| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 4701761 = | 57 (0.920) | 4 (0.070) | 4/324 | NT | 7.2% | coding (1699/2055 nt) | kdpB | K+ transporting ATPase, KdpB subunit |
| ? | AE015451 | 4701808 = | 50 (0.860) | coding (1652/2055 nt) | kdpB | K+ transporting ATPase, KdpB subunit | |||||
TCAGCGCGTTGAACACGATCGCCGACAGGATCGCGCTCTGCGGGCTGGCCAGTTGCATCAGGTTGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAGGCGGCCGTCATTCTGCTCCTGGCGAATGCGCGCCAGCTTCTTCTCGGGCGTGGCCTCGGCCAGCACGTCATCGACCCCCGCTTCGGCGGCGATGGCGGCCGCAGTCAACGGGTTGTCG > AE015451/4701575‑4702038 | tCAGCGCGTTGAACACGATCGCCGACAGGATCGCGCTCTGCGGGCTGGCCAGTTGCATCAGGTTGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGAc > 1:622454/1‑235 (MQ=255) cgTTGAACACGATCGCCGACAGGATCGCGCTCTGCGGGCTGGCCAGTTGCATCAGGTTGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTc < 1:311655/236‑1 (MQ=255) gTTGAACACGATCGCCGACAGGATCGCGCTCTGCGGGCTGGCCAGTTGCATCAGGTTGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGt > 2:971865/1‑233 (MQ=255) gTTGAACACGATCGCCGACAGGATCGCGCTCTGCGGGCTGGCCAGTTGCATCAGGTTGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGCGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTcg > 1:151591/1‑236 (MQ=255) cacGAGCGCCGACAGCATCGCGCTCTGCGGGCTGGCCAGTTGCATCAGGTTGATCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGcc < 1:145730/235‑1 (MQ=255) cGATCGCCGACAGGATCGCGCTCTGCGGGCTGGCCAGTTGCATCAGGTTGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTc < 1:955921/235‑1 (MQ=255) ccGACAGGATCGCGCTCTGCGGGCTGGCCAGTTGCATCAGGTTGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCgcgc > 1:625678/1‑235 (MQ=255) aCAGGATCGCGCTCTGCGGGCTGGCCAGTTGCATCAGGTTGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAg > 2:687477/1‑234 (MQ=255) ggATCGCGCTCTGCGGGCTGGCCAGTTGCATCAGGTTGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCAt > 2:821681/1‑211 (MQ=255) aTCGCGCTCTGCGGGCTGGCCAGTTGCATCAGGTTGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCcg < 1:32270/224‑1 (MQ=255) tGCGGGCTGGCCAGTTGCATCAGGTTGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGc < 2:619293/229‑1 (MQ=255) gCGGGCTGGCCAGTTGCATCAGGTTGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCcgcg > 1:474820/1‑216 (MQ=255) gcggtGGCCAGTTGCATCAGGTTGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTc < 2:474819/197‑1 (MQ=255) ggCTGGCCAGTTGCCTCAGGTTGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATg < 1:123794/236‑1 (MQ=255) cAGTTGCATCAGGTTGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGc > 1:904713/1‑236 (MQ=255) aTCAGGTTGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTc < 1:202451/236‑1 (MQ=255) ggTTGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCGACggccac > 1:150438/1‑230 (MQ=255) ttGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTg < 1:971866/236‑1 (MQ=255) tGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTg < 1:817637/235‑1 (MQ=255) aGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGcc > 1:624538/1‑195 (MQ=255) ccAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGATCGTTGTCAACGCACCGCGGGGGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCt < 2:990105/215‑1 (MQ=255) aGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCgg > 1:1047545/1‑236 (MQ=255) gTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCCCCCGCGCAGcc > 2:308735/1‑185 (MQ=255) gCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCgggg > 2:674580/1‑234 (MQ=255) gATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGctg > 1:97080/1‑228 (MQ=255) gCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCa > 2:587662/1‑234 (MQ=255) aaCAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTgg < 1:751553/226‑1 (MQ=255) ggATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGtt > 2:654803/1‑133 (MQ=255) gCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCcaca > 2:900182/1‑221 (MQ=255) gttGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAggcgg < 2:576876/228‑1 (MQ=255) ggtGGCCACGTCGTGGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATg < 2:215733/155‑1 (MQ=255) cgtcgtTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCa < 1:766158/153‑1 (MQ=255) cgtTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCCCCGTCGCCACACATGGCAACCAGGCGGCCGTCATTCTGCTCCTgg > 1:168769/1‑236 (MQ=255) cgtTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACAt < 2:999417/205‑1 (MQ=255) cgtTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACAt > 1:999418/1‑205 (MQ=255) ggCAATGGAGAACGTTGTCAACGCCCCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAGGCGGCCGTCATTCTGCTCCt < 1:247554/230‑1 (MQ=255) gCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTCGCCGCCCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTGCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGtt < 2:344183/161‑1 (MQ=255) cACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAgg < 1:765246/188‑1 (MQ=255) aaCCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGACGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGTGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTg < 2:97080/138‑1 (MQ=255) gcgGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAGGCGGCCGTCAtt > 1:1098222/1‑195 (MQ=255) gggTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCGTGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAGGCGGCCGTCATTCTGCTCCTGGCGAATGCGCGCCAGCTTCTTCTCGGGCGTGGc > 1:589091/1‑235 (MQ=255) ggTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAGGCGGCCGTCATTCTGCTCCTGGCGAATGCGCGCCAGCTTCTTCTCGGGCGTgg > 2:1085520/1‑233 (MQ=255) ggTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAGGCGGCCGTCATTCTGCTCCTGGCGAATGCGCGCCAGCTTCTTCTCGGGCGTGGCCt > 1:520347/1‑236 (MQ=255) tCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAGGCGGCCGTCATTCTGCTCCTGGCGAATGCGCGCCAGCTTCTTCTCGGGCGTGGCCTCGGCCAGCACGTc < 1:362751/236‑1 (MQ=255) tGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTg < 1:405966/83‑1 (MQ=255) tGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTg > 2:405965/1‑83 (MQ=255) acctggacagcgacccgaccaagctgctggacgtagtccaggtcgACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCa < 1:30502‑M2/112‑1 (MQ=255) acctggacagcgacccgaccaagctgctggacgtagtccaggtcgACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCa > 2:30502‑M2/46‑157 (MQ=255) TGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATg < 2:523623‑M1/87‑1 (MQ=255) TGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATg > 1:523624‑M1/1‑87 (MQ=255) TGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAGGCGGCCGTCATTCTGCTCCTGGCGAATGCGCGCCAGCTTCTTCTCGGGCGTGGCCTCGGCCAGCACGTCATCGACCCCCg < 1:17291‑M1/235‑1 (MQ=255) tACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAGGCGGCCGTCATTCTGCTCCTGGCGAATGCGCGCCAGCTTCTTCTCGGGCGTGGCCTCGGCCAGCACGTCATCGACCCCCGCTTcg > 1:647871/1‑235 (MQ=255) tCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAGGCGGCCGTCATTCTGCTCCTGGCGAATGCGCGcc < 1:934392/180‑1 (MQ=255) cccgaccaagctgctggacgtagtccaggtcgACCATGTTCGCGGCCTCCcg < 2:148321‑M2/20‑1 (MQ=255) cccgaccaagctgctggacgtagtccaggtcgACCATGTTCGCGGCCTCCcg > 1:148321‑M2/33‑52 (MQ=255) ccAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAggcggc > 2:206974/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTAAGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAGGCGGCCGTCATTCTGCTCCTGGCGa > 1:618121/1‑170 (MQ=255) ccgcTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCcacac < 2:198630/128‑1 (MQ=255) gtcgCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAGGCGGCCGTCATTCTGCTCCTGGCGAATGCGCGCCAGCTTCTTCTCGGGCGTGGCCTCGGCCAGCACGTCATCGACCCCCGCTTCGGCGGCGCTggctcgcgaagtcg < 1:908490/236‑12 (MQ=255) caggtcgACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAGGCGGCCGTCATTCTGCTCCTGGCGAATGCGCGCCAGCTTCTTCTCGGGCGTGGCCTCGGCCAGCACGTCATCGACCCCCGCTTCGGCGGCGATGGCGGCCGCAGTCAACggg > 2:970930‑M2/8‑232 (MQ=255) tcgACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAGGCGGCCGTCATTCTGCTCCTGGCGAATGCGCGCCAGCTTCTTCTCGGGCGTGGCCTCGGCCAGCACGTCATCGACCCCCGCTTCGGCGGCGATggcgg < 1:171169‑M2/211‑1 (MQ=255) tcgACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAGGCGGCCGTCATTCTGCTCCTGGCGAATGCGCGCCAGCTTCTTCTCGGGCGTGGCCTCGGCCAGCACGTCATCGACCCCCGCTTCGGCGGCGATGGCGGCCGCAGTCAACGGGTTGTCg < 1:821682‑M2/231‑1 (MQ=255) | TCAGCGCGTTGAACACGATCGCCGACAGGATCGCGCTCTGCGGGCTGGCCAGTTGCATCAGGTTGAGCACACCCAGTTGCGGGTAGATGGCTGCGAACAGCGCCGGCAGGATGGCGAAGTATTTGGCCACGTCGTTGGCAATGGAGAACGTTGTCAACGCACCGCGGGTGACCAGCAGCTCCTTGCCGACCTGGACTACGTCCAGCAGCTTGGTCGGGTCGCTGTCCAGGTCGACCATGTTCGCGGCCTCCCGCGCAGCCTGAGTGCCGTCGTTCATGGCCATGCCTACGTCAGCCTGGGCTAGTGCCGGGGCGTCGTTGGCACCGTCGCCACACATGGCAACCAGGCGGCCGTCATTCTGCTCCTGGCGAATGCGCGCCAGCTTCTTCTCGGGCGTGGCCTCGGCCAGCACGTCATCGACCCCCGCTTCGGCGGCGATGGCGGCCGCAGTCAACGGGTTGTCG > AE015451/4701575‑4702038 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |