New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 2524241 = | 39 (0.950) | 3 (0.080) | 3/318 | NT | 8.1% | coding (963/1686 nt) | PP_2213 | putative acyl‑CoA synthetase |
? | AE015451 | 2524282 = | 31 (0.800) | coding (1004/1686 nt) | PP_2213 | putative acyl‑CoA synthetase |
CCGGTCCGTTGTCGCTGGGGCACGCCACCACGTTCTACGATGGCCCGTTCAGTGTCGAGAGCTGCGCCCGGGTGATCGACAAGCTGGGTATCACCAACCTGGCCGGCTCGCCCACCGCGTATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGG > AE015451/2524048‑2524504 | ccGGTCCGTTGTCGCTGGGGCACGCCACCACGTTCTACGATGGCCCGTTCAGTGTCGAGAGCTGCGCCCGGGTGATCGACAAGCTGGGTATCACCAACCTGGCCGGCTCGCCCACCGCGTATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCcgac < 1:256023/236‑1 (MQ=255) cGCCACCACGTTCTACGATGGCCCGTTCAGTGTCGAGAGCTGCGCCCGGGTGATCGACAAGCTGGGTATCACCAACCTGGCCGGCTCGCCCACCGCGTATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCa < 1:278529/234‑1 (MQ=255) cGCCACCACGTTCTACGATGGCCCGTTCAGTGTCGAGAGCTGCGCCCGGGTGATCGACAAGCTGGGTATCACCAACCTGGCCGGCTCGCCCACCGCGTATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCa < 2:271301/234‑1 (MQ=255) caccacGTTCTACGATGGCCCGTTCAGTGTCGAGAGCTGCGCCCGGGTGATCGACAAGCTGGGTATCACCAACCTGGCCGGCTCGCCCACCGCGTATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGAt > 1:589374/1‑235 (MQ=255) gTTCAGTGTCGAGAGCTGCGCCCGGGTGATCGACAAGCTGGGTATCACCAACCTGGCCGGCTCGCCCACCGCGTATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTgg < 1:62131/236‑1 (MQ=255) cgcCCGGGTGATCGACAAGCTGGGTATCACCAACCTGGCCGGCTCGCCCACCGCGTATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTgg < 1:15973/218‑1 (MQ=255) gcCCGGGTGATCGACAAGCTGGGTATCACCAACCTGGCCGGCTCGCCCACCGCGTATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGc > 1:264070/1‑180 (MQ=255) gcCCGGGTGATCGACAAGCTGGGTATCACCAACCTGGCCGGCTCGCCCACCGCGTATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAacc < 1:384866/235‑1 (MQ=255) aaGCTGGGTATCACCAACCTGGCCGGCTCGCCCACCGCGTATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTgcagc < 1:618777/235‑1 (MQ=255) gcatagccggcagaacccaggtgcaccggatgctgcaggccatggtggttgcacagcaccatgcccagttcggtctggccgtagtgatcgtcaatggtcacgcccagctcgtcggcgaaccagcggatcacttcggggttcagcggttcgccgACGAGCTGGGCGTGACCa < 2:507977‑M2/18‑1 (MQ=255) cAACCTGCCCGGCTCTGTCACCGCGTATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGATCCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTgg < 1:721067/236‑1 (MQ=255) aCCTGGCCGGCTCGCCCACCGCGTATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCcggcg > 2:570949/1‑141 (MQ=255) cGGCTCGCCCACCGCGTATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCg > 1:319420/1‑236 (MQ=255) cGGCTCGCCCACCGCGTATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCCGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGcc < 1:666362/235‑1 (MQ=255) ggCTCGCCCACCGCGTATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGaa > 2:291784/1‑155 (MQ=255) gCCCACCGCGTATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATgggg > 2:272228/1‑179 (MQ=255) cgTATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGt < 1:203785/130‑1 (MQ=255) tATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCgg > 1:633532/1‑236 (MQ=255) gCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCa > 1:299867/1‑231 (MQ=255) cTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCAt > 1:330255/1‑236 (MQ=255) cTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGGTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCAt > 1:392259/1‑236 (MQ=255) aaaGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGAc < 2:330254/234‑1 (MQ=255) cgATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGAc < 1:249544/231‑1 (MQ=255) cGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGa > 2:733426/1‑223 (MQ=255) cACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTa < 1:80765/231‑1 (MQ=255) aaGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGAc > 2:736491/1‑213 (MQ=255) aaGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGAc < 1:736492/213‑1 (MQ=255) ccTGCGGGTGGTCAGCAGGGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCAGTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGtt < 2:112275/161‑1 (MQ=255) ggcgggcggTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATc < 2:72057/175‑1 (MQ=255) tggtcacgcccagctcgtCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTGACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGc < 2:507977‑M1/153‑1 (MQ=255) agcagTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCa < 2:603878/178‑1 (MQ=255) agcagTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGc < 1:224901/236‑1 (MQ=255) CGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGc > 2:326068‑M1/1‑234 (MQ=255) gcggatcacttcggggttcagcggttcgccgACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGcc > 2:320293‑M2/32‑67 (MQ=255) gcggatcacttcggggttcagcggttcgccgACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGcc < 1:320294‑M2/36‑1 (MQ=255) tGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTcg < 1:157664/236‑1 (MQ=255) aGTGATCCGCGGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTcg < 1:319911/226‑1 (MQ=255) gATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCa < 1:507978/141‑1 (MQ=255) cGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTcgg < 1:611187/236‑1 (MQ=255) cgACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCgtggtgg < 2:571359‑M2/138‑1 (MQ=255) acgaGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGAc < 1:628792/143‑1 (MQ=255) acgaGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTcg < 1:321449/206‑1 (MQ=255) acgaGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTcg > 2:321448/1‑206 (MQ=255) | CCGGTCCGTTGTCGCTGGGGCACGCCACCACGTTCTACGATGGCCCGTTCAGTGTCGAGAGCTGCGCCCGGGTGATCGACAAGCTGGGTATCACCAACCTGGCCGGCTCGCCCACCGCGTATCGCTTGCTGATTGCGGCGGGCAAAGATTTCTCGGCACCGATCAAGGGCCGCCTGCGGGTGGTCAGCAGTGCCGGCGAACCGCTGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGG > AE015451/2524048‑2524504 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |