| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 4282722 | 46 (0.640) | 5 (0.070) | 4/332 | NT | 9.9% | coding (508/1089 nt) | PP_3753 | Transcriptional regulator, AraC family |
| ? | AE015451 | = 4282759 | 47 (0.690) | coding (471/1089 nt) | PP_3753 | Transcriptional regulator, AraC family | |||||
CGCAATGCCCGCAGGTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTGGCGCAAGGCCTTTTCCAGGTTC > AE015451/4282499‑4282957 | cgcAATGCCCGCAGGTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGa < 1:98460/235‑1 (MQ=255) aaTGCCCGCAGGTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTc > 1:778111/1‑236 (MQ=255) gCCCGCAGGTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGGGCTCCg > 1:1198435/1‑235 (MQ=255) gCCCGCAGGTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTcc > 2:653121/1‑234 (MQ=255) ccGCAGGTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTg > 1:1085982/1‑235 (MQ=255) cAGGTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGa > 1:144581/1‑216 (MQ=255) gTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGa > 1:664282/1‑236 (MQ=255) cTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCc > 1:444205‑M2/1‑235 (MQ=255) aGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcc > 1:684109‑M2/1‑232 (MQ=255) ccaccaGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcc > 1:13896‑M2/1‑230 (MQ=255) caccaGCCCGTGCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCc > 2:874066‑M2/1‑229 (MQ=255) ccGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATccgc > 2:1096877/1‑222 (MQ=255) ttCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCcagccagc < 2:898038/235‑1 (MQ=255) cTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGGGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCCTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccggcccaggaggacg > 1:14159‑M2/1‑217 (MQ=255) cTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGgcgc < 2:1255483/181‑1 (MQ=255) ttGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGCTGCACTGCGCAGAAAGGTCTACAGGTCTGCCCGATCCTGCTCCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCc > 2:710341‑M2/1‑213 (MQ=255) cccTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCcagcaca < 1:423316/212‑1 (MQ=255) gAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCagcta > 1:476539/1‑232 (MQ=255) ggTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTc > 1:549388/1‑236 (MQ=255) cACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGGCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcc > 1:322360‑M2/1‑182 (MQ=255) cTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGcc > 2:630447/1‑206 (MQ=255) tGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTcc > 2:187059/1‑158 (MQ=255) tGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTcc < 1:187062/158‑1 (MQ=255) tGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCa > 1:611000/1‑236 (MQ=255) aGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGCACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGGGCTcc > 2:1189884/1‑153 (MQ=255) aGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGccagccag > 2:580078/1‑189 (MQ=255) aGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCcagcac > 1:559419/1‑192 (MQ=255) 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agccggCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGgcgc < 2:398563/110‑1 (MQ=255) tCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGtt < 1:653126/236‑1 (MQ=255) tGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGttt < 2:465061/196‑1 (MQ=255) accaccGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACt < 1:767758/235‑1 (MQ=255) caccGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCCCCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCc > 2:670014‑M2/1‑142 (MQ=255) gCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGa > 2:1176417/1‑126 (MQ=255) cAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCt > 2:1085841/1‑234 (MQ=255) gcAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCa < 2:872619/201‑1 (MQ=255) aGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATcc > 2:340957/1‑127 (MQ=255) gTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCg > 2:1048917/1‑215 (MQ=255) gcgcTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCG‑‑‑GATTGCCATCGACCGCACGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGc < 1:270299/235‑1 (MQ=255) aaCTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGaca < 1:862507/82‑1 (MQ=255) aaCTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGaca > 2:862502/1‑82 (MQ=255) aCTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgc > 1:761645‑M2/1‑113 (MQ=255) 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> 2:766855/1‑178 (MQ=255) cAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGAc < 1:766860/178‑1 (MQ=255) cAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGCAGGTTTCCTCGGCATAGACCCgg > 2:202772/1‑154 (MQ=255) gCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGgcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagt > 1:761645‑M1/1‑46 (MQ=255) gCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTGCCTCgg > 2:894466/1‑138 (MQ=255) ccGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGgcggattgccatcgaccgcacggcgctcgcggggtcgcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggac > 1:644029‑M1/1‑40 (MQ=255) gccccccacCGCCGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgag > 2:1007753‑M2/3‑75 (MQ=255) ccccACAGCAGCCAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGc < 1:49023/235‑1 (MQ=255) ccccACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGg > 1:1006831‑M1/1‑35 (MQ=255) ccccACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGCCACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGACGGCAACCCGCCGCCCGGCCACCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCCCCAGGTCGGTCTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAgcg > 2:421567/1‑144 (MQ=255) agcagcAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGCCTGCACGCTGATCAccgcacgcccg > 2:277431/1‑180 (MQ=255) cgtcCTCCTGGGCCGGGCGgcggattgccgtcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcg > 2:976892‑M1/1‑19 (MQ=255) cgtcCTCCTGGGCCGGGCGgcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcctgccggtggtgcaggatcgggcagccctgaggacctttctgcgcagtgcaccccaagggctggtgatccgctttcgcaatcag > 1:14159‑M1/1‑19 (MQ=255) cgtcCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGcccccc > 1:946865/1‑224 (MQ=255) tcctGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAg > 1:521992/1‑179 (MQ=255) tcctGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTGGCGCAAGGc > 1:1149979/1‑236 (MQ=255) tcctGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGCAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGCGt > 2:308086/1‑119 (MQ=255) ccGGGCGgcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggagtacgacttgctgctgttggggccggacctgcggctgggcagcg > 1:320380‑M1/1‑7 (MQ=255) ggcggcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgccagcgcctacctgcgcctgccggtggtgcaggatcgggcagccctgaagacctttctgcgcagtg > 1:322360‑M1/1‑4 (MQ=255) ggcggcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcctgccggtggtgcaggatcgggcagccctgaagacctttctgcgcagtgcacctcaagggctggtgatccgctttcgcaatcagaacgggctggtggct > 1:684109‑M1/1‑4 (MQ=255) ggcggcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcctgccggtggtgcaggatcgggcagccctgaagacctttctgcgcagtgcacctcaagggctggtgatccgctttcgcaatcagaacgggctggtgg > 1:13896‑M1/1‑4 (MQ=255) ggcggcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggaggacgacctgctgctgtgggggccggacctgcggcggggcag > 2:381823‑M1/1‑4 (MQ=255) ggCGCGACACCGCGAGCTCCGTTCGGGCGACGGCACTTCCGCGCCCTgccatccc > 2:766314/1‑54 (MQ=255) ggCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAAt < 1:1208914/124‑1 (MQ=255) ggCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTGGCGCAAGGCCTTTTc > 2:628033/1‑232 (MQ=255) ggCGCGACACCGCGAGCTCCGCGCGGTCGATgg > 2:228335/1‑33 (MQ=255) ggcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcctgccggtggtgcaggatcgggcagccctgaagacctttctgcgcagtgcacctcaagggctggtgatccgctttcgcaatcagcacgggctggtg > 2:874066‑M1/1‑1 (MQ=255) ggcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcctgccggtggtgcaggatcgggcagccctgaagacctttctgcgcagtgcacctcaagggctggtgatccgctttcgcaatcagaacgggctggtggctgag > 1:444205‑M1/1‑1 (MQ=255) ggcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcctgccggtggagcaggatcgggcagacctgtagacctttctgcgcagtgcagctcaagggctggtgatccgctttcgcaa > 2:710341‑M1/1‑1 (MQ=255) ggcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgagggggagttcgacagcgcctacctgcgcctgccggtg > 2:670014‑M1/1‑1 (MQ=255) gcgACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCAt > 2:1146500/1‑208 (MQ=255) gcgACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTGGCGCAAGGCCTTTTCCAGGtt > 1:980026/1‑235 (MQ=255) gcgACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTGGCGCAAGGCCTTTTCCAGGtt > 1:941212/1‑235 (MQ=255) | CGCAATGCCCGCAGGTGCCGATACACCTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTGGCGCAAGGCCTTTTCCAGGTTC > AE015451/4282499‑4282957 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |