2:1001952/1‑192 (MQ=255) cGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCtt > 2:1084544/1‑144 (MQ=255) cGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGa > 2:461471/1‑203 (MQ=255) ccAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGGTGAGCATCCCCGCCAGGCGGGCGTGG‑CCGTCGCt > 2:228745/1‑130 (MQ=255) cGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACcgccaggcccacagccggcgctggcattgcgtgccgat < 2:826309‑M2/138‑39 (MQ=255) cGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTc > 1:908742/1‑121 (MQ=255) cGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTc < 2:908741/121‑1 (MQ=255) ggTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATGCGTGgcgc > 1:663739/1‑228 (MQ=255) gggTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACcgccaggcccacagccggcgctggcattgcgtgccgatgcagtc > 1:826310‑M2/1‑94 (MQ=255) gCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATg < 2:623623/204‑1 (MQ=255) ttGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCGGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACgg < 2:178654/112‑1 (MQ=255) cccGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCgg > 1:176517/1‑151 (MQ=255) ccgACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGa < 2:567624/153‑1 (MQ=255) ccgACTGAATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCGGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCCCCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATGCGTGGCGCCAACAgc < 1:85032/197‑1 (MQ=255) cgACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCAc > 2:9411/1‑177 (MQ=255) tCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATGCGTGGCGCCAACAGCGCCTGGGCCAgg < 1:923300/200‑1 (MQ=255) ggCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATGCGTGGCGCCAACAGCGCCTggg < 1:184428/193‑1 (MQ=255) aTGCCGGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATGCGTGGCGCCAACAGCGCCTGGGCCAGGCTAATGGCCTGGTCCGGGTGATCGTTCGCCATgg < 1:1001397/224‑1 (MQ=255) ccAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCCCCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGc < 2:323728/126‑1 (MQ=255) ccAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCCCCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATGCGTGGCGCCAACAGCGCCTGGGCCAGGCTAATGGCCTGGTCCGGGTGATCGTTCGCCATGGGCACGCTTTCAAAg < 1:9411/235‑1 (MQ=255) ccAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATGCGTGGCGCCAACAGCGCCTg < 1:657378/180‑1 (MQ=255) cGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATGCGTGGCGCCAACAGCGCCTggg < 1:212489/175‑1 (MQ=255) cGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATGCGTGGCGCCAACAGCGCCTGGGCCAGGCTAATGGCCTGGTCCGGGTGATCGTTCGCCATGGGCACGCTTTCAAAGGGCTCGtt > 1:937252/1‑236 (MQ=255) tgtgGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATGCGt > 1:724294/1‑152 (MQ=255) tgtgGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATGCGt < 2:724293/152‑1 (MQ=255) gtgGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATGCGTGGCGCCAACAGCGCCTGGGCCAGGCTAATGGCCTGGTCCGGGTGATCGTTCGCCCGGGGCACGCTTTCaaa > 1:269197/1‑222 (MQ=255) ggCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATGCGTGGCGCCAACAGCGCCTGGGCCAGGCTAATGGCCTGGTCCGGGTGATCGTTCGCCATGGGCACGCTTTCAAAGGGCTCGTTTCGTGAc < 1:1013756/235‑1 (MQ=255) ggCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATGCGt < 1:959499/143‑1 (MQ=255) gcCAGTTGAGCATCACcgccaggcccacagccggcgctggcattgcg < 2:314205‑M2/47‑32 (MQ=255) gcCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATGCGTGGCGCCAACAGCGCCTGGGCCAGGCTAATGGCCTGGTCCGGGTGATCGTTCGCCATGGGCACGCTTTCAAAGGGCTCGTTTc > 2:399941/1‑222 (MQ=255) aGTTGCGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATGCGTGGCGCCAACAGCGCCTGGGCCAGGCTAATGGCCTGGTCCGGGTGATCGTTCGCCATGGGc < 1:302382/197‑1 (MQ=255) gAGCATCACcgccaggcccacagccggcgctggcattgcgtgccgatgcagtcggcgggcaacgacctgtggcaggccgaattcacccccaccgagctgggcccgcaccggttcagtatcgaggcctggatcgacccgtttgccacctattgccacgatctggagaagaagtaccacgccggcgtcgaggtaaaactggaactggaagaaggccgcttgatgctgggcaaaggcat < 1:988472‑M2/236‑228 (MQ=255) | AGCGGCCTTCTTCCAGTTCCAGTTTTACCTCGACGCCGGCGTGGTACTTCTTCTCCAGATCGTGGCAATAGGTGGCAAACGGGTCGATCCAGGCCTCGATACTGAACCGGTGCGGGCCCAGCTCGGTGGGGGTGAATTCGGCCTGCCACAGGTCGTTGCCCGCCGACTGCATCGGCACGCAATGCCAGCGCCGGCTGTGGGCCTGGCGCCAGTTGAGCATCACCGCCAGGCGGTCGTGG‑CCGTCGCTGTAGGCCTTGGTGCTGACGGCCACAGGCTGGCCGCTGACGGCCTTGGCGGCGAAGCTGCCGGCGTCGAGCACGGGTTGGGTGTCTTCGATCACGATGCGTGGCGCCAACAGCGCCTGGGCCAGGCTAATGGCCTGGTCCGGGTGATCGTTCGCCATGGGCACGCTTTCAAAGGGCTCGTTTCGTGACATCGACCTTGCTCCC > AE015451/4585181‑4585629 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |