| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 3475322 = | 43 (0.600) | 4 (0.060) | 4/332 | NT | 8.9% | coding (1391/2517 nt) | PP_3087 | putative excinuclease ABC subunit A |
| ? | AE015451 | 3475368 = | 41 (0.610) | coding (1345/2517 nt) | PP_3087 | putative excinuclease ABC subunit A | |||||
CAGTTCCAGCAGGGCCTGGCTGACCAGGCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGTGCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCT > AE015451/3475087‑3475550 | agcaccccgaccttgtcttctggtgaactgcaacgcctgcgcctggccacccagctgaattcgcagctgtttggggtggtttacgtactcgacgagccgtcggccggcttgcacccggccgacagtgaagcgctgttcgaagccctgcagcgcctgaaacaggctggcaactcggtgtacgtggtggagcatgacctggacaccatgcgccgcgccgactggctggtggatgtagg > 1:940384‑M1/236‑236 (MQ=255) aGTTCCAGCAGGGCCTGGCTGACCAGGCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCggcgggcg > 1:1018965/1‑235 (MQ=255) ttCCAGCAGGGCCTGGCTGACCAGGCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGggcggc < 1:100676/235‑1 (MQ=255) gcagGGCCTGGCTGACCAGGCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCt < 1:691764/235‑1 (MQ=255) tcttctggtgaactgcaacgcctgcgcctggccacccagctgaattcgcagctgtttggggtggtttacgtactcgacgagccgtcggccggcttgcacccggccgacagtgaagcgctgttcgaagccctgcagcgcctgaaacaggctggcaactcggtgtacgtggtggagcatgacctggacaccatgcgccgcgccgactggctggtggatgtagGGccc > 1:304765‑M1/221‑225 (MQ=255) cctgcgcctggccacccagctgaattcgcagctgtttggggtggtttacgtactcgacgagccgtcggccggcttgcacccggccgacagtgaagcgctgttcgaagccctgcagcgcctgaaacaggctggcaactcggtgtacgtggtggagcatgacctggacaccatgcgccgcgccgactggctggtggatgtagGGCCCg < 2:893093‑M1/6‑1 (MQ=255) ccGAGCCGGAAATACCGGTGACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCt < 1:1127305/205‑1 (MQ=255) tACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGcc > 1:935733/1‑189 (MQ=255) tAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCCGCCAGTcg > 1:1134589/1‑236 (MQ=255) tAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTcg > 1:698357/1‑236 (MQ=255) agcCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTg < 2:873121/185‑1 (MQ=255) cccAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCa < 1:249455/201‑1 (MQ=255) cccAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTcggcgcggc < 1:489638/235‑1 (MQ=255) cAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCa > 1:885569/1‑236 (MQ=255) cGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGggcggc < 1:135367/160‑1 (MQ=255) cggcgCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGGAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCCGGCCGGCGGGGGGgcc > 2:249451/1‑154 (MQ=255) cAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGc < 1:843420/235‑1 (MQ=255) tATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGgtg < 1:1077268/218‑1 (MQ=255) ggTTATTGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCGGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTc > 1:613886/1‑163 (MQ=255) tGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCggcgcggcgc < 2:935728/200‑1 (MQ=255) gcgcGTGATGCCGTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCggcgggcg < 2:329065/125‑1 (MQ=255) cgcgTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCGGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGt < 1:339925/235‑1 (MQ=255) gATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGGGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCg > 1:345912/1‑124 (MQ=255) aTGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCGCCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATg > 2:1036351/1‑195 (MQ=255) cAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCggcgggcg < 2:264026/104‑1 (MQ=255) gaagccctgcagcgcctgaaacaggctggcaactcggtgtacgtggtggagcatgacctggacaccatgcgccgcgccgactggctggtggctgtagGGCCCGCTGTAGAGGATGGCGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGcc < 1:1130299‑M1/46‑1 (MQ=255) ggggggggCGCGGGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGc < 2:313860/121‑1 (MQ=255) cgcgTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACt > 1:521539/1‑235 (MQ=255) gtgtGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGaa < 2:891421/220‑1 (MQ=255) gtgGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGc > 1:893098/1‑236 (MQ=255) gCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTaca < 1:759736/175‑1 (MQ=255) tACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGc < 2:745943/157‑1 (MQ=255) cGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACCTCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTc > 1:93100/1‑187 (MQ=255) cGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAggg > 2:950716/1‑200 (MQ=255) cATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGcc > 1:878144/1‑60 (MQ=255) cATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTACAGGATGGTGCCGCCGGGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCt > 2:829314/1‑177 (MQ=255) aTCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTgg > 2:369400/1‑64 (MQ=255) aaCAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCg > 1:1236422/1‑160 (MQ=255) aaCAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCgg > 1:624121/1‑218 (MQ=255) aaCAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGTGCAAGCCGGCCGACgg > 1:891061/1‑236 (MQ=255) aaCAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGTGCAAGCCGGCCGACgg > 1:542533/1‑236 (MQ=255) aaCAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGAGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGc > 1:172076/1‑96 (MQ=255) ggTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGTGCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGt < 1:652631/236‑1 (MQ=255) accatgcgccgcgccgactggctggtggatgtagGGCCCGCTGTAGCGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGc < 1:522947‑M1/135‑1 (MQ=255) atgcgccgcgccgactggctggtggatgtagGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGGCATGCTCCACCACGTACACCGAg < 1:362477‑M1/111‑1 (MQ=255) gACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGTGCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAaccac > 1:754010/1‑236 (MQ=255) cTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGTGCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAaccac > 2:1072216/1‑234 (MQ=255) cgactggctggtggatgtagGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGTGCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAg < 1:1180566‑M1/215‑1 (MQ=255) cccGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGTGCAAgccggcc < 1:263294/197‑1 (MQ=255) cGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGACCAg > 2:75262/1‑166 (MQ=255) ggCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGTGCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGc < 1:444833/235‑1 (MQ=255) ggCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCAGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAg < 2:346838/102‑1 (MQ=255) ccAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGGTGGGgccgc > 2:182352/1‑39 (MQ=255) ccAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGTGCAAGCCGGCCGa > 1:1186560/1‑196 (MQ=255) ccAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCCCCGTGTTCGCCGGCCGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTcggcg > 2:210373/1‑83 (MQ=255) ggCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCCGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGGGTCCAGGt > 2:331997/1‑99 (MQ=255) gCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGTGCAAgccggc > 2:557199/1‑189 (MQ=255) gcgggcggCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGTGCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCt < 1:703636/235‑1 (MQ=255) | CAGTTCCAGCAGGGCCTGGCTGACCAGGCTGGATTTGCCCGAGCCGGAAATACCGGTAACGGCGGTAAAGCAGCCCAACGGAAATGCGGCGCTCAGGTTATCGAGGTTATTGCGCGTGATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGTGCAAGCCGGCCGACGGCTCGTCGAGTACGTAAACCACCCCAAACAGCTGCGAATTCAGCT > AE015451/3475087‑3475550 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |