New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 4282722 | 46 (0.640) | 5 (0.070) | 4/332 | NT | 9.9% | coding (508/1089 nt) | PP_3753 | Transcriptional regulator, AraC family |
? | AE015451 | = 4282759 | 47 (0.690) | coding (471/1089 nt) | PP_3753 | Transcriptional regulator, AraC family |
CTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTGGCGCAAGGCCTTTTCCAGGTTCGGCTCGAGGATCAACCCCCGGCAGATCAGGGCAAAA > AE015451/4282525‑4282993 | cTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCc > 1:444205‑M2/1‑235 (MQ=255) aGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcc > 1:684109‑M2/1‑232 (MQ=255) ccaccaGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcc > 1:13896‑M2/1‑230 (MQ=255) caccaGCCCGTGCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCc > 2:874066‑M2/1‑229 (MQ=255) ccGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATccgc > 2:1096877/1‑222 (MQ=255) ttCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCcagccagc < 2:898038/235‑1 (MQ=255) cTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGGGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCCTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccggcccaggaggacg > 1:14159‑M2/1‑217 (MQ=255) ttGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGCTGCACTGCGCAGAAAGGTCTACAGGTCTGCCCGATCCTGCTCCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCc > 2:710341‑M2/1‑213 (MQ=255) cccTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCcagcaca < 1:423316/212‑1 (MQ=255) gAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCagcta > 1:476539/1‑232 (MQ=255) ggTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTc > 1:549388/1‑236 (MQ=255) cACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGGCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcc > 1:322360‑M2/1‑182 (MQ=255) cTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGcc > 2:630447/1‑206 (MQ=255) tGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCa > 1:611000/1‑236 (MQ=255) aGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGccagccag > 2:580078/1‑189 (MQ=255) aGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCcagcac > 1:559419/1‑192 (MQ=255) aGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGCTTTcc > 1:868212/1‑225 (MQ=255) gTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAg < 1:177038/203‑1 (MQ=255) gATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATg > 1:527674/1‑236 (MQ=255) tCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGtt < 1:653126/236‑1 (MQ=255) tGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGttt < 2:465061/196‑1 (MQ=255) accaccGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACt < 1:767758/235‑1 (MQ=255) caccGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCCCCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCc > 2:670014‑M2/1‑142 (MQ=255) cAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCt > 2:1085841/1‑234 (MQ=255) gcAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCa < 2:872619/201‑1 (MQ=255) gTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCg > 2:1048917/1‑215 (MQ=255) gcgcTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCG‑‑‑GATTGCCATCGACCGCACGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGc < 1:270299/235‑1 (MQ=255) aCTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgc > 1:761645‑M2/1‑113 (MQ=255) cGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCCGGCAGGTTTCCTCGGCCTa > 2:368904/1‑163 (MQ=255) cGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCa > 2:910587/1‑180 (MQ=255) gTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACCCCGCGAGCGCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccgg > 1:644029‑M2/1‑98 (MQ=255) ccGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGCCACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGAtaa > 1:790227/1‑197 (MQ=255) ccGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCg > 2:209599/1‑161 (MQ=255) cGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCAccgcccgcc < 1:429874/207‑1 (MQ=255) cGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGACGGCAATCCGCcgcccggcccaggaggacg > 2:976892‑M2/1‑95 (MQ=255) cGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCAACAGCAGCAAGTCGTACTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccgg > 1:320380‑M2/1‑95 (MQ=255) cTGCCCCGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAGGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcc > 2:381823‑M2/1‑93 (MQ=255) cAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGAc > 2:766855/1‑178 (MQ=255) cAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGAc < 1:766860/178‑1 (MQ=255) cAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGCAGGTTTCCTCGGCATAGACCCgg > 2:202772/1‑154 (MQ=255) gCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTGCCTCgg > 2:894466/1‑138 (MQ=255) gccccccacCGCCGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgag > 2:1007753‑M2/3‑75 (MQ=255) ccccACAGCAGCCAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGc < 1:49023/235‑1 (MQ=255) ccccACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGCCACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGACGGCAACCCGCCGCCCGGCCACCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCCCCAGGTCGGTCTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAgcg > 2:421567/1‑144 (MQ=255) agcagcAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGCCTGCACGCTGATCAccgcacgcccg > 2:277431/1‑180 (MQ=255) cgtcCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGcccccc > 1:946865/1‑224 (MQ=255) tcctGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAg > 1:521992/1‑179 (MQ=255) tcctGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTGGCGCAAGGc > 1:1149979/1‑236 (MQ=255) tcctGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGCAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGCGt > 2:308086/1‑119 (MQ=255) ggCGCGACACCGCGAGCTCCGTTCGGGCGACGGCACTTCCGCGCCCTgccatccc > 2:766314/1‑54 (MQ=255) ggCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAAt < 1:1208914/124‑1 (MQ=255) ggCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTGGCGCAAGGCCTTTTc > 2:628033/1‑232 (MQ=255) gcgACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCAt > 2:1146500/1‑208 (MQ=255) gcgACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTGGCGCAAGGCCTTTTCCAGGtt > 1:980026/1‑235 (MQ=255) gcgACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTGGCGCAAGGCCTTTTCCAGGtt > 1:941212/1‑235 (MQ=255) gACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTgg > 2:1013379/1‑213 (MQ=255) cgcgcgCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACcgcccgcccgcc < 2:85566/147‑1 (MQ=255) gCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTGGCGCAAGGCCTTTTCCAGGTTCGGCTCGAgg > 2:600209/1‑233 (MQ=255) cTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTGGCGCAAGGCCTTTTCCAGGTTCGGCTCGAGGATCa < 1:545789/236‑1 (MQ=255) gTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCCCGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCCTGCCCTgg > 2:1279148/1‑198 (MQ=255) gCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTGGCGCAAGGCCtt > 2:450687/1‑207 (MQ=255) gCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTGGCGCAAGGCCtt < 1:450692/207‑1 (MQ=255) aTGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTAcc < 2:527669/135‑1 (MQ=255) tCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTGGCGCAAGGCCTTTTCCAGGTTCGGCTCGAGGATCAACCCCCGGCAGATCAggaca < 1:1237767/236‑4 (MQ=255) cgccgccgggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcgccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcctgccggtggtgcaggatcgggcagccctgaagacctttct > 2:270295‑M2/1‑3 (MQ=255) gccgccCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTGGCGCAAGGCCTTTTCCAGGTTCGGCTCGAGGATCAACCCCCGGCAGATCAGGGCaaaa > 1:322585/1‑236 (MQ=255) ccgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggg > 1:1006831‑M2/1‑1 (MQ=255) | CTCAGCCACCAGCCCGTTCTGATTGCGAAAGCGGATCACCAGCCCTTGAGGTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCAGGAACAGGCCGAAGCCCCCCATGCACTGGCGCAAGGCCTTTTCCAGGTTCGGCTCGAGGATCAACCCCCGGCAGATCAGGGCAAAA > AE015451/4282525‑4282993 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |