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2:1143460/1‑193 (MQ=255) tACGCGGTCCTGCGGCCGTTTGGGCCCGGCCAG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTGGCGCCGTATTCCGGTGc > 2:1092306/1‑234 (MQ=255) cgcgGTCCTGCGGCCGTTTGGGCGCGGCCAG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTACAGGGCAAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCt < 2:136124/87‑1 (MQ=255) cgGTCCTGCGGCCGTTTGGGCCCGGCCAG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCCTCGGGGCGGCCCga > 2:676823/1‑161 (MQ=255) ggTCCTGCGGCCGTTTGGGCCCGGCCAG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTGGCGCCGTATTCCGGTGCCATGTTg > 1:533737/1‑236 (MQ=255) tGCGGCCGTTTGGGCCCGGCCAG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAg > 2:309505/1‑168 (MQ=255) tGCGGCCGTTTGGGCCCGGCCAG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTGGCGCCGTATTCCGGTGCCATGTTGGc > 2:836181/1‑233 (MQ=255) tGCGGCCGTTTGGGCCCGGCCAG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCCTGACCAGTTGCCCGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGgcgcc > 2:319997/1‑162 (MQ=255) gCCGTTTGGGCCCGGCCAG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTGGCGCCGTATTCCGGt < 1:983081/218‑1 (MQ=255) ccGTTTGGGCCCGGCCAG‑‑Gagccgtcattcagcgacacgctggccctggacatggacgacgtcgaagccagcctggccgggcccaaacggccgcaggaccgcgtagcgctgggccaggtcagccaagccttcgaccacttcatcgaactgcagcccaaaccgctggccaaagaagttggccgcctggaaagcgaa > 2:1038681‑M1/1‑19 (MQ=255) ccGTTTGGGCCCGGCCAG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGCGAGGCGCAGATAGTCCAGAGt > 2:239401/1‑171 (MQ=255) ccGTTTGGGCCCGGCCAG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGCGGCGCAGATAGTCCag > 1:624972/1‑168 (MQ=255) tGGGCCCGGCCAG‑‑Gagccgtcattcagcgacacgctggccctggacatggacgacgtcgaagccagcctggccgggcccaaacggccgcaggaccgcgtagcgctgggccaggtcagccaagccttcgaccacttcatcgaactgccgcccaaaccgctggccaacgaagttggccgcctg > 2:635889‑M1/1‑14 (MQ=255) tGGGCCCGGCCAG‑‑Gagccgtcattcagcgacacgctggccctggacatggacgacgtcgaagccagcctggccgggcccaaacggccgcaggaccgcgtagcgctgggccaggtcagccaagccttcgaccacttcatcgaactgcagcccaaaccgctggccaaagaagttggccgcctggaaagcgaaggtggcggcggtgtggcagtgggcaacgccgaccagaccggcgcag > 1:1132409‑M1/1‑14 (MQ=255) tGGGCCCGGCCAG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCtt > 2:695551/1‑132 (MQ=255) tGGGCCCGGCCAG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCg > 2:765205/1‑134 (MQ=255) ggCCCGGCCAG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTGGCGCCGTATTCCGGTGCCATGTTGGCGATGGTTGCGCGGTc > 1:180776/1‑236 (MQ=255) 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gctggc‑tTCGCCGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTGGCGCCGTATTCCGGTGCCATGTTGGCGATGGTTGCGCGGTc < 1:1015112/225‑1 (MQ=255) gagccgtcactcggcgacgcgctggccctggacatgggcgacgtcgaagccagcctggccgggcccaaacggccgcaggaccgcgtagcgctgggccaggtcagccaagccttcgaccacttcatc < 2:419754‑M1/126‑126 (MQ=255) | TCGCGGCAATCACCACGGCCCCATCGCGCAGGGTGTGGGTCTGGCCCTGATGGCTGTAGTCGACTGCGCCGGTCTGGTCGGCGTTGCCCACTGCCACACCGCCGCCACCTTCGCTTTCCAGGCGGCCAACTTCTTTGGCCAGCGGTTTGGGCTGCAGTTCGATGAAGTGGTCGAAGGCTTGGCTGACCTGGCCCAGCGCTACGCGGTCCTGCGGCCGTTTGGGCCCGGCCAG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTGGCGCCGTATTCCGGTGCCATGTTGGCGATGGTTGCGCGGTCGGCCAGGG > AE015451/2410097‑2410561 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |