New junction evidence | |||||||||||
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ACTGCGCCGGTCTGGTCGGCGTTGCCCACTGCCACACCGCCGCCACCTTCGCTTTCCAGGCGGCCAACTTCTTTGGCCAGCGGTTTGGGCTGCAGTTCGATGAAGTGGTCGAAGGCTTGGCTGACCTGGCCCAGCGCTACGCGGTCCTGCGGCCGTTTGGGCCCGGCCAG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTGGCGCCGTATTCCGGTGCCATGTTGGCGATGGTTGCGCGGTCGGCCAGGGGCAACTCGGCCAGGCCGTCCCCGTAGAACTCGACGAACTTGCCCACCACGCC > AE015451/2410159‑2410613 | aCTGCGCCGGTCTGGTCGGCGTTGCCCACTGCCACACCGCCGCCACCTTCGCTTTCCAGGCGGCCAACTTCTTTGGCCAGCGGTTTGGGCTGCAGTTCGATGAAGTGGTCGAAGGCTTGGCTGACCTGGCCCAGCGCTACGCGGTCCTGCGGCCGTTTGGGCCCGGCCAG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCa < 1:1268611/235‑1 (MQ=255) cTGCGCCGGTCTGGTCGGCGTTGCCCACTGCCACACCGCCGCCACCTTCGCTTTCCAGGCGGCCAACTTCTTTGGCCAGCGGTTTGGGCTGCAGTTCGATGAAGTGGTCGAAGGCTTGGCTGACCTGGCCCAGCGCTACGCGGTCCTGCGGCCGTTTGGGCCCGGCCAG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTcctggccgggccca > 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aG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTGGCGCCGTATTCCGGTGCCATGTTGGCGATGGTTGCGCGGTCGGCCAggg > 1:1249716/1‑235 (MQ=255) aG‑‑GCTGGC‑GTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCCTCGGGGCGGCCCgcg > 2:1256459/1‑133 (MQ=255) gctggc‑tTCGCCGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTGGCGCCGTATTCCGGTGCCATGTTGGCGATGGTTGCGCGGTc < 1:1015112/225‑1 (MQ=255) gc‑tTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTcctggccgggcccaaacggccgcaggaccgcgtagcgctgggccaggtcagccaagccttcgaccacttcatcgaactgcagcccaaaccgctggccaaagaagttggccgcctggaaagcgaaggtggcggcggtgtggcagtgggcaacgccgaccagaccggcgcagtcgactacagcc > 2:1099256‑M2/1‑49 (MQ=255) gc‑tTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTcctggccgggcccaaacggccgcaggaccgcgtagcgctgggccaggtcagccaagccttcgaccacttcatcgaactgcagcccaaaccgctggccaaagaagttggccgcctggaaagcgaaggtggcggcggtgtggcagtgggcaacgccgaccagaccggcgcagtcgactacagcc < 1:1099261‑M2/231‑183 (MQ=255) tCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTg < 1:298276/177‑1 (MQ=255) gACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCgggga > 2:275638/1‑160 (MQ=255) ccgtcgtCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTGGCGCCGTATTCCGGTGCCATGTTGGc < 1:1187720/199‑1 (MQ=255) aCGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTGGCGCCGTATTCCGGTGCCATGTTGGCGATGGTTg < 2:481851/208‑1 (MQ=255) cgtcgtCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTGGCGCCGTATTCCGGTGCCATGTTGGCGATGGTTGCGCGGTCGGCCAGGGGCAACTCGGCCAgg < 1:92738/236‑1 (MQ=255) tcgtcCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGcc < 1:10130/116‑1 (MQ=255) tcgtcCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGcc > 2:10130/1‑116 (MQ=255) ccATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCCGATAGTCCaga > 2:3993/1‑134 (MQ=255) ggCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTGGCGCCGTATTCCGGTGCCATGTTGGCGATGGTTGCGCGGTCGGCCAGGGGCAACTCGGCCAGGCCGTCCCCGTAGAACt < 1:476881/236‑1 (MQ=255) ccAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTGGCGCCGTATTCCGGTGCCATGTTGGCGATGGTTGCGCGGTCGGCCAGGGGCAACTCGGCCAGGCCGTcccctgtctcttat > 1:126149/1‑226 (MQ=255) cAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTAGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGGGTGACTTgg > 2:673818/1‑130 (MQ=255) ggtgtCGCTGAATGAGGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGGCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAgg < 2:99469/148‑1 (MQ=255) 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cGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTGGCGCCGTATTCCGGTGCCATGTTGGCGATGGTTGCGCGGTCGGCCAGGGGCAACTCGGCCAGGCCGTCCCCGTAGAACTCGACGAACTTGCCCACCACGc > 1:290324/1‑236 (MQ=255) ggCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTGGCGCCGTATTCCGGTGCCATGTTGGCGATGGTTgcgc < 2:533732/172‑1 (MQ=255) cTcctggccgggcccaaacggccgcaggaccgcgtagcgctgggccaggtcagccaagccttcgaccacttcatcgaactgcagcccaaaccgctggccaaagaagttggccgcctggaaagcgaaggtggcggcggtgtggcagtgggcaacgccgaccagaccggcgcagtcgactacagccatcagggccagacccacaccctgcgcgatggggccgtggtgattgccgcg > 2:1087543‑M2/1‑2 (MQ=255) | ACTGCGCCGGTCTGGTCGGCGTTGCCCACTGCCACACCGCCGCCACCTTCGCTTTCCAGGCGGCCAACTTCTTTGGCCAGCGGTTTGGGCTGCAGTTCGATGAAGTGGTCGAAGGCTTGGCTGACCTGGCCCAGCGCTACGCGGTCCTGCGGCCGTTTGGGCCCGGCCAG‑‑GCTGGC‑TTCGACGTCGTCCATGTCCAGGGCCAGCGTGTCGCTGAATGACGGCTCCTGGCCGGGCAGGCGCCACATGCCCTGTGCCTTGCAGTACTGCTCGACCAGTTGCACGGTCGCTTCGGGGCGGCCCGAGAGGCGCAGATAGTCCAGAGTGACTTGGTCGACCGGGAAGAAACCACAGGTGGCGCCGTATTCCGGTGCCATGTTGGCGATGGTTGCGCGGTCGGCCAGGGGCAACTCGGCCAGGCCGTCCCCGTAGAACTCGACGAACTTGCCCACCACGCC > AE015451/2410159‑2410613 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |