| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | AE015451 | = 2183830 | 72 (1.080) | intergenic (+61/‑113) | PP_5489/PP_5490 | conserved protein of unknown function/site‑specific DNA recombinase | |||||
GCCATTCGATCCGCTAGAGCTGGATGAGGATCAGCTGCGGATTGCGGTCGCAGTTAGTTTCAATGAGTTTGAAGTATTTGATGAGCCGCGGCTGTCGCTCGCCTTGAGTGAGTTGCTTGAGTGCCTGAATATCACTACTGACTACACCTACAAATTCAATTGATCAAAATTGGGTAAGCGGTACGTCAGGTTGTATGTTTACAAACTGTCGCATAAGTCTTAAGTTATGCGACAGCCCGATCTCTCGTGATTTTGCTGGGTTCGGGTTGTCGCATAAGTTTGTCGCAAATGGTGGTATGCTTAAAAGAATAAACGCGACACAAAAGGCACAGGATTATGAATATTGGATATGCGAGAGTATCGACCTCCGGACAGGACTTGGAGTTACAACGTCAGCTATTGACGCAGTCAGGATGCGCGAGGATTTTTGAGGAGAAAATTAGCGGCGCGAAAAT > AE015451/2183607‑2184061 | gCCATTCGATCCGCTAGAGCTGGATGAGGATCAGCTGCGGATTGCGGTCGCAGTTAGTTTCAATGAGTTTGAAGTATTTGATGAGCCGCGGCTGTCGCTCGCCTTGAGTGAGTTGCTTGAGTGCCTGAATATCACTACTGACTACACCTACAAATTCAATTGATCAAAATTGGGTAAGCGGTACGTCAGGTTGTATGTTTACAAACTGTCGCATAAGTCTTAAGttatgcgac < 2:864061‑M2/233‑10 (MQ=255)gCCATTCGATCCGCTAGAGCTGGATGAGGATCAGCTGCGGATTGCGGTCGCAGTTAGTTTCAATGAGTTTGAAGTATTTGATGAGCCGCGGCTGTCGCTCGCCTTGAGTGAGTTGCTTGAGTGCCTGAATATCACTACTGACTACACCTACAAATTCAATTGATCAAAATTGGGTAAGCGGTACGTCAGGTTGTATGTTTACAAACTGTCGCATAAGTCTTAAGTTATGCGACAGc > 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aTTCGATCCGCTAGAGCTGGATGAGGATCAGCTGCGGATTGCGGTCGCAGTTAGTTTCAATGAGTTTGAAGTATTTGATGAGCCGCGGCTGTCGCTCGCCTTGAGTGAGTTGCTTGAGTGCCTGAATATCACTACTGACTACACCTACAAATTCAATTGATCAAAATTGGGTAAGCGGTACGTCCGGTTGTATGTTTACAAACTGTCGCATAAGTCTTAAGttatgcga < 2:84277‑M2/229‑9 (MQ=255) aTTCGATCCGCTAGAGCTGGATGAGGATCAGCTGCGGATTGCGGTCGCAGTTAGTTTCAATGAGTTTGAAGTATTTGATGAGCCGCGGCTGTCGCTCGCCTTGAGTGAGTTGCTTGAGTGCCTGAATATCACTACTGACTACACCTACAAATTCAATTGATCAAAATTGGGTAAGCGGTACGTCAGGTTGTATGTTTACAAACTGTCGCATAAGTCTTAAGttatgcgaca < 1:1121354‑M2/231‑11 (MQ=255) aTTCGATCCGCTAGAGCTGGATGAGGATCAGCTGCGGATTGCGGTCGCAGTTAGTTTCAATGAGTTTGAAGTATTTGATGAGCCGCGGCTGTCGCTCGCCTTGAGTGAGTTGCTTGAGTGCCTGAATATCACTACTGACTACACCTACAAATTCAATTGATCAAAATTGGGTAAGCGGTACGTCAGGTTGTATGTTTACAAACTGTCGCATAAGTCTTAAGTTATGCGACAGccc > 1:365494/1‑235 (MQ=255) 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cAAAATTGGGTAAGCGGTACGTCAGGTTGTATGTTTACAAACTGTCGCATAAGTCTTAAGTTATGCGACAGCCCGATCTCTCGTGATTTTGCTGGGTTCGGGTTGTCGCATAAGTTTGTCGCAAATGGTGGTATGCTTAAAAGAATAAACGCGACACAAAAGGCACAGGATTATGAATATTGGATATGCGAGAGTATCGACCTCCGGACAGGACTTGGAGTTACAACGTCAGCTAt < 1:530648/236‑1 (MQ=255) aaaTTGGGTAAGCGGTACGTCAGGTTGTATGTTTACAAACTGTCGCATAAGTCTTAAGTTATGCGACAGCCCGATCTCTCGTGATTTTGCTGGGTTCGGGTTGTCGCATAAGTTTGTCGCAAATGGTGGTATGCTTAAAAGAATAAACGCGACACAAAAGGCACAGGATTATGAATATTGGATATGCGAGAGTATCGACCTCCGGACAGGACTTGGAGTTACAACGTCAGCTAt < 2:744959/234‑1 (MQ=255) aaTTGTGTAAGCGGTACGTCAGGTTGTATGTTTACAAACTGTCGCATAAGTCTTAAGTTATGCGACAGCCCGATCTCTCGTGATTTTGCTGGGTTCGGGTTGTCGCATAAGTTTGTCGCAAATGGTGGTATGCTTAAAAGAATAAACGCGACACAAAAGGc < 2:444272/161‑1 (MQ=255) aTTGGGTAAGCGGTACGTCAGGTTGTATGTTTACAAACTGTCGCATAAGTCTTAAGTTATGCGACAGCCCGATCTCTCGTGATTTTGCTGGGTTCGGGTTGTCGCATAAGTTTGTCGCAAATGGTGGTATGCTTAAAAGAATAAACGCGACACAAAAGGc < 2:628984/160‑1 (MQ=255) 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tATGTTTACAAACTGTCGCATAAGTCTTAAGTTATGCGACAGCCCGATCTCTCGTGATTTTGCTGGGTTCGGGTTGTCGCATAAGTTTGTCGCAAATGGTGGTATGCTTAAAAGAATAAACGCGACACAAAAGGCACAGGATTATGAATATTgg < 2:1220839/154‑1 (MQ=255) aTGTTTACAAACTGTCGCATAAGTCTTAAGTTATGCGACAGCCCGATCTCTCGTGATTTTGCTGGGTTCGGGTTGTCGCATAAGTTTGTCGCAAATGGTGGTATGCTTAAAAGAATAAACGCGACACAAAAGGCACAGGATTATGAATATTGGATATGCGAGAGTATCGACCTCCGGACa > 1:613654/1‑180 (MQ=255) cAAACTGTCGCATAAGTCTTAAGTTATGCGACAGCCCGATCTCTCGTGATTTTGCTGGGTTCGGGTTGTCGCATAAGTTTGTCGCAAATGGTGGTATGCTTAAAAGAATAAACGCGACACAAAAGGCACAGGATTATGAatat < 1:341191/143‑1 (MQ=255) aaaCTGTCGCATAAGTCTTAAGTTATGCGACAGCCCGATCTCTCGTGATTTTGCTGGGTTCGGGTTGTCGCATAAGTTTGTCGCAAATGGTGGTATGCTTAAAAGAATAAACGCGACACAAAAGGCACAGGATTATGAATATTGGATATGCGAGAGTATCGACCTCCGGACa > 1:794689/1‑172 (MQ=255) cATAAGTCTTAAGTTATGCGACAGCCCGATCTCTCGTGATTTTGCTGGGTTCGGGTTGTCGCATAAGTTTGTCGCAAATGGTGGTATGCTTAAAAGAATAAACGCGACACAAAAGGCACAGGATTATGAATATTGGATATGCGAGAGTATCGACCTCCGGACAGGACTTGGAGTTACAACGTCAGCTATTGACGCAGTCAGGATGCGCGAGGATTTTTGAGGAGAAAATTAgcggc > 1:929356/1‑236 (MQ=255) cATAAGTCTTAAGTTATGCGACAGCCCGATCTCTCGTGATTTTGCTGGGTTCGGGTTGTCGCATAAGTTTGTCGCAAATGGTGGTATGCTTAAAAGAATAAACGCGACACAAAAGGCACAGGATTATGAATATTGGATATGCGAGAGTATCGACCTCCGGACAGGACTTGGAGTTACAACGTCAGCTATTGACGCAGTCAGGATGCGCGAGGATTTTTGAGGAGAAAATTAgcggc > 1:880610/1‑236 (MQ=255) cATAAGTATAAAGTTATGCGACAGCCCGATCTCTCGTGATTTTGCTGGGATCGGGTTGTCGCATAAGTTTGTCGCAAATGGTGGTATGCTTAAAAGAATAAACGCGACAGAAAAGGTACAGGATTAGGAATAtt > 2:1270083/1‑134 (MQ=255) cTTAAGTTATGCGACAGCCCGATCTCTCGTGATTTTGCTGGGTTCGGGTTGTCGCAT‑AGTTTGTCGCAAATGGTGGTATGCTTAAAAGAATAAACGCGACACAAAAGGCACAGGATTATGAATATTGGATATGCGAGAGTATCGACCTCCGGACAGGACTTGGAGTTACAACGTCAGCTATTGACGCAGTCAGGATGCGCGAGGATTTTTGAGGAGAAAATTAGCGGCGCGAAAAt < 1:84279/236‑1 (MQ=255) tAAGTTATGCGACAGCCCGATCTCTCGTGATTTTGCTGGGTTCGGGTTGTCGCATAAGTTTGTCGCAAATGGTGGTATGCTTAAAAGAATAAACGCGACACAAAAGGCACAGGATTATGAATATTGGATATGCGAGAGt < 2:1287491/139‑1 (MQ=255) tAAGTTATGCGACAGCCCGATCTCTCGTGATTTTGCTGGGTTACGGTTCTCGCATAAGTTTGTCGCAAATGGTGGTATGCTTAAAAGAATAAACGCGACACACAAGCCACAGGATTATGAATCTTGGATATGAGAGAGt < 2:654203/139‑1 (MQ=255) | GCCATTCGATCCGCTAGAGCTGGATGAGGATCAGCTGCGGATTGCGGTCGCAGTTAGTTTCAATGAGTTTGAAGTATTTGATGAGCCGCGGCTGTCGCTCGCCTTGAGTGAGTTGCTTGAGTGCCTGAATATCACTACTGACTACACCTACAAATTCAATTGATCAAAATTGGGTAAGCGGTACGTCAGGTTGTATGTTTACAAACTGTCGCATAAGTCTTAAGTTATGCGACAGCCCGATCTCTCGTGATTTTGCTGGGTTCGGGTTGTCGCATAAGTTTGTCGCAAATGGTGGTATGCTTAAAAGAATAAACGCGACACAAAAGGCACAGGATTATGAATATTGGATATGCGAGAGTATCGACCTCCGGACAGGACTTGGAGTTACAACGTCAGCTATTGACGCAGTCAGGATGCGCGAGGATTTTTGAGGAGAAAATTAGCGGCGCGAAAAT > AE015451/2183607‑2184061 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |