| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 2055637 | 46 (0.640) | 4 (0.060) | 4/332 | NT | 6.5% | coding (778/1092 nt) | aroC | Chorismate synthase |
| ? | AE015451 | = 2055929 | 71 (1.050) | coding (1070/1092 nt) | aroC | Chorismate synthase | |||||
GGGCCAGCCGATCGTTGCCCACCTGGCACTGAAGCCCACTTCCAGCATCACCACCCCGGGCCGCTCGATCGATGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGG > AE015451/2055702‑2056155 | gggCCAGCCGATCGTTGCCCACCTGGCACTGAAGCCCACTTCCAGCATCACCACCCCGGGCCGCTCGATCGATGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACcccgg > 2:469195‑M2/1‑228 (MQ=255) gATCGTTGCCCACCTGGCACTGAAGCCCACTTCCAGCATCACCACCCCGGGCCGCTCGATCGATGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAgc < 1:855081/236‑1 (MQ=255) tGCCCACCTGGCACTGAGGCCCACTTCCAGCATCACCACCCCGGGCCGCTCGATCGATGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGa < 1:439110/235‑1 (MQ=255) gAAGCCCACTTCCAGCATCACCACCCCGGGCCGCTCGATCGATGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCTGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTg > 1:849039/1‑228 (MQ=255) gCCCACTTCCAGCATCACCACCCCGGGCCGCTCGATCGATGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCACAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATAc < 1:567652/195‑1 (MQ=255) aGCATCACCACCCCGGGCCGCTCGATCGATGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTaa < 1:907699/236‑1 (MQ=255) accaccCCGGGCCGCTCGATCGATGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCg < 1:370834/235‑1 (MQ=255) accaccCCGGGCCGCTCGATCGATGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:536558/236‑1 (MQ=255) cccccccGGGCCGCTCGATCGATGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAg < 1:1188195/191‑1 (MQ=255) accCCGGGCCGCTCGATCGATGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCg > 1:948801/1‑232 (MQ=255) accCCGGGCCGCTCGATCGATGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCg < 2:948796/232‑1 (MQ=255) cccGGGCCGCTCGATCGATGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt > 2:873696/1‑235 (MQ=255) gCCGCTCGATCGATGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCCACGGCCTCTTcg > 1:871607/1‑213 (MQ=255) tcgatcgaTGTCGATGGCAACGCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGata < 1:1079758/236‑1 (MQ=255) tcgatcgaTGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTaa < 1:531205/215‑1 (MQ=255) gatcgatGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCGTCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCaa > 1:574174/1‑195 (MQ=255) gatcgatGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCCCCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCCAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCCACTGCAACGGCct > 2:221806/1‑201 (MQ=255) gatcgatGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCct > 1:998677/1‑201 (MQ=255) gatcgatGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGatat > 1:964022/1‑235 (MQ=255) atgtcgatgGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGt > 1:374391/1‑206 (MQ=255) tcgatgGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGccc < 1:499403/235‑1 (MQ=255) tcgatgGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGccc < 1:513922/235‑1 (MQ=255) tgGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTggg < 1:230987/219‑1 (MQ=255) ggCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGACGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGc < 1:1215522/228‑1 (MQ=255) atcaCCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTaa < 2:568342/182‑1 (MQ=255) aCCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCcg < 1:576676/236‑1 (MQ=255) cAACGGCCGCCGCGACCCGGGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACt < 2:151162/203‑1 (MQ=255) aaGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCGTCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATCCCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCtt < 2:418243/166‑1 (MQ=255) ccgccACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAg > 1:219349/1‑236 (MQ=255) cgccACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAAccc < 1:5374/174‑1 (MQ=255) cACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGccc < 2:154518/197‑1 (MQ=255) cACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGccc > 1:154521/1‑197 (MQ=255) cGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACcccggtgctcggtgccgcgctgggccacactggcgaaaccggcgccggtttccacgcccttgcccgcgctgatgctcat < 2:305834‑M2/193‑80 (MQ=255) gcgtgGGCAGCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCcgc < 1:4989/235‑1 (MQ=255) cgtgGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:1085808/162‑1 (MQ=255) cgtgGGCATCCGTGCCACGCCGAGTGCCGAGGCGATGATGGCCAGTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCGGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa < 2:101293/167‑1 (MQ=255) tgGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGcc < 2:964017/183‑1 (MQ=255) gggCCTCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCGCCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGt < 1:124709/194‑1 (MQ=255) aTCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc > 2:55364/1‑161 (MQ=255) cGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAggccg < 1:919541/234‑1 (MQ=255) gTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCCCCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCCAGTGAATACcccggttctcgctgccgccc < 2:10168‑M2/114‑21 (MQ=255) ccACGCCGAGTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATCCCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTa < 2:219346/203‑1 (MQ=255) aCGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTc > 1:407933/1‑132 (MQ=255) gCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCCCCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATCCCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCg < 2:336124/143‑1 (MQ=255) agtGCCGAGGCGATGATGGCGATGGCGTTGATGGACCACCGGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGt < 2:528233/181‑1 (MQ=255) ttGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGt < 1:664671/174‑1 (MQ=255) gtGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGata < 2:1259857/153‑1 (MQ=255) ccGAGGCGATGATGGCCAGTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCATCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATAGGGATATCTCTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACaa < 1:1220013/234‑1 (MQ=255) cgatgGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaga < 1:18066/203‑1 (MQ=255) ggCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGCCAg > 2:360731/1‑163 (MQ=255) ttGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACcccggtgctcggtgccgcgctgggccactctggcgaaaccggcgccgatttccacgcccttgaccgcgttgatgctcatcagcgcatgggccagctctgcatccaggcggtcgaagatcggctcgcccagcccgggcatc < 1:1219136‑M2/201‑141 (MQ=255) ttGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACcccggtgctcggtgccgcgctgggccacactggcgaaaccggcgccgatttccacgcccttgaccgcgttgatgctcatcagcgcatgggccagctctgcatccaggcggtcgaagatcggctcgcccagcccgggcatc > 2:1219131‑M2/1‑61 (MQ=255) ttGCGTTGATGGACCACCGGCTGCGCCGCCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAGGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCACGGGTaaagc < 2:59443/115‑3 (MQ=255) tGCGTTGATGGACCACCTGCGGCGCCACCGTGCGCAGAAGGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTaa < 2:17726/111‑1 (MQ=255) gTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGCATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGc > 2:273050/1‑88 (MQ=255) ttGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGccc > 1:928909/1‑137 (MQ=255) ttGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGccc < 2:928904/137‑1 (MQ=255) gATCGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTCCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGccc < 2:593541/135‑1 (MQ=255) ggACCACCTGCGGCGCGACGGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCTAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTc < 2:1232430/174‑1 (MQ=255) gACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAggc < 2:848244/187‑1 (MQ=255) gACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTgg < 1:1237858/235‑1 (MQ=255) caccTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGc < 2:89438/126‑1 (MQ=255) gTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCt > 1:894186/1‑229 (MQ=255) gTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCt < 1:873701/236‑1 (MQ=255) gcAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATCCCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGc < 2:267745/185‑1 (MQ=255) gcAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTaa < 2:196777/78‑1 (MQ=255) gaaGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTg < 1:279893/55‑1 (MQ=255) aaTGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCAccc > 1:836345/1‑186 (MQ=255) gCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCACGGGTAAACTCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAgg > 1:548314/1‑156 (MQ=255) aTGTGCAAGTGAATCCCCCGGTGCTGGGCCCGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCa < 2:343698/160‑1 (MQ=255) aaGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGcc > 2:1109152/1‑169 (MQ=255) aaGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGcc < 1:1109157/169‑1 (MQ=255) aaGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCCCCCCATGCCACCCATCCCCtc > 2:1152670/1‑190 (MQ=255) aaGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCctgct > 2:697036/1‑233 (MQ=255) aaGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTggg > 1:128397/1‑236 (MQ=255) aaGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGGGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGa > 2:1266776/1‑141 (MQ=255) aGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTggg > 1:563739/1‑235 (MQ=255) ccccGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACaa < 2:207884/156‑1 (MQ=255) | GGGCCAGCCGATCGTTGCCCACCTGGCACTGAAGCCCACTTCCAGCATCACCACCCCGGGCCGCTCGATCGATGTCGATGGCAACCCGGTGGACGTCATCACCAAAGGCCGCCACGACCCGTGCGTGGGCATCCGTGCCACGCCGATTGCCGAGGCGATGATGGCCATTGCGTTGATGGACCACCTGCTGCGCCACCGTGCGCAGAATGCCGATGTGCAAGTGAATACCCCGGTGCTGGGCCAGCGCTGATCCAACTGCAACGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGGATATCACTGCCCTCAGGTGCAGTGACAGGGTGAAATCCGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGTCCCCACAAGGCCACCCCATGCAACCCATCCCCTACTGGCGCCTGTCCAGCTTCTACCTGTTCTATTTCGCCCTGCTGGG > AE015451/2055702‑2056155 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |